数据集概述
本数据集包含口腔致病菌伴放线聚集杆菌（Aggregatibacter actinomycetemcomitans）IVa型菌毛蛋白PilA的计算建模结构。通过分子动力学模拟和GalaxyGemini服务器预测了全长单体、N端截短单体及14聚体的三维结构，为理解该菌毛的分子结构提供参考。数据集含2个文件，涵盖建模结果的说明与归档文件。
文件详解
- README.md
- 文件格式：MD
- 字段映射介绍：说明归档文件的结构与内容，提及包含3个子文件夹（如AlphaFold_Results），所有建模结果以PDB格式存储，需用PyMOL等分子可视化工具查看
- Computational_modelling_Vahvelainen_et_al_2022.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：归档文件，包含AaPilA蛋白计算建模的完整结果，涵盖不同构象的单体（全长、N端截短）及14聚体的PDB结构文件
适用场景
- 细菌菌毛结构研究: 分析AaPilA蛋白的单体及多聚体三维结构，理解IV型菌毛的组装机制
- 口腔致病菌致病机制分析: 探究AaPilA结构与细菌黏附、侵袭等致病行为的关联
- 分子动力学模拟验证: 作为计算建模结果的参考数据，支持相关模拟方法的验证与优化
- 药物靶点发现: 基于AaPilA的结构特征，筛选针对该菌毛蛋白的潜在抗菌药物靶点
