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UBTR012574化学系列扩展数据集
数据集概述 该数据集围绕UBTR012574化学系列扩展展开，通过对接Enamine REAL数据库和SciFinder中的类似物化合物与USP5锌指泛素结合域，优先排序化合物，并使用表面等离子共振测定结合效力。 文件详解 分子结构与对接文件：...
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人参皂苷G_Rg1的C_20葡萄糖基分子模拟数据集
数据集概述 本数据集包含针对人参皂苷G-Rg1的C-20葡萄糖基的分子对接与分子动力学模拟数据，围绕野生型及工程化DUase β-葡萄糖苷酶与底物的结合动态及构象变化展开，覆盖50纳秒模拟过程的关键时间点数据。 文件详解 文件名称：Simulation files-C20.zip 文件格式：ZIP压缩包（.zip） 压缩包内包含两个主文件夹：...
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TernaryDB三元复合物数据集
数据集概述 该数据集是从蛋白质数据银行（PDB）中筛选出的22,303个三元复合物综合数据集，用于支持基于深度学习的靶向蛋白降解（TPD）复合物结构预测研究。 文件详解 文件名称: TernaryDB.zip 文件格式: ZIP压缩包 内容说明:...
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纤维素活性AA10多糖单加氧酶氧化酶活性机制相关PDB结构数据集
数据集概述 本数据集包含论文《纤维素活性AA10多糖单加氧酶氧化酶活性机制》相关的PDB格式结构文件，主要为QM/MM优化后的所有中间体及过渡态结构，涵盖QM区域与完整酶结构。 文件详解 文件名称: pdbs.zip 文件格式: .zip（压缩包） 内容说明:...
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番茄NRC分支辅助NLR免疫蛋白自活性在本氏烟prf突变体中无变化补充数据集
数据集概述 本数据集为研究番茄NRC分支辅助NLR免疫蛋白自活性在本氏烟prf突变体中变化的补充数据，包含系统发育分析、载体图谱、测序原始数据、细胞死亡量化数据及蛋白结构文件等5个补充数据集，以压缩包形式存储。 文件详解 Supplementary Dataset 1.zip：压缩文件，包含Prf分支的系统发育分析数据 Supplementary...
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Alpha_synuclein_ColabFold_Based_α_突触核蛋白结构建模完整数据
数据集概述 本数据集包含通过ColabFold工具对野生型人类α-突触核蛋白（alpha-synuclein）及其Ser129Asp突变体进行结构建模的结果，涵盖蛋白质结构模型文件、建模日志、参考文献、预测精度评估图表等多种类型文件，为研究该蛋白质野生型与突变体的结构差异提供数据支持。 文件详解 该数据集包含多种类型的文件，具体说明如下： -...
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BAZ2B与Zenobia片段库筛选的PanDDA分析交互式摘要数据集
数据集概述 本数据集为BAZ2B蛋白与Zenobia片段库筛选的PanDDA分析结果，提供交互式摘要页面。包含结构数据文件、图像文件、网页文件及相关脚本，支持对分子筛选结果的可视化与交互分析。 文件详解 交互式网页文件： 0_index.html：HTML格式，为数据集的交互式摘要入口页面，可点击访问完整分析内容...
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植物RNA聚合酶II大亚基基因G_四链体补充材料数据集
数据集概述 本数据集为期刊文章的补充材料，围绕植物RNA聚合酶II大亚基（RPB1）基因中的G-四链体（G4）展开，包含序列分析、结构预测、实验验证等多维度数据，支持对该保守元件功能与进化的研究。 文件详解 Supplementary material S1_G4-forming sequences and...
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CART_Modeling_Based_生物大分子结构CART模型可视化完整数据
数据集概述 本数据集为CART建模相关的文件存储库，包含ICN3D图像文件及模型结构文件，支持模型可视化与结构分析，提供两种不同格式的文件资源。 文件详解 文件名称: ranked_0.pdb 文件格式: PDB (.pdb) 内容说明: 可能为模型的三维结构文件，用于存储生物大分子或分子模型的结构信息 文件名称:...
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蛋白质_蛋白质对接用于PROTAC发现数据集
数据集概述 该数据集围绕基于结构的PROTAC设计展开，聚焦于评估蛋白质-蛋白质对接工具对E3连接酶与靶蛋白结合界面的预测准确性，涉及BRD4BD1-CRBN、BRD4BD2-VHL等复合物及HADDOCK、Rosetta、ICM三种对接工具。 文件详解 文件名称: Zenodo_Final.pdf 文件格式: PDF (.pdf) 文件内容:...
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CovDocker共价药物设计基准数据集
数据集概述 该数据集是论文《CovDocker: Benchmarking Covalent Drug Design with Tasks, Datasets, and Solutions》的预处理数据，包含共价药物设计相关的蛋白质、配体结构文件及深度学习模型用LMDB文件，支持共价对接相关的三个任务研究。 文件详解 核心目录结构:...
