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af2rave_基于物理采样的蛋白质集合生成数据集
数据集概述 本数据集是“af2rave: 基于物理采样的蛋白质集合生成”项目的代码与数据集合,包含针对ADK、DDR1、RBD三种蛋白质的AlphaFold预测结构、晶体结构、分析脚本及模型文件,以PDB格式为主,为蛋白质结构动态研究提供数据支持。 文件详解 该数据集按蛋白质类型分类存储,具体说明如下: -...
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挑战性靶点蛋白质结构预测工具比较研究_蛇毒毒素
数据集概述 本数据集收录了针对蛇毒毒素这一挑战性靶点的蛋白质结构预测工具比较研究中使用的所有结构文件。研究评估了AlphaFold2、ColabFold等工具在无参考模板情况下的预测性能,发现AlphaFold2表现最优,ColabFold计算成本更低,所有工具在无序区域预测上存在局限,为相关蛋白质结构研究提供数据支持。 文件详解...
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哺乳动物CatSpers超四级结构的膜内二硫键交联研究模型数据
数据集概述 该数据集包含一个基于膜内二硫键交联研究构建的小鼠CatSper1-4蛋白模型文件,用于阐明哺乳动物CatSpers的超四级结构,模型呈现为两个反向平行且通过CatSper3交联的线性二聚体组成的四聚体,推测其沿精子鞭毛主段延伸形成双排聚合物。 文件详解 文件名称:mcatsper_16.pdb 文件格式:PDB(.pdb)...
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RNA三维结构预测方法比较分析数据集
数据集概述 本数据集为RNA三维结构预测方法比较分析研究的配套数据,聚焦RNA-配体相互作用建模准确性评估。包含六种预测程序(DeepFoldRNA、RhoFold等)的建模结果,部分方法含有无二级结构输入的对比数据,还新增了用于基准测试的Blind Set 1和Blind Set 2数据集,以PDB格式为主存储结构预测结果。 文件详解...
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麻疹风疹疫苗研究数据集
数据集概述 本数据集是与麻疹风疹疫苗研究相关的实验数据集合,包含疫苗研究中的分子建模、对接结果、结构评估、材料信息及正常模式分析等多类数据文件,为麻疹风疹疫苗的研究提供了全面的数据支持。 文件详解 该数据集由多个目录和文件组成,具体说明如下: - 目录:Measles-Rubella Vaccine Research Data/ -...
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AlphaFold与JiNYUAN蛋白质结构预测数据集-aleron751
AlphaFold与JiNYUAN蛋白质结构预测数据集-aleron751 数据来源:互联网公开数据 标签:蛋白质结构预测,AlphaFold,JiNYUAN,PDB,生物信息学,科研,教育,数据科学 数据概述:...
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蛋白质结构与角度数据集AngleandDihedralfortheCHAMPSStructuresDataset-soerendip
蛋白质结构与角度数据集AngleandDihedralfortheCHAMPSStructuresDataset-soerendip 数据来源:互联网公开数据 标签:蛋白质结构,生物信息学,数据集,结构分析,角度计算,分子动力学,化学信息学,生物医学 数据概述:...
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蛋白质结构与功能数据集-ankerhuang
蛋白质结构与功能数据集-ankerhuang 数据来源:互联网公开数据 标签:蛋白质,结构生物学,蛋白质组学,生物信息学,蛋白质结构预测,机器学习,生物学,数据集 数据概述: 该数据集包含了大量的蛋白质结构和功能相关数据,主要记录了蛋白质的序列、三维结构、功能注释以及相关实验数据。主要特征如下: 时间跨度:...
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蛋白质结构预测数据集KG-TrainPDBs-ivanblch
蛋白质结构预测数据集KG-TrainPDBs-ivanblch 数据来源:互联网公开数据 标签:蛋白质结构,蛋白质数据库,数据集,生物信息学,分子生物学,结构预测,机器学习,蛋白质折叠 数据概述:该数据集包含来自蛋白质数据库(PDB)的蛋白质结构数据,主要用于蛋白质结构预测和相关研究。主要特征如下:...
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多胺氧化酶三层模型数据集MOA-3Layers-LB1839Dataset-yosukeyama
多胺氧化酶三层模型数据集MOA-3Layers-LB1839Dataset-yosukeyama 数据来源:互联网公开数据 标签:生物化学,酶学,数据集,蛋白质建模,机器学习,生物信息学,药物研发,分子动力学 数据概述: 该数据集包含多胺氧化酶(MOA)的三层结构模型数据,记录了多胺氧化酶在不同条件下的活性、结构和动力学特征。主要特征如下:...
