数据集概述
本数据集为OpenMM软件测试专用数据，包含5个文件，涵盖分子模拟、实时分析配置、数据库、检查点及混合系统结构等内容，支持OpenMM软件功能验证与性能测试，无文件目录层级划分。
文件详解
- 科学文件（.nc格式，共2个）
- 文件名称：simulation.nc、checkpoint.nc
- 文件格式：NC
- 字段映射介绍：包含分子模拟过程数据及模拟检查点信息，用于存储OpenMM模拟的中间状态或结果数据
- 配置文件（.yaml格式，共1个）
- 文件名称：simulation_real_time_analysis.yaml
- 文件格式：YAML
- 字段映射介绍：存储模拟实时分析的配置参数，用于定义OpenMM模拟过程中的实时分析规则
- 数据文件（.json格式，共1个）
- 文件名称：db.json
- 文件格式：JSON
- 字段映射介绍：包含数据库相关数据，用于存储OpenMM测试所需的结构化信息
- 其他文件（.pdb格式，共1个）
- 文件名称：hybrid_system.pdb
- 文件格式：PDB
- 字段映射介绍：存储混合系统的分子结构数据，用于OpenMM软件对特定分子系统的模拟测试
数据来源
figshare平台（DOI:10.6084/m9.figshare.24101655）
适用场景
- OpenMM软件功能验证：用于测试OpenMM软件对分子模拟、实时分析等核心功能的支持能力
- 分子模拟流程测试：验证OpenMM模拟从系统构建到结果输出的完整流程稳定性
- 软件版本兼容性测试：对比不同版本OpenMM对同一测试数据的处理结果，评估版本兼容性
- 计算性能基准测试：以该数据集为基准，测试OpenMM在不同硬件环境下的计算性能
