数据集 - 海数据

刺激响应型双态铰链蛋白设计补充数据

2026年2月15日 30 181 161

数据集概述本数据集是“Design of stimulus-responsive two-state hinge proteins”的补充信息，包含设计脚本、设计模型及aw DEER原始数据，共4个文件，涵盖.xlsx表格和.zip压缩包两种类型，为刺激响应双态铰链蛋白的设计研究提供支持。文件详解文件名称：S1_spreadsheet.xlsx...

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for_lisa_ASH_setup_配置文件数据

2026年2月9日 30 47 16

数据集概述本数据集为“for lisa ASH setup”相关的文件集合，包含2个独立文件，无目录层级，未划分训练/测试、数据/标签或原始/处理数据，文件类型以XML和PDB为主，各占50%。文件详解数据文件文件名称：fepart.xml 文件格式：XML 字段映射介绍：XML元数据文件，具体字段内容未提供其他文件...

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VTR_Based_分子结构比较案例研究数据集

2026年2月1日 30 204 190

数据集概述本数据集包含三组VTR案例研究的相关文件，涉及肌红蛋白与血红蛋白的比较、SARS-CoV-1与SARS-CoV-2的RBD结构比较、葡萄糖耐受与非耐受β-葡萄糖苷酶的比较。数据以表格和压缩文件形式呈现，记录了检测到的分子接触信息及对应的蛋白质结构可视化文件，适用于分子结构比较分析。文件详解 contacts.xlsx 文件格式：XLSX...

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raw_data_Based_生物学原始实验数据文件集

2026年1月30日 30 93 36

数据集概述本数据集为生物学领域的原始实验数据文件集，包含三十个文件，覆盖FASTA、PDB、TXT、CSV、TSV、XLSX、R等七种格式，涉及信号强度测量、序列比对、结构分析、数据处理脚本等内容，无明确目录结构，可用于生物信息学相关分析。文件详解数据文件类信号强度测量文件：如Fig. S9Dand...

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AlphaFold_SLC_蛋白复合物预测结构及注释数据

2026年1月30日 30 42 26

数据集概述本数据集包含溶质载体（SLC）转运蛋白复合物及对照的预测结构，通过AlphaFold（v2.2、v2.3、v3）生成，涉及SLC蛋白相互作用组的结构分析。数据用于研究SLC蛋白的调控机制及在人类互作组中的定位，包含结构文件及注释表格，支持生物医学领域对膜转运蛋白的研究。文件详解...

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XK_VPS13A_Based膜蛋白相互作用结构预测数据

2026年1月30日 30 44 34

数据集概述本数据集包含脂质 scramblase XK与脂质转移蛋白VPS13A在质膜上相互作用的相关文件，涉及Alphafold预测的VPS13A蛋白结构、XK与VPS13A C端的多聚体相互作用预测，以及图表对应的表格数据，支持相关预印本和出版物的研究验证。文件详解蛋白结构预测文件（.pdb格式，共3个）...

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ZIF_ML_Based_ZIF变体气体扩散系数预测数据集

2026年1月30日 30 117 94

数据集概述本数据集为ZIF变体气体扩散系数预测ML模型的配套数据，包含所有ZIFs的描述符及模拟输出（气体分子扩散系数），以及SOD拓扑结构ZIFs的结构文件，用于支持材料科学领域的扩散系数预测研究。文件详解 ESI_2_dataset.xlsx 文件格式：XLSX...

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CYP2B4_MD_Based膜结合细胞色素分子动力学模拟数据

2026年1月28日 30 168 87

数据集概述本数据集包含运行和分析膜结合CYP2B4分子动力学模拟所需的坐标文件、脚本及输入参数，对应研究膜结合细胞色素2B4构象变异性与功能相互作用的多分辨率分子动力学模拟研究。数据支持复现研究中描述的模拟及分析过程，包含输入数据、模拟最终帧及论文配图相关的蛋白质结构文件。文件详解 data.zip 文件格式：ZIP...

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AlphaFold_Rosetta_酶热稳定性预测_结构与能量数据

2026年1月27日 30 63 50

数据集概述本数据集围绕酶热稳定性预测展开，包含通过AlphaFold获取的酶变体结构文件、Rosetta计算的能量数据，以及DTM与DGf,mut值对比的Excel表格，涉及LovD、LipA等多种酶变体，用于支撑酶热稳定性预测研究。文件详解 DTM_vs_DDGf_mut.xlsx 文件格式：XLSX...

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openmm_Figshare_Based_分子模拟软件测试数据集

2026年1月27日 30 102 20

数据集概述本数据集为OpenMM软件测试专用数据，包含5个文件，涵盖分子模拟、实时分析配置、数据库、检查点及混合系统结构等内容，支持OpenMM软件功能验证与性能测试，无文件目录层级划分。文件详解科学文件（.nc格式，共2个）文件名称：simulation.nc、checkpoint.nc 文件格式：NC...

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AaPilA_Based_口腔致病菌IV型菌毛计算模型结构数据2022

2026年1月22日 30 175 72

数据集概述本数据集包含口腔致病菌伴放线聚集杆菌（Aggregatibacter actinomycetemcomitans）IVa型菌毛蛋白PilA的计算建模结构。通过分子动力学模拟和GalaxyGemini服务器预测了全长单体、N端截短单体及14聚体的三维结构，为理解该菌毛的分子结构提供参考。数据集含2个文件，涵盖建模结果的说明与归档文件。...

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Enhanced_Mapping_Based_小分子细胞结合位点对接数据

2026年1月22日 30 120 115

数据集概述本数据集为Wozniak等人手稿中的精选对接构象数据，包含小分子在细胞内结合位点的映射信息，文件以结构ID（PDBID或AlphaFold模型）与探针ID组合命名，共1个压缩文件，可用于药物研发相关的小分子结合位点分析。文件详解文件名称：Wozniak_et_al_selected_docking_poses_v2.zip...

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数据2019_nCoV_ADE_Based感染抗体依赖性增强预防研究补充数据

2026年1月20日 30 185 126

数据集概述本数据集为2019-nCoV感染抗体依赖性增强（ADE）研究的补充数据，包含病毒结构模型文件、序列文件、结构比对文件及说明文档等，涉及2019-nCoV与SARS的S蛋白结构、RBD区域序列等关键信息，用于支持新型冠状病毒感染机制及预防策略相关研究，共包含10个文件。文件详解结构模型文件（.pse、.pdb格式）...

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Drug_target_residence_time_Based药物研发数据

2026年1月20日 30 73 25

数据集概述本数据集包含药物靶点停留时间及相关结合动力学系数、配体基础性质（如SMILES或InChI字符串），以及PubMed参考文献信息。数据集分为Excel文件和压缩包文件，总计2个文件，可通过分子可视化系统或文本编辑器打开。文件详解文件名称：residence_time_data.xlsx 文件格式：XLSX...

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Propeptides_Supplemental_蛋白生产研究前肽加工与生产促进补充数据

2026年1月13日 30 14 2

数据集概述本数据集为论文《Propeptides: From Processing to Promotion of Protein Production》的补充数据，包含三十个文件，涵盖基因序列、蛋白质结构模型、实验视频及引物信息，主要涉及前肽（Propeptides）对蛋白生产的影响研究，支持蛋白质工程领域相关分析。文件详解...