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生物分子结构与模拟数据集Leash-Bio-BlenderDataset-andrey67
生物分子结构与模拟数据集Leash-Bio-BlenderDataset-andrey67 数据来源:互联网公开数据 标签:生物学,分子动力学,数据集,蛋白质,Blender,结构模拟,计算生物学,机器学习 数据概述: 该数据集包含使用Leash-Bio-...
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蛋白质结构接触频率分析数据集ProteinStructureContactFrequencyAnalysis-cdeotte
蛋白质结构接触频率分析数据集ProteinStructureContactFrequencyAnalysis-cdeotte 数据来源:互联网公开数据 标签:蛋白质结构, 生物信息学, 接触频率, 结构生物学, 分子动力学, 蛋白质建模, 机器学习, 数据分析 数据概述: 该数据集包含蛋白质结构数据,记录了蛋白质残基之间的接触频率信息。主要特征如下:...
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生物信息学蛋白质结构预测数据集B0-NS-Fold012ProteinStructurePredictionDataset-dragonzhang
生物信息学蛋白质结构预测数据集B0-NS-Fold012ProteinStructurePredictionDataset-dragonzhang 数据来源:互联网公开数据 标签:生物信息学,蛋白质结构,数据集,机器学习,预测模型,结构生物学,深度学习,生物医学 数据概述:...
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RNA结合与非结合蛋白数据集-anishnaskar
RNA结合与非结合蛋白数据集-anishnaskar 数据来源:互联网公开数据 标签:蛋白质组学,RNA结合蛋白,数据集,生物信息学,机器学习,结构生物学,基因表达,蛋白质分析 数据概述: 该数据集包含来自多个来源的RNA结合蛋白(RBP)和非RNA结合蛋白的详细信息,用于研究蛋白质与RNA相互作用的特性。主要特征如下: 时间跨度:...
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蛋白质三维结构数据集Ribonanza3DDataProcessedDataset-davidbtcox
蛋白质三维结构数据集Ribonanza3DDataProcessedDataset-davidbtcox 数据来源:互联网公开数据 标签:蛋白质结构,生物信息学,数据集,三维模型,分子生物学,机器学习,结构分析,生物医学 数据概述: 该数据集包含经过处理的蛋白质三维结构数据,记录了多种蛋白质的原子级三维坐标和结构信息。主要特征如下:...
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蛋白质热稳定性预测数据集ProteinThermalStabilityPrediction-ipsita1999
蛋白质热稳定性预测数据集ProteinThermalStabilityPrediction-ipsita1999 数据来源:互联网公开数据 标签:蛋白质, 热稳定性, 机器学习, 结构预测, 蛋白质序列, 生物信息学, 数据挖掘, 结构生物学 数据概述:...
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蛋白质结构特征编码与聚类数据集ProteinStructureFeatureEncodingandClusteringDataset-kevinsawade
蛋白质结构特征编码与聚类数据集ProteinStructureFeatureEncodingandClusteringDataset-kevinsawade 数据来源:互联网公开数据 标签:蛋白质结构, 编码, 聚类分析, 机器学习, 生物信息学, 分子动力学, 结构预测, 数据分析 数据概述:...
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蛋白质抗体结构与相互作用数据集ProteinAntibodyStructureandInteractionDataset-nayan082
蛋白质抗体结构与相互作用数据集ProteinAntibodyStructureandInteractionDataset-nayan082 数据来源:互联网公开数据 标签:蛋白质结构, 抗体, 结构生物学, 相互作用, PDB, X射线衍射, 序列, 二级结构, 数据挖掘 数据概述:...
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蛋白质结构与溶剂可及性数据集ProteinStructureandSolventAccessibilityDataset-davidguevara
蛋白质结构与溶剂可及性数据集ProteinStructureandSolventAccessibilityDataset-davidguevara 数据来源:互联网公开数据 标签:蛋白质结构, 溶剂可及性, 生物信息学, PDB, 蛋白质分析, 数据挖掘, 分子动力学, 计算生物学 数据概述:...
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蛋白质数据库结构与序列清理数据集PDB-SSDataCleanDataset-shujun717
蛋白质数据库结构与序列清理数据集PDB-SSDataCleanDataset-shujun717 数据来源:互联网公开数据 标签:蛋白质结构,蛋白质序列,数据集,生物信息学,数据清洗,分子生物学,结构生物学,蛋白质工程 数据概述:...



