数据集概述
本数据集为论文相关的研究数据，包含KRAS G12X突变体的突变概率数据、分子模拟的均方根波动（RMSF）数据、PyInteraph分析数据及分子动力学轨迹文件，用于支持KRAS G12突变体的突变概率评估和长时间尺度动力学研究。
文件详解
- 突变概率数据文件
- 文件名称：KRAS_G12X_mut_COSMICv79.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：来源于COSMIC v.79数据库的KRAS G12X突变体相关数据
- RMSF数据文件
- 文件名称：300_2000rmsf_GDP_systems_RAW_AVG_SE.xlsx、300_2000RMSF_GTP_systems_RAW_AVG_SE.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：分别记录GDP系统和GTP系统在300-2000ns内的均方根波动原始数据、平均值及标准误差
- PyInteraph分析数据压缩包
- 文件名称：PyInteraph_data.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含各系统盐桥和疏水簇分析的.dat文件
- 分子动力学轨迹文件
- 文件名称：如GTP_G12R_2.xtc、GDP_G12D_3.xtc等（共85个.xtc文件）
- 文件格式：XTC
- 字段映射介绍：各系统（含野生型及G12X突变体）的主链轨迹数据，覆盖残基4-164，每1ns一个帧，文件末尾数字代表模拟系统的复本编号
- 结构文件
- 文件名称：backbone_4-164.gro、backbone_4-164.pdb、backbone_4-164.tpr
- 文件格式：GRO、PDB、TPR
- 字段映射介绍：残基4-164的主链结构相关文件，用于分子模拟的结构参考和参数设置
数据来源
论文“Assessment of mutation probabilities of KRAS G12 missense mutants and their long-time scale dynamics by atomistic molecular simulations and Markov state modeling”
适用场景
- 癌症突变研究: 分析KRAS G12X突变体的突变概率分布及临床相关性
- 分子动力学分析: 研究KRAS G12突变体在GDP和GTP结合状态下的结构动力学特征
- 蛋白质相互作用研究: 利用PyInteraph数据探索突变体的盐桥和疏水簇变化对蛋白质功能的影响
- 药物研发支撑: 为KRAS G12突变体靶向药物的设计提供结构动力学数据参考
