数据集 - 海数据

chemoinformatics与计算药物化学数据集

2025年12月22日 30 139 107

数据集概述本数据集是实验室开发的免费注释化合物数据集与软件工具的一部分，用于 chemoinformatics 与计算药物化学领域。原始版本已发表，更新版本将在后续数据笔记中说明，提供相关研究的数据支持。文件详解文件类型：均为.zip格式，共32个压缩文件...

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单模板配体法发现小分子核酸结合剂评估数据集

2025年12月22日 30 37 9

数据集概述该数据集包含16种分子指纹与6种单模板配体虚拟筛选方法的基准测试结果，针对多组DNA/RNA配体数据，涵盖性能指标、统计分析及评估代码，用于核酸靶向药物发现的分子指纹与相似性度量研究。文件详解文件名称: filipsPL/rna-ligand-based-0.2.2.zip 文件格式: ZIP（压缩文件）内容说明:...

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ABCD化学子结构搜索SMARTS查询数据集

2025年12月22日 30 109 96

数据集概述该数据集包含来自《ABCD化学子结构搜索SMARTS查询》论文表2的四十六条SMARTS查询，用于大型化学库的高效子结构搜索。数据集提供原始表格PDF、包含概述、表数据及ID映射的电子表格，以及详细说明文档，支持化学信息学领域的子结构搜索研究与应用。文件详解文档文件：...

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PDBQT_1_0_0_Based_分子结构研究完整数据

2025年12月20日 30 33 10

数据集概述该数据集为PDBQT v1.0.0版本，包含62个文件，无目录层级。核心文件为58个.pdbqt格式的分子结构文件，涵盖多种化合物，同时包含图片、文档及应用程序文件，为分子结构相关研究提供数据支持。文件详解核心分子结构文件（.pdbqt格式，共58个）：...

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GNN_Trained_Models_Based_图神经网络模型训练完整数据

2025年12月20日 30 34 11

数据集概述本数据集包含在特定目标和数据集上训练的图神经网络（GNN）模型文件，涉及Sun等人数据集（目标为AR、ER、ED）和Tox21数据集（基于旧版本训练），使用Chemprp 1.x工具训练，以压缩包形式存储。文件详解文件名称: dmpnn_trained_models.zip 文件格式: ZIP压缩包（.zip）内容说明:...

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PocketVina分子对接研究数据集

2025年12月19日 30 18 11

数据集概述本数据集为PocketVina分子对接框架相关研究资料，包含研究结果压缩文件及TargetDock-AI基准数据集。PocketVina可实现高效物理有效对接，数据集支持相关算法性能验证与分析，助力药物发现领域研究。文件详解...

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BAZ2B溴结构域Zenobia片段库筛选PanDDA分析数据集

2025年12月19日 30 130 52

数据集概述本数据集为BAZ2B溴结构域通过X射线晶体学筛选Zenobia片段库的PanDDA分析结果，包含分析说明文档、元数据、模型、数据及参考文件，支持对该筛选实验的结果解读与复现。文件详解文件名称: README.txt 文件格式: .txt 内容说明:...

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经典半乳糖血症药物发现靶点赋能包_GALT_GALK1

2025年12月18日 30 34 16

数据集概述本数据集是针对经典半乳糖血症（一种罕见的半乳糖代谢紊乱疾病，目前缺乏疾病转化疗法）的药物发现计划靶点赋能包（TEP）。包含蛋白质试剂、生物物理分析方法及结构信息，支持理解GALT酶缺陷的分子机制，以及探索通过干预上游GALK1酶（底物减少策略）缓解GALT缺陷的化学起点。文件详解文件名称:...

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急性低氧应激缓解化合物识别的表型推动平台数据集

2025年12月10日 30 99 54

数据集概述该数据集围绕急性低氧应激缓解的化合物识别展开，基于"表型推动"平台的研究成果。平台通过高内涵表型筛选，识别可加速细胞向低氧适应状态转变的化合物，涉及mTOR/PI3K或BET抑制策略，相关化合物可提升缺血样应激下肝细胞存活及心肌细胞低氧应激修复能力。文件详解文件名称: README.md，文件格式: Markdown，内容:...

