-
GSE94242_GSE107078_Based_MYB肽模拟物阻断急性髓系白血病测序分析补充数据
数据集概述 本数据集为论文“Peptidomimetic blockade of MYB in acute myeloid leukemia”的补充数据，包含三组测序数据分析结果，原始数据存储于GEO数据库（登录号GSE94242、GSE107078），涉及RNA-seq、ChIP-seq及H3K27Ac ChIP-...
-
Differential_Expression_Based_群体水平RNA_seq分析方法评估数据集
数据集概述 本数据集包含复现群体水平RNA-seq差异表达分析方法评估结果所需的R代码和数据，对应针对Genome Biology 2022年论文的相关通信研究，聚焦半合成RNA-seq数据模拟中标准化影响的分析，涉及FDR和Power结果的复现。 文件详解...
-
Roie_Dvir_Thesis_Based_抑郁症RNA_seq数据解卷积与细胞类型特异性特征分析数据
数据集概述 本数据集为Roie Dvir论文配套的在线表格，包含抑郁症相关的RNA-seq数据分析结果。通过解卷积批量RNA-seq数据，识别抑郁症状态、年龄、CRP水平等变量相关的显著基因，以及CD4+T细胞、NK细胞等细胞类型特异性的差异表达基因，共7个文件。 文件详解 全样本差异表达分析文件 文件名称：sig genes DEA thesis...
-
Cactophilic_Drosophila_Genomes_Based_嗜仙人掌果蝇物种基因组及注释数据
数据集概述 本数据集包含嗜仙人掌果蝇物种的基因组序列、基因注释、转座元件（TE）注释及质量控制数据，用于支持“转座元件促进嗜仙人掌果蝇宿主转移相关基因进化”的研究。数据集涵盖多种果蝇物种的基因组组装、注释文件及测序质量控制文件，共27个文件，是研究果蝇基因组进化与功能的基础数据资源。 文件详解 基因组组装文件...
-
FUS_R244RR_ALS_Based_iPSC模型神经肌肉功能障碍RNAseq与MassSpec分析数据
数据集概述 本数据集包含针对患者来源的FUS-R244RR-ALS iPSC模型神经肌肉功能障碍研究的RNAseq和MassSpec数据分析脚本及中间结果文件，对应论文中多个关键图表的生成数据，共包含3个文件。 文件详解 README.md 文件格式：.md 内容介绍：说明数据集包含的分析脚本对应的论文图表（Figure 1 D,E、Figure 2...
-
BAM_Files_Human_RNA_seq_WES_Visualization_Practice_Data
数据集概述 本数据集包含两组人类小BAM文件，分别用于RNA-seq和全外显子测序（WES）可视化教学练习。RNA-seq数据来自上皮间质转化细胞系的0天（未诱导）和7天（诱导后）样本，WES数据来自非小细胞肺癌患者的肿瘤和血液组织样本，所有数据均从开放获取的SRA数据集处理而来。 文件详解 RNA-EMT.zip 文件格式：ZIP...
-
陆地棉双向最佳比对与OMA同源基因比较数据集
数据集概述 本数据集为论文“Homoeolog inference methods requiring bidirectional best hits or synteny miss many pairs”的配套数据，包含陆地棉（Gossypium...
-
nanoCAM_Gene_Based_基因表达与增强子调控完整数据
数据集概述 本数据集包含GM12878和K562细胞系的基因相关数据，涵盖样本基础信息、GpC可及性峰位置、多向增强子统计、基因位点与表达量化整合数据及差异表达基因列表，为基因相关研究提供支持。 文件详解 supplementarytable1_datasets_stat.xlsx：Excel格式，包含GM12878和K562细胞系重复样本的基础信息...
-
流感疫苗反应预测的转录组原始计数数据集
数据集概述 本数据集包含2017-2018年冈比亚儿童流感疫苗接种前（第0天）的鼻拭子和全血样本转录组数据（RNA-seq），用于支持免疫预测框架immunaut的开发，为疫苗反应预测提供基础转录组学数据支持。 文件详解 该数据集以压缩包形式提供，包含以下内容： - 文件名称: transcriptome_data.zip - 文件格式: ZIP压缩包...
-
拟除虫菊酯杀虫剂溴氰菊酯对胃肠道神经肽及单胺信号通路影响源数据与实验方案2025
数据集概述 本数据集为White等人2025年关于溴氰菊酯对胃肠道神经肽及单胺信号通路影响研究的配套数据，包含实验源数据、统计结果、qPCR分析数据、RNAseq相关方案及通路分析文件，支持论文图表生成与结果验证。 文件详解 数据统计与图表源文件：...
