CView_Based_HIV序列比对可视化工具测试用例数据集

数据集概述

本数据集是CView工具的测试用例数据,包含从Los Alamos HIV序列数据库下载的北美B亚型gp120序列,其中CCR5-使用型序列636条、CXCR4-使用型序列76条,经CView处理和MUSCLE比对后整合为压缩文件,用于验证CView工具的序列可视化功能。

文件详解

  • 文件名称:USE_CASE_DATA.zip
  • 文件格式:ZIP
  • 字段映射介绍:压缩包内包含经CView处理的HIV gp120 B亚型序列数据,包括CCR5-使用型和CXCR4-使用型序列的未比对文件、序列标题文件,以及两者合并后经MUSCLE比对的序列文件(具体字段需解压后查看原始序列格式)。

数据来源

Los Alamos HIV序列数据库、论文“CView: A network based tool for enhanced alignment visualization”

适用场景

  • 生物信息学工具测试: 用于验证CView工具的序列加载、保存及可视化功能。
  • HIV序列分析: 研究北美B亚型HIV gp120序列的受体使用特性(CCR5/CXCR4)。
  • 多序列比对验证: 验证MUSCLE工具对HIV序列的比对效果及结果可靠性。
  • 序列可视化方法研究: 探索基于网络的序列比对可视化工具的应用场景与性能。
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 0.11 MiB
最后更新 2026年1月29日
创建于 2026年1月29日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。