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基于环丁烯力触发顺旋开环的结构性质关系计算数据
2026年2月1日 30 10 3
数据集概述 本数据集为论文“Structure-property relationships for the force-triggered disrotatory ring-opening of cyclobutene”配套计算数据，包含环丁烯力触发顺旋开环反应的结构文件、能垒数据及相关说明文件，支持对该反应的结构性质关系研究，共含3个文件。...
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GAP_Based_非晶氮化硼GAP势函数数据
2026年2月1日 30 34 27
数据集概述 本数据集为非晶氮化硼样品的高斯近似势函数（GAP），基于从头算分子动力学和密度泛函理论（DFT）生成的数据集训练而成，可通过pair_style quip命令在分子模拟中使用。 文件详解 文件名称：gap_2b3bsoap_2000_04.zip 文件格式：ZIP...
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fcc_FeHx_Based_CMB条件数据与机器学习模型
2026年1月30日 30 110 68
数据集概述 本数据集包含fcc-FeHx在CMB条件下的熔化温度、声速等数据，以及由DeePMD-kit训练的机器学习模型，同时提供两相共存模拟的初始构型。数据集共3个文件，无目录结构。 文件详解 文件名称：frozen_model.pb 文件格式：.pb 字段映射介绍：由DeePMD-kit训练的机器学习模型文件，用于相关计算预测。...
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LAMMPS_AIREBO_最大富勒烯及多层碳结构优化数据
2026年1月29日 30 164 114
数据集概述 本数据集包含孤立二十面体富勒烯、多层富勒烯“洋葱”及堆叠石墨烯层的优化结构，按类型分类存储。石墨烯结构按堆叠层数组织，所有结构均通过LAMMPS中的AIREBO力场优化，为碳材料结构研究提供基础数据。 文件详解 文件名称：Structures.zip 文件格式：ZIP 字段映射介绍：压缩包内包含标准xyz结构文件，单个xyz文件结构为：...
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FFA2_Simulation_Based_丙酸结合受体模拟数据
2026年1月28日 30 117 87
数据集概述 本数据集为论文“Structural insights into lipid chain-length selectivity and allosteric regulation of FFA2”配套的丙酸结合FFA2受体模拟数据，包含1个压缩文件，无目录结构，可用于研究FFA2受体的脂质链长选择性及变构调节的结构机制。 文件详解...
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ProtNAff_Based_蛋白质结合核酸过滤及片段库完整数据
2026年1月28日 30 40 2
数据集概述 本数据集是通过ProtNAff pipeline生成的蛋白质结合核酸相关数据，包含2021年10月筛选的蛋白质-RNA结构元数据、三核苷酸片段列表及坐标库。筛选条件为含蛋白质和RNA链、无DNA、分辨率小于3埃或NMR方法的PDB结构，排除核糖体，用于支持原ProtNAff论文分析。 文件详解 核心数据文件...
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Kim_Based_酵母核孔复合体FG重复序列布朗动力学模拟数据
2026年1月28日 30 131 11
数据集概述 本数据集包含用于复现酵母核孔复合体FG重复序列布朗动力学模拟的压缩文件，模拟方法基于IMP工具，相关研究发表于Kim等人2018年的成果。数据集仅包含一个压缩文件，无目录结构，可支持模拟过程的重现与验证。 文件详解 文件名称：npc_fg_2018-master.zip 文件格式：ZIP...
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KRAS_G12X_Based_癌症突变概率与分子动力学分析数据集
2026年1月27日 30 27 21
数据集概述 本数据集为论文相关的研究数据，包含KRAS G12X突变体的突变概率数据、分子模拟的均方根波动（RMSF）数据、PyInteraph分析数据及分子动力学轨迹文件，用于支持KRAS G12突变体的突变概率评估和长时间尺度动力学研究。 文件详解 突变概率数据文件 文件名称：KRAS_G12X_mut_COSMICv79.xlsx...
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Cellulose_Based_纤维素单链溶解计算研究补充材料数据
2026年1月27日 30 159 80
数据集概述 本数据集为论文“Computational study of the dissolution of cellulose into single chains: the role of the solvent and...
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openmm_Figshare_Based_分子模拟软件测试数据集
2026年1月27日 30 16 1
数据集概述 本数据集为OpenMM软件测试专用数据，包含5个文件，涵盖分子模拟、实时分析配置、数据库、检查点及混合系统结构等内容，支持OpenMM软件功能验证与性能测试，无文件目录层级划分。 文件详解 科学文件（.nc格式，共2个） 文件名称：simulation.nc、checkpoint.nc 文件格式：NC...
