C21ORF2与NEK1疾病突变域相互作用ColabFold建模原始输出数据集

数据集概述

本数据集为论文配套的ColabFold建模原始输出,核心内容是C21ORF2蛋白与NEK1疾病突变域相互作用的结构预测结果,包含蛋白质结构模型文件、评估图表及相互作用残基列表,为研究两者功能关联提供结构数据支持。

文件详解

  • 蛋白质结构模型文件(共5个,PDB格式):
  • NEK11160endC21ORF2_amber_2e60f_relaxed_rank_1_model_1_fixed.pdb:Rank 1模型
  • NEK11160endC21ORF2_amber_2e60f_relaxed_rank_2_model_2_fixed.pdb:Rank 2模型
  • NEK11160endC21ORF2_amber_2e60f_relaxed_rank_3_model_4_fixed.pdb:Rank 3模型
  • NEK11160endC21ORF2_amber_2e60f_relaxed_rank_4_model_3_fixed.pdb:Rank 4模型
  • NEK11160endC21ORF2_amber_2e60f_relaxed_rank_5_model_5_fixed.pdb:Rank 5模型
  • 结构评估图表文件(共3个,PNG格式):
  • NEK11160endC21ORF2_amber_2e60f_coverage.png:MSA序列覆盖度图表
  • NEK11160endC21ORF2_amber_2e60f_PAE.png:各模型的预测对齐误差(PAE)图表
  • NEK11160endC21ORF2_amber_2e60f_plddt.png:每个位置的预测IDDT图表
  • 补充文件(1个,XLSX格式):
  • Supplementary Excel file 1.xlsx:基于各模型PDB文件预测的分子间相互作用残基列表及作用类型(使用BIOVIA Discovery Studio 2021生成)

适用场景

  • 结构生物学研究:分析C21ORF2与NEK1疾病突变域的相互作用模式
  • 分子功能机制研究:探究两者相互作用对NEK1功能的影响
  • 蛋白质结构预测验证:评估ColabFold模型在疾病相关蛋白互作中的预测性能
  • 药物靶点研究:识别潜在的互作调控位点,为靶向药物开发提供结构依据
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 2.74 MiB
最后更新 2025年12月23日
创建于 2025年12月23日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。