RNA三维结构预测方法比较分析数据集

数据集概述

本数据集为RNA三维结构预测方法比较分析研究的配套数据,聚焦RNA-配体相互作用建模准确性评估。包含六种预测程序(DeepFoldRNA、RhoFold等)的建模结果,部分方法含有无二级结构输入的对比数据,还新增了用于基准测试的Blind Set 1和Blind Set 2数据集,以PDB格式为主存储结构预测结果。

文件详解

  • 主数据集目录(Main Dataset/):按预测方法命名子目录,部分含"_ss"后缀表示使用二级结构输入,存储各方法生成的RNA三维结构文件(PDB格式)
  • 盲测数据集目录(Blind Sets B1 and B2/):
  • 按预测方法(含AlphaFold3)及是否使用二级结构("_ss"后缀)划分子目录
  • 存储各方法在盲测集上的预测结果文件,命名格式为"[结构ID][方法名][序号].pdb"
  • 说明文件:
  • README.MD:包含项目资助信息、研究背景及作者等元数据
  • list.txt:记录盲测集B1和B2包含的结构ID列表

适用场景

  • 计算生物学研究:评估不同RNA三维结构预测方法的性能差异
  • 结构生物学分析:对比含/无二级结构输入对预测准确性的影响
  • 药物研发应用:优化RNA-小分子配体相互作用的建模策略
  • 机器学习基准测试:基于盲测数据集验证新型RNA结构预测模型性能
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 149.15 MiB
最后更新 2025年11月26日
创建于 2025年11月26日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。