无脊椎动物进化组蛋白染色质调控工具数据集

数据集概述

本数据集包含无脊椎动物进化研究中组蛋白染色质调控的补充数据与代码,涉及基因组注释、组蛋白基因挖掘、表达分析等内容,支持对进化机制的深入研究。

文件详解

  • 01-Updated_genomes.tar.gz:包含三个物种的基因组注释文件及基因模型,如物种基因组注释报告(Excel)、基因组注释(GFF3)、转录本/CDS/蛋白序列(FASTA)等
  • 02-Histone_genes_mining.tar.gz:含核心组蛋白基因模型(GFF3)及mRNA、蛋白序列(FASTA)
  • 03-Histone_genes_orthology_assignment.tar.gz:多序列比对文件(FASTA、NEXUS、PDF)及组蛋白序列差异报告(DOCX、PDF)
  • 04-Gene_expression_profiling.tar.gz:基因表达矩阵(TXT),含TPM及DESeq2归一化数据
  • 05-Evolutionary_analysis_H2AX_variants.tar.gz:H2A.X变体进化分析的多序列比对文件(FASTA、ALN、PDF)
  • 06-Histone_modifier_genes_orthology_assignment.tar.gz:组蛋白修饰酶基因比对文件(FASTA、NEXUS、PDF)
  • 07-PRMT6_sequence_architecture_analysis.tar.gz:PRMT6序列保守性分析的比对文件(FASTA、NEXUS、PDF)
  • 08-AlphaFold_Server_predictions.tar.gz:未明确具体内容,推测为蛋白结构预测相关数据
  • 00-Code.zip:自定义代码文件

适用场景

  • 基因组学研究:分析无脊椎动物基因组注释及组蛋白基因模型
  • 进化生物学研究:探究组蛋白染色质调控工具的进化机制
  • 基因表达分析:研究无脊椎动物发育过程中的基因表达模式
  • 蛋白序列分析:分析组蛋白及修饰酶的序列保守性与变异
  • 生物信息学应用:复现组蛋白基因挖掘、表达谱分析等流程
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 272.68 MiB
最后更新 2025年12月10日
创建于 2025年12月10日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。