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IQ2MC系统发育时间树推断框架原始数据集
数据集概述 本数据集为论文“IQ2MC: A New Framework to Infer Phylogenetic Time Trees Using IQ-TREE 3 and MCMCTree with Mixture Models”的原始数据，包含实证数据、分析脚本及模拟数据，用于支持基于混合模型的系统发育时间树推断研究。 文件详解...
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西非鹅膏属新物种系统发育分析分区方案与模型数据表
数据集概述 本数据集是关于西非鹅膏属（Amanita）新物种系统发育分析的核心表格数据，记录了由PartitionFinder工具筛选出的最优基因分区方案及对应进化模型，为该新物种的分类学研究提供分子数据支持。 文件详解 文件名称: table.html 文件格式: HTML (.html) 内容说明:...
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RAiSD_AI_Based_100次模拟测试数据完整数据集
数据集概述 该数据集包含用于评估RAiSD-AI检测性能的模拟测试数据，共包含一百次模拟结果。数据通过不同命令行生成，涵盖中性和选择扫描两种类型的模拟场景，为检验RAiSD-AI工具的准确性提供基础数据。 文件详解 数据集包含一个压缩文件，具体说明如下： - 文件名称: RAiSD-AI_testDatasets100sims.zip - 文件格式:...
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鸟类辐射进化基因组位点系统发育研究数据集
数据集概述 本数据集围绕雀形目柳莺属8种鸟类的基因组系统发育研究展开，包含基因流对系统发育重建影响的分析数据，涵盖模拟输入、重组率估计、系统发育网络等多类型文件，为探究基因组数据与物种真实进化关系的差异提供支持。 文件详解 群体遗传学模拟输入文件：...
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三刺鱼热生理学进化与气候变化下分布范围预测数据集
数据集概述 本数据集围绕三刺鱼热生理学进化对气候变化下分布范围预测的影响展开，包含热生理与行为性状的遗传基础数据，以及结合不同进化模型（无进化、观察进化速率、QTL解释方差缩放进化速率）的分布范围预测结果，用于验证进化对物种分布模型精度的提升作用。 文件详解 文件名称: dryad_readme.pdf，文件格式: PDF，内容:...
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生物活性肽在白蛋白前体中的进化起源研究数据集
数据集概述 本数据集围绕普通向日葵（Helianthus annuus）PawS1基因的进化展开，探究其如何从简单白蛋白前体逐步获得编码SFTI-1（一种具有蛋白酶抑制功能的环肽）的能力，为理解蛋白质从头进化机制提供数据支持。 文件详解 文件名称：tpc123620_README.pdf 文件格式：PDF...
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莫尔莫皮蝙蝠多样化地理研究表4_分子进化模型参数数据集
数据集概述 该数据集包含《莫尔莫皮蝙蝠（翼手目：莫尔莫皮科）多样化地理研究》中的表4内容，记录了不同分子数据集（mtrDNA、cyt b、Rag 2等）的最大似然（ML）和贝叶斯（Bayes）分子进化模型参数，包括速率矩阵、形状参数等。 文件详解 文件名称: table.html 文件格式: HTML (.html) 字段映射: 表格包含以下核心字段...
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主要为二倍体生物的单倍体选择进化数据集
数据集概述 该数据集围绕主要为二倍体生物的单倍体选择进化展开，分析二倍体生物对配子单倍体选择强度的调控机制，探讨母本与父本在单倍体选择程度上的冲突及其对后代适合度的影响。 文件详解 MaintenanceOfGametophyticSelection2015.pdf：PDF格式文档，可能包含该研究的详细内容，如研究背景、模型分析、结果讨论等。...
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雁形目鸟类食草性演化与体重相关性研究数据集
数据集概述 本数据集围绕雁形目鸟类（含鸭、鹅、天鹅等）食草性演化展开，整合200余项已发表食性研究数据，通过性状演化模型分析食草性独立转变次数及与体重的相关性，为理解飞行鸟类食草性起源提供数据支持。 文件详解 附录文件： Appendix S1.xls：XLS格式文件，可能包含食草性连续性状数据或原始食性研究文献汇总 Appendix...
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进化参数推断的模糊编码方法研究数据集
数据集概述 本数据集聚焦于蛋白质进化历史的研究，探讨如何通过模糊编码处理缺失数据，从低分辨率序列（如氨基酸序列）中准确推断进化参数（如选择强度ω、祖先侧链构型），并验证该方法在模拟与实证数据中的有效性。 文件详解 文件名称：Ambiguity_SYSBIO_suppmat.pdf 文件格式：PDF（.pdf）...
