数据集 - 海数据

OR5K1_Based_G蛋白偶联受体正构结合位点分子动力学模拟数据

2026年2月6日 0 196 181

数据集概述本数据集包含G蛋白偶联气味受体OR5K1的分子动力学（MD）模拟拓扑、参数及坐标文件。数据基于AlphaFold 2（AF2）和同源建模（HM）构建的OR5K1三维模型，使用ACEMD3（v3.5.1）引擎及CHARMM36力场，涵盖两种模型各三个100 ns重复模拟轨迹，已移除原始轨迹中的水分子、离子及膜原子（POPC）。文件详解...

AlphaFold_SLC_蛋白复合物预测结构及注释数据

2026年1月30日 30 177 106

数据集概述本数据集包含溶质载体（SLC）转运蛋白复合物及对照的预测结构，通过AlphaFold（v2.2、v2.3、v3）生成，涉及SLC蛋白相互作用组的结构分析。数据用于研究SLC蛋白的调控机制及在人类互作组中的定位，包含结构文件及注释表格，支持生物医学领域对膜转运蛋白的研究。文件详解...

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AlphaFold_Rosetta_酶热稳定性预测_结构与能量数据

2026年1月27日 30 200 199

数据集概述本数据集围绕酶热稳定性预测展开，包含通过AlphaFold获取的酶变体结构文件、Rosetta计算的能量数据，以及DTM与DGf,mut值对比的Excel表格，涉及LovD、LipA等多种酶变体，用于支撑酶热稳定性预测研究。文件详解 DTM_vs_DDGf_mut.xlsx 文件格式：XLSX...

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Microproteins_Based_二级三级结构预测方法研究数据

2026年1月23日 30 36 5

数据集概述本数据集为Microproteins二级和三级结构预测方法研究的配套数据，包含44个Microproteins的结构预测结果及相关分析文件。Microproteins是由小开放阅读框编码的小型蛋白质，当前其结构特征文献信息较少，数据集为填补该领域空白提供支持。文件详解压缩文件组（archive_files）文件名称：FASTA...

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MSA_NEFFy_Analysis_蛋白质与RNA多序列比对数据集

2026年1月25日 30 165 34

数据集概述本数据集包含用于NEFFy分析的多序列比对（MSA）数据，分为CASP15蛋白质数据集和rMSA RNA数据集两部分。其中CASP15数据集含93个蛋白质靶标的MSA，基于AlphaFold 2.3代码生成；rMSA数据集含361个RNA靶标的MSA，通过rMSA流程生成，总计2个压缩文件。文件详解 CASP15 MSAs (aln...

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AlphaFold_Structures_激酶融合蛋白β_指基序结构预测数据

2026年1月20日 30 147 29

数据集概述本数据集包含激酶融合蛋白的AlphaFold预测结构数据，核心围绕其广泛存在的扩展β-指基序展开。数据涵盖结构模型文件与置信度统计文件，可用于分析激酶融合蛋白的结构特征及相关生物信息学研究，总计包含六十个文件。文件详解 .json文件（40个）...

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iOBPdb_Archival_昆虫气味结合蛋白与挥发性有机化合物结合亲和力数据集

2026年1月15日 30 25 17

数据集概述本数据集是iOBPdb初始版本的存档数据，记录昆虫气味结合蛋白（OBP）对挥发性有机化合物（VOC）的结合亲和力信息。包含91种昆虫的382个独特OBP、622种VOC目标及181项功能研究数据，通过结构化文件整合相关生物信息与实验结果。文件详解...

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OCE_Supplementary_Material_真菌孤儿候选效应因子结构与进化研究数据

2026年1月12日 30 174 100

数据集概述本数据集为论文“Surface frustration re-patterning underlies the structural landscape and evolvability of fungal orphan candidate...

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博德特氏菌_Bordetella_pertussis_双功能pertactin_RTX融合抗原鼻内应用对小鼠气道黏膜保护作用的实验数据

2025年12月27日 30 83 55

数据集概述本数据集包含双功能pertactin-RTX融合抗原鼻内应用的小鼠实验相关数据，涉及荧光测定、免疫印迹、蛋白电泳及蛋白结构预测等实验结果，用于评估该融合抗原对小鼠气道黏膜抵抗百日咳杆菌定植的保护作用，共包含5个文件。文件详解荧光测定数据文件文件名称：DATA Fluorimetry.xlsx 文件格式：XLSX...

