-
Allium_野生洋葱染色体数目演化研究数据集
2026年2月1日 30 9 6
数据集概述 本数据集围绕野生洋葱（Allium属，石蒜科）的染色体数目演化展开研究，涵盖分子系统发育分析、染色体数目变化模型推断等核心内容，包含系统发育重建用序列文件、染色体演化分析控制文件、附录文档及补充图表等18个文件，为植物多倍体演化机制研究提供支撑。 文件详解 文档类文件...
-
deMEM_Based_可扩展多序列比对框架测试数据
2026年1月31日 30 93 81
数据集概述 本数据集包含用于测试deMEM框架的相关文件，deMEM是一种基于de Bruijn图的分治框架，用于可扩展的多序列比对。数据集共包含四个文件，无目录结构，主要为压缩格式的测试数据和程序包。 文件详解 demem_test_data.tar.xz 文件格式：XZ压缩文件 内容说明：deMEM框架的测试数据压缩包...
-
CREMSA_Based多序列比对压缩索引论文支持数据
2026年1月31日 30 188 2
数据集概述 本数据集为论文“CREMSA: Compressed Indexing of (Ultra) Large Multiple Sequence...
-
Copepod_Based_桡足类光感受分子特征研究数据
2026年1月30日 30 113 55
数据集概述 本数据集围绕桡足类甲壳动物视觉的分子机制展开，通过12个分类多样的桡足类物种的RNA测序数据，识别光转导基因，分析视蛋白基因的进化特征，包括中波长敏感视蛋白、翼视蛋白等类型，以及部分物种的视蛋白表达差异。数据集包含5个相关文件，支持桡足类视觉分子层面的研究。 文件详解 文件名称：CopepodOpsinNewick.result...
-
Salmo_ischchan_塞凡湖鳟鱼基因组进化研究数据
2026年1月30日 30 98 33
数据集概述 本数据集为塞凡湖鳟鱼（Salmo ischchan）物种群进化研究的基因组数据，包含6个文件，涵盖线粒体DNA多序列比对、核基因SNP数据、进化分析相关的数据文件及说明文档，支持系统发育树构建、群体结构分析、基因流检测等进化生物学研究，助力解析塞凡湖鳟鱼物种群的形成机制与进化历史。 文件详解 核基因SNP数据文件...
-
Tabanidae_Based马蝇分子系统发育分类学研究数据
2026年1月29日 30 140 63
数据集概述 本数据集为马蝇（Tabanidae科）分子系统发育研究相关数据，包含110个代表性物种的4个基因（线粒体CO1、核基因28S、CAD和AATS）核苷酸数据，覆盖Tabanidae科所有常见族及Tabanomorpha外类群，用于重建系统发育关系并估计分化时间，为马蝇分类学修订提供框架。 文件详解...
-
Rhagoletis_Based_生态适应与生殖隔离研究数据
2026年1月29日 30 168 61
数据集概述 本数据集为Rhagoletis pomonella宿主种族生态适应与生殖隔离研究相关数据，包含遗传及表型证据。研究聚焦美国南部四种本土山楂属宿主植物上该物种的宿主种族形成，涉及微卫星种群调查、羽化研究及线粒体DNA比对等内容，共包含3个文件，支持生态物种形成伴随基因流的机制分析。 文件详解...
-
SATé_II_Based_多序列比对与系统发育树估计数据集
2026年1月29日 30 72 50
数据集概述 本数据集包含SATé-II算法相关的多序列比对与系统发育树估计数据，支持对该算法在速度、比对准确性及系统发育树准确性方面的研究。SATé-II是一种元方法，可提升现有多序列比对方法的质量，适用于分析大型数据集，数据集包含4个文件，涵盖说明文档与压缩包。 文件详解 说明文档（.txt格式）...
-
RoseTTAFold_Based_蛋白质突变效应预测研究数据
2026年1月29日 30 34 10
数据集概述 本数据集为“Mutation Effect Prediction of Proteins using RoseTTAFold”研究提供支持，包含目标多序列比对（MSAs）、RoseTTAFold预测的蛋白质结构（PDBs）、实验值CSV文件及论文发表的预测结果，共4个文件，用于蛋白质突变效应的预测与分析。 文件详解...
-
CView_Based_HIV序列比对可视化工具测试用例数据集
2026年1月29日 30 176 20
数据集概述 本数据集是CView工具的测试用例数据，包含从Los Alamos HIV序列数据库下载的北美B亚型gp120序列，其中CCR5-使用型序列636条、CXCR4-使用型序列76条，经CView处理和MUSCLE比对后整合为压缩文件，用于验证CView工具的序列可视化功能。 文件详解 文件名称：USE_CASE_DATA.zip...