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QM_Based_CB_8_受体配体G0_G9结合自由能计算坐标数据
2026年1月27日 30 179 147
数据集概述 本数据集包含用于计算配体G0-G9与CB[8]受体结合自由能的笛卡尔坐标数据，基于快速量子力学（QM）构象化学空间采样方法生成，为研究受体-配体结合机制提供关键结构信息。 文件详解 文件名称：Cartesian_coordinates.zip 文件格式：ZIP...
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NEP_TNEP_Based_分子物种与液态水及锆酸钡神经进化势模型数据
2026年1月22日 30 19 0
数据集概述 本数据集包含分子水物种、液态水及锆酸钡的神经进化势（NEP）和张量神经进化势（TNEP）模型文件（nep.txt），以及对应的训练数据压缩包（.zip），共26个文件。模型通过GPUMD 3.9构建，可用于快速模拟红外与拉曼光谱，支持计算化学领域的分子张量特性研究。 文件详解 模型文件（TXT格式）...
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Metadynamics_Source_萃取剂构象自由能景观模拟输入脚本
2026年1月22日 30 172 101
数据集概述 本数据集包含用于Metadynamics模拟的输入脚本，核心主题是揭示萃取剂的构象自由能景观。数据集以单个压缩包形式提供，无目录结构或数据分割，可用于分子动力学模拟相关的计算化学研究。 文件详解 压缩包文件 文件名称：MTD_ligand_design.zip 文件格式：ZIP...
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CP2K_Based_BioExcel_2项目QM_MM基准测试结果数据
2026年1月22日 30 160 117
数据集概述 本数据集包含CP2K软件运行BioExcel QM/MM基准测试套件生成的原始输出日志，是BioExcel-2项目交付成果D1.6的一部分。数据来源于Cirrus和ARCHER2两台超算的基准测试，涵盖不同节点类型、CP2K版本及MD步数的运行结果，用于支持分子模拟性能分析。 文件详解...
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Computational_Models_脂质形状抗菌肽膜活性研究数据集
2026年1月22日 30 105 74
数据集概述 本数据集包含Marcin Makowski等作者在《Lipid shape as a membrane activity modulator of a model antimicrobial peptide》一文中使用的分析脚本和计算模型，用于研究脂质形状对模型抗菌肽膜活性的调控作用，以压缩包形式提供。 文件详解...
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SAMPL9_Based_甲苯水分配系数NE_FG盲预测ORAC6_1数据
2026年1月21日 30 15 11
数据集概述 本数据集为SAMPL9挑战中甲苯/水分配系数（LogP）的非平衡快速增长（NE-FG）盲预测复现数据，基于s/w ORAC6.1工具构建，包含电荷参数库、分子结构文件、工作数据目录、辅助脚本及挑战提交分析结果等内容。 文件详解 核心目录结构： lib-631Gd：含6-31Gd电荷的GAFF2 ORAC拓扑参数库 lib-...
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bromotyrosine_Computational_分子模拟与NMR数据
2026年1月20日 30 75 24
数据集概述 本数据集包含23个bromotyrosine相关的计算化学文件，涵盖计算日志、输出文件及分子坐标文件。文件涉及不同计算方法（如b3lypd3bj、mpw1pw91）、基组（如6311pgdp、lanl2dp）和溶剂环境（如Methanol）的分子模拟结果，包括频率分析、NMR计算、旋转异构体及最低能量结构等内容。 文件详解...
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Eriksen_Based电解质溶液SAFT_VR_Mie状态方程势能模型数据
2026年1月20日 30 131 6
数据集概述 本数据集包含论文“Development of intermolecular potential models for electrolyte solutions using an electrolyte SAFT-VR Mie equation of...
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PMFs_Al_NanoParticles_零价铝纳米颗粒与氨基酸侧链平均力势数据
2026年1月15日 30 65 49
数据集概述 本数据集包含面心立方结构（100）、（110）、（111）三种构型的零价铝纳米颗粒与22种氨基酸侧链类似物相互作用的平均力势数据。数据通过自适应温和元动力学方法计算生成，可用于研究生物分子在铝纳米材料表面的吸附行为及相互作用机制。 文件详解 文件名称：Aluminium-pmfs.zip 文件格式：ZIP...
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Quantum_Chemical_Based_铬_0_配合物光诱导配体取代量子化学模拟数据
2026年1月12日 30 44 36
数据集概述 本数据集为铬(0)配合物[Cr(Ltri)₂]、其四氢呋喃加合物[Cr(Ltri)₂(THF)]及四氢呋喃（THF）在B3LYP/def2svp理论水平下的量子化学模拟数据，包含基态与激发态性质，涉及单重态（1）和三重态（3）两种自旋多重度，共5个压缩文件。 文件详解 1[Cr(Ltri)₂].zip 文件格式：ZIP...