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高通量质谱实验衍生的直接物理蛋白质相互作用网络数据集_DirectContacts2

2025年12月21日 30 33 3

数据集概述该数据集为DirectContacts2研究论文的补充文件，包含基于高通量质谱实验预测的蛋白质直接相互作用的AlphaFold结构模型及交联数据，覆盖特定蛋白质二聚体、高阶复合物结构及关键相互作用位点信息。文件详解结构模型压缩包（.zip/.gz格式）：...

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模式生物VPS13蛋白AlphaFold预测结构数据集

2025年12月15日 30 155 85

数据集概述本数据集包含多种模式生物VPS13蛋白的AlphaFold预测结构。因蛋白较大，仅对部分序列进行预测，并通过PyMOL对齐结构，同时提供域组织摘要PDF文件，为研究VPS13蛋白结构提供数据支持。文件详解蛋白结构压缩文件（共22个，格式为.zip）：...

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无脊椎动物进化组蛋白染色质调控工具数据集

2025年12月10日 30 72 4

数据集概述本数据集包含无脊椎动物进化研究中组蛋白染色质调控的补充数据与代码，涉及基因组注释、组蛋白基因挖掘、表达分析等内容，支持对进化机制的深入研究。文件详解...

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AlphaFold在变质蛋白质上的应用数据集

2025年12月9日 30 121 97

数据集概述本数据集包含用于AlphaFold在变质蛋白质研究的五组蛋白质结构相关文件，涵盖蛋白质结构模型文件、可视化图片及压缩包，为研究变质蛋白质的结构预测与分析提供数据支持。文件详解压缩包文件: Application-of-AF-on-metamorphic-proteins.zip: ZIP格式压缩包，可能包含数据集的完整文件集合...

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人类跨膜蛋白预测与可视化数据集2022

2025年12月8日 30 32 31

数据集概述该数据集包含四百九十六个人类跨膜蛋白的三维结构及膜嵌入预测结果，基于AlphaFold结构与蛋白语言模型生成，按α螺旋和β桶结构分类存储，提供多方法膜嵌入预测及可视化工具。文件详解核心压缩包: TMvis496.tar.gz:...

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dyAb_基于AlphaFold驱动的预结合抗原的灵活抗体设计流匹配数据集

2025年12月6日 30 148 93

数据集概述该数据集围绕“dyAb”项目构建，聚焦于利用流匹配技术结合AlphaFold驱动的预结合抗原机制，实现灵活的抗体设计。数据以压缩包形式存储，未提供具体内容预览。文件详解文件名称: AAAI_data.zip 文件格式: ZIP (.zip) 内容说明: 压缩包内包含与“dyAb: Flow Matching for Flexible...

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MG_PDB和MGBench分子胶水三元结构预测基准数据集

2025年12月6日 30 42 24

数据集概述该数据集为MG-PDB & MGBench基准，包含分子胶水（MGs）三元复合物结构数据，用于评估AlphaFold 3等共折叠方法在分子胶水三元结构预测中的性能，支持相关计算方法的基准测试研究。文件详解数据文件: data.xlsx: Excel格式文件，可能包含分子胶水三元复合物结构的核心数据信息。压缩文件:...

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MetaInteractome功能与疾病富集分析数据集

2025年12月6日 30 49 18

数据集概述本数据集包含Meta-interactome（HuMMI）分析所用的全部脚本与输入数据，涵盖种间与种内互作研究，支持计算工作流的完整复现，涉及互作收敛分析、功能富集分析、性状富集分析等多类分析组件。文件详解文件名称: MetaInteractomeAnalysis.zip 文件格式: ZIP压缩包内容说明: 压缩包内包含完成Meta-...

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人类肠道噬菌体编码抗CRISPR蛋白发现数据集

2025年11月29日 30 61 33

数据集概述本数据集包含支持人类肠道微生物组中CRISPR-Cas系统与抗CRISPR（Acr）蛋白系统性识别和表征的补充表格。涵盖CRISPR-Cas系统检测、分类、系统发育分析，噬菌体编码Acr预测，Acr候选选择、功能验证及结构分析等核心内容。文件详解目录: Discovery of human gut phage-encoded Anti-...