-
CREMSA_Based_论文补充数据集_生物信息学_2025
2026年1月28日 30 150 125
数据集概述 本数据集为论文“CREMSA: Compressed indexing of (ultra) large alignments”的补充数据，包含三个用于验证研究可重复性的数据集：人工生成的随机数据集、HIV1基因组多序列比对数据集和主要促进子超家族蛋白质序列比对数据集。 文件详解...
-
MTBFG_Based_哺乳动物蜱传黄病毒重组事件首次定年研究数据
2026年1月27日 30 78 14
数据集概述 本数据集围绕哺乳动物蜱传黄病毒组（MTBFG）的重组事件研究，包含病毒基因组序列、系统发育分析文件及贝叶斯推断文件等，首次为MTBFG内重组事件提供时间定年证据，涉及重组株、亲本株及断点的统计验证与进化分析，共含35个文件。 文件详解 基因组序列文件（.fas格式，16个）...
-
Syma_Based新几内亚翡翠鸟海拔梯度物种形成与基因流研究数据
2026年1月27日 30 75 56
数据集概述 本数据集围绕新几内亚Syma属翡翠鸟展开，聚焦海拔梯度下的物种形成与基因流研究。包含基因组变异、线粒体DNA序列、系统发育树及序列存档信息等6份文件，用于验证梯度物种形成假说，分析物种分化过程中选择压力与基因流的作用，为热带山地生物多样性起源研究提供数据支持。 文件详解 压缩数据文件...
-
Apoptosis_Network_Based祖先凋亡网络进化研究数据
2026年1月26日 30 5 1
数据集概述 本数据集围绕祖先凋亡网络的复杂性展开，基于对刺胞动物、线虫、昆虫、海胆、文昌鱼等无脊椎动物基因组的分析，揭示凋亡相关蛋白家族（如Apaf-1、Bcl-2、caspase）的进化历程，包括祖先多 paralog 现象、线虫/昆虫的基因丢失及脊椎动物的扩张，挑战了简单祖先网络的传统范式。 文件详解 序列与比对文件...
-
-
PaHMM_Tree_Based系统发育树估算方法与基准测试补充数据
2026年1月25日 30 133 64
数据集概述 本数据集为系统发育树估算方法研究的补充资料，包含PaHMM-Tree（一种无需单一比对的邻接法）的开发及基准测试结果。通过模拟数据对比该方法与传统两步法（多序列比对+树推断）、无比对距离法的性能，分析不同序列分歧度下各方法的准确性差异，是进化生物学与生物信息学研究的参考数据。 文件详解 文件名称：PaHMM-...
-
MSA_NEFFy_Analysis_蛋白质与RNA多序列比对数据集
2026年1月25日 30 31 15
数据集概述 本数据集包含用于NEFFy分析的多序列比对（MSA）数据，分为CASP15蛋白质数据集和rMSA RNA数据集两部分。其中CASP15数据集含93个蛋白质靶标的MSA，基于AlphaFold 2.3代码生成；rMSA数据集含361个RNA靶标的MSA，通过rMSA流程生成，总计2个压缩文件。 文件详解 CASP15 MSAs (aln...
-
Polyploidy_Database_多倍体植物物种形成速率研究数据
2026年1月23日 30 152 67
数据集概述 本数据集围绕多倍体植物的宏观进化影响展开，包含数百个多倍化事件的分析结果，验证了多倍体植物相较于二倍体植物具有更低的物种形成速率和更高的灭绝速率的结论。数据集包含2个文件，涵盖植物多倍体演化速率相关的数据库及说明文档。 文件详解 README_for_polyploidy_database.txt 文件格式：TXT...
-
Cerapachys_biroi_Based克隆掠夺者蚂蚁基因组研究数据
2026年1月22日 30 154 84
数据集概述 本数据集为无 queen 克隆掠夺者蚂蚁 Cerapachys biroi 的基因组相关数据，该蚂蚁是研究昆虫社会分工分子调控的重要模型。数据集包含基因序列、进化树及基因列表等文件，支持对其繁殖方式、社会行为相关基因的分析，共5个文件。 文件详解 进化树文件（.tre） 文件名称：CYPs_573.tre、UGTs_321.tre...
-
ENSEMBLsim_Based_多序列比对平均化系统发育重建研究数据集
2026年1月22日 30 115 112
数据集概述 本数据集为论文“Multiple sequence alignment averaging improves phylogeny...