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USP5锌指泛素结合域与化合物XSR00035795a共晶结构及选择性测试数据集
数据集概述 该数据集包含USP5锌指泛素结合域（Zf-UBD）与化合物XSR00035795a的共晶结构数据，以及通过表面等离子体共振实验测试化合物选择性的相关文件，用于分析配体与结合口袋的相互作用及甲基基团对USP5/HDAC6选择性的影响。 文件详解 XSR00035795a.mtz: MTZ格式文件，可能为晶体学数据文件，存储衍射数据相关信息...
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高地色素马铃薯抗炎作用分子对接支持数据集2025
数据集概述 该数据集是论文《高地色素马铃薯对LPS诱导的THP-1巨噬细胞炎症的预防作用》的配套分子对接数据，包含不同配体（CGA、lig、Pg3G、Pn3G）与转运蛋白（GLUT1、GLUT3、SGLT1）的对接构象及得分，支持研究色素马铃薯成分的抗炎机制。 文件详解 数据集包含一个压缩文件，内部按配体-蛋白组合分类存储分子对接数据，具体如下： -...
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ACVR1_ALK2与M4K2009结合晶体结构沉积数据集
数据集概述 该数据集包含ACVR1/ALK2蛋白与化合物M4K2009结合的晶体结构沉积数据，涵盖结构解析相关的原始数据、处理文件及报告文档，为研究该蛋白与小分子的相互作用提供结构生物学数据支持。 文件详解 结构数据文件： ACVR1A_M4K2009_free.mtz：MTZ格式文件，可能为ACVR1A与M4K2009结合的自由状态衍射数据文件...
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甲基转移酶复合物R_M2_S全长与R_M2_S2截断预测结构数据集
数据集概述 该数据集包含甲基转移酶复合物R-M2-Sfull-length和R-M2-S2cut的预测结构数据，以蛋白质数据库文件和图片文件形式呈现，为研究甲基转移酶复合物的结构特征提供支持。 文件详解 蛋白质数据库文件（PDB格式）： fold_dna_26x2_new_r_m2_fl_s_model_0.pdb：R-M2-Sfull-...
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SP100蛋白与Maybridge片段库筛选的PanDDA分析数据集
数据集概述 本数据集包含SP100蛋白与Maybridge片段库筛选的PanDDA分析结果，提供交互式摘要页面及相关结构数据文件，支持对蛋白-片段结合事件的可视化与分析。 文件详解 交互式摘要文件： 0_index.html：HTML格式，为分析结果的交互式摘要页面入口，需通过文件部分点击打开 结构数据文件：...
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丙酮丁醇梭菌钨依赖性醛_铁氧还蛋白氧化还原酶配体对接数据集
数据集概述 该数据集包含丙酮丁醇梭菌钨依赖性醛：铁氧还蛋白氧化还原酶结构中的配体对接数据，通过Caver Web工具完成。数据涵盖多种配体（如乙酸、甲醛等）在不同隧道的对接结果，以PDBQT、PDB和PDF格式存储，为酶结构与配体相互作用研究提供支持。 文件详解 配体对接结果文件（PDBQT格式，16个）：...
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PORCN分子结构模型数据集
数据集概述 本数据集提供PORCN（Porcupine）的分子结构模型相关文件，PORCN是Wnt信号通路关键酶，其结构模型有助于理解底物识别、催化机制及药物抑制原理，支持癌症治疗等研究。 文件详解 Readme.pdf：PDF格式文档，可能包含数据集背景、文件说明、使用方法等补充信息。...
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人源FBP21串联WW结构域与SmB_B_核心剪接蛋白富含脯氨酸配体的模拟复杂结构数据集
数据集概述 本数据集提供人源formin结合蛋白21（h-FBP21）串联WW结构域与天然结合伴侣SmB/B'核心剪接蛋白中富含脯氨酸序列形成的两种模拟复杂结构，包含平行和反平行结合取向及不同WW结构域相对定位。 文件详解 该数据集包含10个文件，具体说明如下： - 说明文档: - README: 无格式文件，提供数据集文件的详细说明。 - 结构文件...
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重组冠状病毒引起的猫传染性腹膜炎流行数据集
数据集概述 本数据集围绕重组冠状病毒引发的猫传染性腹膜炎流行展开，包含蛋白质结构预测、病例数据及病毒基因序列比对等相关文件，为研究该传染病的分子特征与流行情况提供数据支持。 文件详解 Protein structure predictions pdb files.zip: ZIP格式压缩包，可能包含猫传染性腹膜炎相关蛋白质结构预测的PDB文件...
