数据集概述
本数据集围绕哺乳动物蜱传黄病毒组（MTBFG）的重组事件研究，包含病毒基因组序列、系统发育分析文件及贝叶斯推断文件等，首次为MTBFG内重组事件提供时间定年证据，涉及重组株、亲本株及断点的统计验证与进化分析，共含35个文件。
文件详解
- 基因组序列文件（.fas格式，16个）
- 命名示例：ALN2_NS4B.fas、E_161.fas、ALN2_PrM.fas
- 内容：包含MTBFG病毒不同基因片段（如NS4B、E蛋白、PrM、C蛋白等）的多序列比对或单序列文件，用于序列分析与进化研究
- 贝叶斯推断文件（.xml格式，14个）
- 命名示例：Beast_inference1_NS1.xml、Beast_inference3.xml、Beast_inference4_E_161_tree.nex
- 内容：贝叶斯进化分析工具输入文件，涉及NS1、NS3、NS4A等基因片段的进化推断，包含模型参数与分析设置
- 系统发育树文件（.nex格式，5个）
- 命名示例：Figure3_b_BI.nex、Figure3_a_ML.nex、Beast_inference4_E_161_tree.nex
- 内容：基于贝叶斯推断（BI）或最大似然法（ML）构建的系统发育树文件，用于展示病毒株的进化关系与重组事件位置
数据来源
论文“First dating of a recombination event in mammalian tick-borne flaviviruses”
适用场景
- 病毒进化研究: 分析哺乳动物蜱传黄病毒组的重组机制、进化动态及物种间传播路径
- 重组事件验证: 利用序列比对与系统发育文件，验证MTBFG内重组事件的存在及断点位置
- 病毒进化时间定年: 通过贝叶斯推断文件研究重组事件的发生时间窗口，解析病毒进化历史
- 分子流行病学分析: 基于病毒基因序列文件，探究MTBFG病毒的基因多样性与传播规律
