数据集概述
本数据集为论文配套的ColabFold建模原始输出,核心内容是C21ORF2蛋白与NEK1疾病突变域相互作用的结构预测结果,包含蛋白质结构模型文件、评估图表及相互作用残基列表,为研究两者功能关联提供结构数据支持。
文件详解
- 蛋白质结构模型文件(共5个,PDB格式):
- NEK11160endC21ORF2_amber_2e60f_relaxed_rank_1_model_1_fixed.pdb:Rank 1模型
- NEK11160endC21ORF2_amber_2e60f_relaxed_rank_2_model_2_fixed.pdb:Rank 2模型
- NEK11160endC21ORF2_amber_2e60f_relaxed_rank_3_model_4_fixed.pdb:Rank 3模型
- NEK11160endC21ORF2_amber_2e60f_relaxed_rank_4_model_3_fixed.pdb:Rank 4模型
- NEK11160endC21ORF2_amber_2e60f_relaxed_rank_5_model_5_fixed.pdb:Rank 5模型
- 结构评估图表文件(共3个,PNG格式):
- NEK11160endC21ORF2_amber_2e60f_coverage.png:MSA序列覆盖度图表
- NEK11160endC21ORF2_amber_2e60f_PAE.png:各模型的预测对齐误差(PAE)图表
- NEK11160endC21ORF2_amber_2e60f_plddt.png:每个位置的预测IDDT图表
- 补充文件(1个,XLSX格式):
- Supplementary Excel file 1.xlsx:基于各模型PDB文件预测的分子间相互作用残基列表及作用类型(使用BIOVIA Discovery Studio 2021生成)
适用场景
- 结构生物学研究:分析C21ORF2与NEK1疾病突变域的相互作用模式
- 分子功能机制研究:探究两者相互作用对NEK1功能的影响
- 蛋白质结构预测验证:评估ColabFold模型在疾病相关蛋白互作中的预测性能
- 药物靶点研究:识别潜在的互作调控位点,为靶向药物开发提供结构依据