数据集概述
本数据集包含2093头猪的60K全基因组SNP数据，覆盖亚洲、欧洲、美洲、大洋洲和非洲的122个地方及商业品种（1839头家猪）、215头野猪和39头外群猪科动物，用于研究家猪驯化的全球模式、遗传多样性及人口迁移、选择相关机制。
文件详解
- 文件名称：Description_data_GSE_Global_pigs.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：推测包含数据集背景、样本信息、研究设计等描述性数据，支撑基因组SNP数据的解读
- 文件名称：GSE_global_pigs.map.zip
- 文件格式：ZIP（压缩包）
- 字段映射介绍：推测包含SNP位点的染色体位置、物理坐标等图谱信息，用于定位SNP在基因组中的位置
- 文件名称：GSE_global_pigs.ped.zip
- 文件格式：ZIP（压缩包）
- 字段映射介绍：推测包含样本的基因型数据，记录每个样本在各SNP位点的等位基因信息，是分析遗传多样性、群体结构的核心数据
数据来源
论文“Genome-wide SNP data unveils the globalization of domesticated pigs”
适用场景
- 家猪驯化历史研究: 分析欧亚大陆独立驯化中心的遗传分化，追溯家猪全球扩散路径
- 遗传多样性评估: 比较不同品种（地方、商业、野猪）的近交水平（ROH）及遗传多样性差异
- 人工选择信号分析: 挖掘与肌肉发育、繁殖、能量代谢等性状相关的候选基因，解析驯化选择机制
- 农业生物多样性保护: 基于全球遗传多样性统计，为地方猪种的遗传资源保护提供数据支撑
- 跨区域基因交流研究: 探究历史上（如18-19世纪中国猪引入英国）及现代（中国引入西方品种改良）的基因渐渗事件
