OCE_Supplementary_Material_真菌孤儿候选效应因子结构与进化研究数据

数据集概述

本数据集为论文“Surface frustration re-patterning underlies the structural landscape and evolvability of fungal orphan candidate effectors”的补充材料,包含12张补充表格、7个数据集压缩包及1份补充文本与图表文件,覆盖真菌基因组分析、OCE蛋白质结构预测、序列变异与进化分析等核心内容,支撑真菌孤儿候选效应因子的结构景观与可进化性研究。

文件详解

  • 补充表格文件
  • 文件名称:Supplementary_Tables_2023_01_05.xlsx
  • 文件格式:XLSX
  • 字段映射介绍:含12张表格,涵盖真菌基因组列表、分泌蛋白信息、结构数据库比对结果、OCE折叠统计、残基保守性与突变分析、系统发育树统计等内容,支撑OCE的结构、序列与进化特征研究。
  • 补充文本与图表文件
  • 文件名称:Supplementary_Text_v2023_01_04.docx
  • 文件格式:DOCX
  • 字段映射介绍:包含补充方法、结果及13张补充图表,补充论文核心内容的细节说明与可视化结果。
  • 数据集压缩包(共7个,.zip格式)
  • DatasetS1.zip:3927个OCE的AlphaFold rank1模型(.pdb格式)
  • DatasetS2.zip:3911个OCE的成对结构比较DALI矩阵输出(含Z-score)
  • DatasetS3.zip:OCE结构相似性网络文件(.sif、.xgmml格式,含2561个节点)
  • DatasetS4.zip:结构与突变分析相关视频(.mp4格式)
  • DatasetS5.zip:KP6与Alt-A1簇的系统发育树、祖先/现代序列及蛋白质结构模型
  • DatasetS6.zip:Alt-A1与KP6簇自然变异体及突变体的预测结构(.pdb格式)
  • DatasetS7.zip:15个OCE分支的系统发育树与蛋白质结构模型(.nwk、.pdb格式)

数据来源

论文“Surface frustration re-patterning underlies the structural landscape and evolvability of fungal orphan candidate effectors”

适用场景

  • 真菌蛋白质组学研究:分析真菌孤儿候选效应因子的序列特征、结构景观与进化规律
  • 蛋白质结构预测验证:基于AlphaFold模型研究OCE的结构特性与功能关联性
  • 分子进化分析:通过系统发育树与突变数据探究OCE的可进化性及适应性机制
  • 生物信息学方法开发:验证结构相似性网络、突变扫描等分析方法在真菌效应因子研究中的应用价值
  • 真菌-宿主互作机制研究:为解析OCE在真菌致病性中的作用提供结构与进化层面的数据支撑
packageimg

数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 225.16 MiB
最后更新 2026年1月12日
创建于 2026年1月12日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。