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安第斯山脉以东须颊吸口鲶系统发育修订研究表2数据集
数据集概述 本数据集为一篇关于安第斯山脉以东须颊吸口鲶（吸口鲶科：Lasiancistrus属）系统发育修订研究的表格数据，内容是通过PartitionFinder分析得到的按基因和密码子位置划分的进化模型信息。 文件详解 文件名称: table.html 文件格式: HTML (.html) 文件内容:...
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北美蝉类辐射演化系统发育矩阵分区方案表
数据集概述 该数据集为表格式文件，呈现了通过PartitionFinder 2分析得到的北美蝉类辐射演化系统发育矩阵分区方案。内容涵盖基于nDNA、mtDNA及串联矩阵的三类分析，明确了不同基因区域对应的进化模型，为蝉类系统发育研究提供标准化的矩阵分区参考。 文件详解 文件名称: table.html 文件格式: HTML (.html) 文件内容:...
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亚洲食螺蛇属分类修订研究数据表1
数据集概述 该数据集为《亚洲食螺蛇属分类修订研究》中的表1数据，基于形态学比较和分子系统发育证据，包含PARTITIONFINDER 2.1.1软件在AIC标准下建议的最佳基因分区方案及对应模型。 文件详解 文件名称: table.html 文件格式: HTML (.html) 内容字段: 包含基因分区（如cyt...
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比较分析主成分可能产生误导的数据
数据集概述 本数据集包含关于主成分分析（PCA）在系统发育结构化数据中应用局限性的研究数据。研究指出标准PCA和系统发育PCA（pPCA）在特定进化模型下可能导致错误推断，强调需采用真正的多变量系统发育比较方法。 文件详解 文件名称: suppmat-phylopca.pdf 文件格式: PDF 文件内容:...
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染色体数目进化的分支发生与渐进发生模型数据集
数据集概述 该数据集围绕染色体数目进化的分支发生与渐进发生模型展开，包含相关模型实现、说明文档及补充材料。通过新模型ChromoSSE整合两种进化模式，可推断进化模式、定位染色体物种形成事件，为研究染色体变化在进化中的作用提供支持。 文件详解 文件名称:...
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进化轨迹模拟结果数据集
数据集概述 该数据集包含用于生成相关研究中图表3至7的模拟进化轨迹数据，核心字段涉及种群规模、系统发育深度和速率变异等关键参数，为研究进化过程的量化分析提供数据支持。 文件详解 该数据集包含一个压缩文件，具体说明如下： - 文件名称: data.zip - 文件格式: ZIP压缩包 (.zip) - 核心字段（根据描述）: - Population...
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数据68样本数据集BEAST分析的序列进化分区与模型
数据集概述 该数据集记录了用于68样本数据集BEAST分析的序列进化分区与模型信息，包含不同基因片段的密码子位置（1st、2nd、3rd）对应的进化模型设置，为系统发育分析提供参数参考。 文件详解 文件名称: table.html 文件格式: HTML (.html) 内容说明:...
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新西兰网地藻目新属Lindauera研究中的序列进化分区与模型数据表
数据集概述 本数据集为研究论文中的表格数据，记录了新西兰网地藻目新属Lindauera分类学研究中，用于串联分析的序列进化分区方案及对应的IQ-tree和MrBAYES模型参数，支持分子系统发育分析。 文件详解 文件名称: table.html 文件格式: HTML (.html) 内容说明:...
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树_分支与性状间进化速率比较数据集
数据集概述 本数据集围绕表型进化速率比较展开，包含基于似然法的进化速率比较方法研究数据，涉及不同树、分支及性状间的进化速率分析，支持对宏观进化时间动态的研究。 文件详解 数据文件: iguanids.csv:...
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蛋白质进化分支异质性模型与祖先序列推断数据集
数据集概述 本数据集包含一项关于蛋白质进化分支异质性模型的研究补充材料，旨在解决传统模型假设进化过程同质化的局限，提出新模型以更准确捕捉序列进化复杂度，支持祖先氨基酸序列的高效推断与重建。 文件详解 数据集包含一个PDF格式的文档文件，具体如下： - 文件名称: Groussin_COaLA_SuppMat.pdf - 文件格式: PDF (.pdf)...
