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配体结合蛋白构象异质性研究数据
2026年2月12日 30 68 63
数据集概述 本数据集围绕蛋白质侧链构象异质性展开，通过多构象建模分析743对严格匹配的晶体学数据集（未结合/apo与配体结合/holo状态），探究配体结合对蛋白质构象异质性的影响，包括结合位点与远端残基的刚性/柔性变化、配体性质与蛋白质柔性的关联，以及CDK2抑制剂结合结构的构象异质性传播规律。 文件详解...
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for_lisa_ASH_setup_配置文件数据
2026年2月9日 30 148 131
数据集概述 本数据集为“for lisa ASH setup”相关的文件集合，包含2个独立文件，无目录层级，未划分训练/测试、数据/标签或原始/处理数据，文件类型以XML和PDB为主，各占50%。 文件详解 数据文件 文件名称：fepart.xml 文件格式：XML 字段映射介绍：XML元数据文件，具体字段内容未提供 其他文件...
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结核分枝杆菌的补充蛋白质数据库_PDBs_分枝菌酸差异自发折叠结构数据
2026年2月6日 30 146 92
数据集概述 本数据集包含结核分枝杆菌分枝菌酸的代表性“WUZ”折叠结构的PDB文件，是论文“Differential spontaneous folding of mycolic acids from Mycobacterium tuberculosis”的补充数据，用于展示分枝菌酸的差异自发折叠特性，为相关生物化学研究提供结构参考。 文件详解...
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基于进化信息数据的蛋白质界面残基相互作用预测
2026年2月1日 30 25 13
数据集概述 本数据集围绕蛋白质界面残基相互作用预测展开，基于进化信息分析氨基酸序列协变性，验证其在已知结构蛋白质复合物中的接触预测效果，并对未知结构复合物进行预测建模。包含8个文件，涵盖蛋白质结构文件与序列比对压缩包，用于支撑蛋白质复合物结构预测研究。 文件详解 .pdb格式文件（共4个）...
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VTR_Based_分子结构比较案例研究数据集
2026年2月1日 30 169 101
数据集概述 本数据集包含三组VTR案例研究的相关文件，涉及肌红蛋白与血红蛋白的比较、SARS-CoV-1与SARS-CoV-2的RBD结构比较、葡萄糖耐受与非耐受β-葡萄糖苷酶的比较。数据以表格和压缩文件形式呈现，记录了检测到的分子接触信息及对应的蛋白质结构可视化文件，适用于分子结构比较分析。 文件详解 contacts.xlsx 文件格式：XLSX...
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tinyIFD_Based_药物分子对接数据集
2026年2月1日 30 33 7
数据集概述 本数据集与提交至JCIM的tinyIFD出版物相关，包含模板受体的清洁PDB文件（apo和holo形式）以及待对接至模板受体的目标配体。文件组织方式可直接置于tinyIFD工作流的根目录，包含369个交叉对接案例的主数据集和35个交叉对接案例的Mpro数据集。 文件详解 Main_dataset.zip 文件格式：ZIP...
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数据集_S4_6_解析受体_肽_配体结合机制的数据
2026年1月31日 30 46 34
数据集概述 本数据集为受体-肽配体结合机制研究的配套数据，包含质粒图谱、AI预测结构及验证实验原始文件。通过生物信息学与AI结构建模结合的方法，支持配体-受体同源物识别及结合机制预测，为肽-受体对的结构功能分析提供框架。 文件详解 Dataset_S4-6.zip（压缩包） 文件格式：ZIP 包含内容： Dataset...
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Arena_Based_RNA结构重建基准测试数据集
2026年1月31日 30 168 19
数据集概述 本数据集包含Arena程序相关的基准测试数据，用于评估RNA结构重建程序的性能。数据集分为五个压缩文件，涵盖Arena源代码、基准测试用数据集、RNA核苷酸序列、PDB ID列表及RNA分类文件，为RNA结构重建研究提供标准化测试资源。 文件详解 Arena-main.zip 文件格式：ZIP...
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raw_data_Based_生物学原始实验数据文件集
2026年1月30日 30 123 69
数据集概述 本数据集为生物学领域的原始实验数据文件集，包含三十个文件，覆盖FASTA、PDB、TXT、CSV、TSV、XLSX、R等七种格式，涉及信号强度测量、序列比对、结构分析、数据处理脚本等内容，无明确目录结构，可用于生物信息学相关分析。 文件详解 数据文件类 信号强度测量文件：如Fig. S9Dand...
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AlphaFold_SLC_蛋白复合物预测结构及注释数据
2026年1月30日 30 34 16
数据集概述 本数据集包含溶质载体（SLC）转运蛋白复合物及对照的预测结构，通过AlphaFold（v2.2、v2.3、v3）生成，涉及SLC蛋白相互作用组的结构分析。数据用于研究SLC蛋白的调控机制及在人类互作组中的定位，包含结构文件及注释表格，支持生物医学领域对膜转运蛋白的研究。 文件详解...