-
IF1Ty_IF1KO_IF1Over弓形虫株RNAseq分析脚本数据集
数据集概述 本数据集包含用于IF1Ty、IF1KO和IF1Over三种弓形虫株RNAseq分析的脚本、NGS文库质量控制文档及参考基因组文件，支持基因表达分析流程的复现与验证。 文件详解 文件名称: ToxoDB-65_TgondiiME49_Genome.fasta，文件格式: FASTA，内容: 弓形虫ME49株v65版本参考基因组序列 文件名称:...
-
环境富集对神经三维染色质互作组的年龄依赖性效应数据集
数据集概述 本数据集包含年轻与老年小鼠海马神经元经低输入启动子捕获Hi-C（liCHi-C）及RNA-seq处理后的相关数据，用于探究年龄及环境富集对染色质互作组组织与基因表达的影响，涉及13个处理后数据文件及附加文件。 文件详解 说明文档：...
-
临床与实验生物学转录组学研究补充数据集
数据集概述 本数据集是《Transcriptomics for clinical and experimental biology research: hang on a seq》论文的补充资料，包含生成论文图表的R脚本、源数据文件及额外图表，支持转录组学相关研究的复现与扩展分析。 文件详解 该数据集包含以下文件类型及内容： - 代码文件： -...
-
MUUMI多组学数据整合R包案例研究输入输出文件数据集
数据集概述 本数据集包含论文《MUUMI: an R package for statistical and network-based meta-analysis for MUlti-omics data Integration》中两个案例研究的输入与输出文件，支持复现研究结果，涉及特发性肺纤维化转录组数据及THP-1巨噬细胞多组学数据的整合分析。...
-
高社会性慈鲷鱼早期发育社会体验转录组特征数据集
数据集概述 本数据集聚焦高社会性慈鲷鱼（Neolamprologus pulcher）早期发育阶段的社会体验转录组特征，通过比较有无亲代抚育的幼鱼在不同发育时间点的脑基因表达差异，探究早期社会环境对神经基因组状态、压力调节及免疫功能的影响。 文件详解 文件名称:...
-
人类死后海马体_中额叶皮层和黑质的单核RNA测序数据集
数据集概述 本数据集包含人类帕金森病（PD）患者及健康对照者死后海马体、中额叶皮层和黑质三个脑区的单核RNA测序数据。所有脑区样本均来自同一捐赠者，支持同一大脑内不同解剖与功能区域转录组特征的直接比较。 文件详解 文件名称: lee-pmdbs-sn-rnaseq_README.pdf 文件格式: PDF 文件内容:...
-
心肌缺血再灌注微血管损伤自噬相关生物标志物研究原始数据集
数据集概述 本数据集是研究“机器学习与实验验证揭示心肌缺血再灌注微血管损伤自噬相关生物标志物”的综合支撑数据，包含基于RNA-seq的生物信息学分析数据及心肌缺血再灌注损伤机制的实验验证数据。 文件详解 文件名称：original data.zip 文件格式：ZIP压缩包 内容说明：压缩包内包含两类核心数据，一是基于RNA-...
-
沙门氏菌yqiC基因与全局转录组补充信息数据集
数据集概述 本数据集为研究论文《定殖相关基因yqiC对鼠伤寒沙门氏菌全局转录组、细胞呼吸及氧化应激的影响》的补充信息，包含22个附加文件，涵盖表格、图表及序列比对文档，支持论文核心结论的验证与拓展分析。 文件详解 表格文件（XLSX格式，共7个）： Table S3. RNA-seq of 117 up & 291 down...
-
社会性膜翅目昆虫印记基因识别方法数据集
数据集概述 本数据集围绕社会性膜翅目昆虫印记基因识别方法展开，包含RNA-seq数据分析流程、数字 droplet PCR验证结果及相关图表文件，为研究昆虫基因组印记提供数据支持，适用于昆虫分子生物学及基因组学分析。 文件详解 数据文件（CSV格式）： ASE_data_frame.csv：包含基因座、参考序列、...
-
群体水平RNA_seq数据差异表达分析的处理数据集与代码
数据集概述 该数据集包含复现两篇学术成果所需的代码与数据：一是针对两篇通信文章的回复研究（DOI:10.1186/s13059-024-03232-8），二是原始发表论文《人类群体样本分析中主流差异表达方法的假阳性夸大》（DOI:10.1186/s13059-022-02648-4）的结果及拟合优度检验资源，通过README文件提供复现指引。 文件详解...