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XK_VPS13A_Based膜蛋白相互作用结构预测数据
2026年1月30日 30 108 27
数据集概述 本数据集包含脂质 scramblase XK与脂质转移蛋白VPS13A在质膜上相互作用的相关文件，涉及Alphafold预测的VPS13A蛋白结构、XK与VPS13A C端的多聚体相互作用预测，以及图表对应的表格数据，支持相关预印本和出版物的研究验证。 文件详解 蛋白结构预测文件（.pdb格式，共3个）...
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ZIF_ML_Based_ZIF变体气体扩散系数预测数据集
2026年1月30日 30 140 66
数据集概述 本数据集为ZIF变体气体扩散系数预测ML模型的配套数据，包含所有ZIFs的描述符及模拟输出（气体分子扩散系数），以及SOD拓扑结构ZIFs的结构文件，用于支持材料科学领域的扩散系数预测研究。 文件详解 ESI_2_dataset.xlsx 文件格式：XLSX...
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RoseTTAFold_Based_蛋白质突变效应预测研究数据
2026年1月29日 30 115 94
数据集概述 本数据集为“Mutation Effect Prediction of Proteins using RoseTTAFold”研究提供支持，包含目标多序列比对（MSAs）、RoseTTAFold预测的蛋白质结构（PDBs）、实验值CSV文件及论文发表的预测结果，共4个文件，用于蛋白质突变效应的预测与分析。 文件详解...
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CYP2B4_MD_Based膜结合细胞色素分子动力学模拟数据
2026年1月28日 30 143 140
数据集概述 本数据集包含运行和分析膜结合CYP2B4分子动力学模拟所需的坐标文件、脚本及输入参数，对应研究膜结合细胞色素2B4构象变异性与功能相互作用的多分辨率分子动力学模拟研究。数据支持复现研究中描述的模拟及分析过程，包含输入数据、模拟最终帧及论文配图相关的蛋白质结构文件。 文件详解 data.zip 文件格式：ZIP...
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HSP27_p62_Based溶酶体损伤诱导自噬信号通路研究数据
2026年1月28日 30 67 44
数据集概述 本数据集为论文“Lysosomal damage triggers a p38 MAPK-dependent phosphorylation cascade to promote lysophagy via the small heat shock protein...
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DtpA_Based_二肽和三肽通透酶A转运循环构象景观模拟数据
2026年1月28日 30 13 5
数据集概述 本数据集围绕二肽和三肽通透酶A（DtpA）的转运循环构象景观展开，包含模拟运行所需的输入、结构、参数文件，分析脚本及亚稳态模型文件，共七个文件，支持对DtpA转运机制的分子动力学模拟与构象分析。 文件详解 文档文件 文件名称：Readme_zenodo.docx 文件格式：DOCX...
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Cyt_c_DNA_Based细胞色素c与DNA相互作用研究数据
2026年1月28日 30 41 28
数据集概述 本数据集包含细胞色素c（Cyt c）与DNA混合体系的实验及分子动力学（MD）模拟研究数据，涵盖构象变化、过氧化物酶活性及结合机制等内容，通过实验与模拟结合验证了两者相互作用的结构与功能关联，共14个文件。 文件详解...
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KRAS_G12X_Based_癌症突变概率与分子动力学分析数据集
2026年1月27日 30 102 19
数据集概述 本数据集为论文相关的研究数据，包含KRAS G12X突变体的突变概率数据、分子模拟的均方根波动（RMSF）数据、PyInteraph分析数据及分子动力学轨迹文件，用于支持KRAS G12突变体的突变概率评估和长时间尺度动力学研究。 文件详解 突变概率数据文件 文件名称：KRAS_G12X_mut_COSMICv79.xlsx...
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AlphaFold_Rosetta_酶热稳定性预测_结构与能量数据
2026年1月27日 30 162 76
数据集概述 本数据集围绕酶热稳定性预测展开，包含通过AlphaFold获取的酶变体结构文件、Rosetta计算的能量数据，以及DTM与DGf,mut值对比的Excel表格，涉及LovD、LipA等多种酶变体，用于支撑酶热稳定性预测研究。 文件详解 DTM_vs_DDGf_mut.xlsx 文件格式：XLSX...
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openmm_Figshare_Based_分子模拟软件测试数据集
2026年1月27日 30 142 84
数据集概述 本数据集为OpenMM软件测试专用数据，包含5个文件，涵盖分子模拟、实时分析配置、数据库、检查点及混合系统结构等内容，支持OpenMM软件功能验证与性能测试，无文件目录层级划分。 文件详解 科学文件（.nc格式，共2个） 文件名称：simulation.nc、checkpoint.nc 文件格式：NC...