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PharmAlchemy项目元数据与本体标准化数据集

2025年12月10日 30 105 3

数据集概述该数据集为PharmAlchemy项目提供支持，聚焦于将DisGeNET、STRING、DrugBank和SIDER等公共生物医学数据库整合并标准化为统一格式，助力基因-疾病-药物-副作用关系的发现，支持生物医学和药物发现研究的互操作性数据分析流程。文件详解...

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多药耐药细菌新药靶点生物信息学识别补充数据集

2025年12月15日 30 197 115

数据集概述本数据集为多药耐药细菌新药靶点生物信息学识别研究的补充数据，包含两个核心部分：基于CD-HIT工具聚类的高序列相似性蛋白质簇数据，以及各蛋白质簇的序列比对文件，为耐药细菌靶点研究提供支撑。文件详解 Dataset D1.csv: CSV格式文件，包含CD-...

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肉桂生物活性化合物对葡萄糖调节蛋白的机制效应数据集

2025年12月15日 30 129 38

数据集概述本数据集支持关于肉桂生物活性化合物与葡萄糖调节蛋白（GLP-1R、DPP-4、SGLT2）相互作用的研究，包含分子对接分数、结合构象、分子动力学模拟轨迹及相关分析数据，用于探索肉桂来源抗糖尿病化合物的作用机制。文件详解文件名称: MDS_GLP1R.zip，文件格式: ZIP压缩包，包含与GLP-1R蛋白相关的分子动力学模拟数据...

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整合蛋白质_配体相互作用数据库_IPLID

2025年12月13日 30 194 87

数据集概述该数据集为整合蛋白质-配体相互作用数据库（IPLID），整合了BindingDB、ChEMBL等多源数据，包含蛋白质-配体相互作用数据（数值或二进制标签）、配体结构相似性（Tanimoto系数）、蛋白质序列相似性等信息，支持机器学习项目检索与基准测试开发。文件详解数据压缩包文件：...

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心脏离子通道小分子活性综合数据集

2025年12月12日 30 36 15

数据集概述该数据集是一个面向药物发现领域的综合数据库，涵盖hERG、Nav1.5和Cav1.2三种心脏离子通道的小分子活性数据。数据以压缩文件形式组织，每个离子通道目标包含开发集（含训练/验证子集）及两个不同结构相似度阈值的外部测试集，为离子通道毒性预测模型的构建与评估提供标准化数据支持。文件详解压缩文件: dataset.rar:...

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Molecular_Docking_Based_COVID_19药物分子对接完整数据

2025年12月8日 30 55 32

数据集概述该数据集围绕2019冠状病毒病（COVID-19）的药物发现展开，核心内容为分子对接相关数据。数据集以压缩包形式存储，未提供文件内容预览，整体结构简洁，未进行训练/测试、数据/标签或原始/处理等数据拆分。文件详解文件名称: Molecular docking.zip 文件格式: ZIP (.zip) 内容说明:...

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ePharmaLib结构基药效团库数据集

2025年12月8日 30 79 25

数据集概述该数据集是ePharmaLib库，包含一万五千一百四十八个能量优化的结构基药效团（e-pharmacophores），每个药效团含3至8个特征，用于反向药效团筛选研究药物多药理学特性，支持药物发现研究。文件详解 ePharmaLib_PHASE.zip：ZIP格式压缩文件，为Schrödinger’s PHASE程序设计的药效团库...

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相对自由能计算基准数据集2018

2025年12月6日 30 65 58

数据集概述本数据集为相对自由能计算提供基准，包含CDK8、c-Met、Eg5、Hif2a、PFKFB3、SHP2、SYK、TNKS2等靶点相关的基准数据，由Merck KGaA研究人员创建，用于相关计算方法的验证与评估。文件详解文件名称：fep-benchmark-v3.zip 文件格式：ZIP压缩包...

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BAZ2B与Zenobia片段库筛选的PanDDA分析交互式摘要数据集

2025年12月6日 30 153 59

数据集概述本数据集为BAZ2B蛋白与Zenobia片段库筛选的PanDDA分析结果，提供交互式摘要页面。包含结构数据文件、图像文件、网页文件及相关脚本，支持对分子筛选结果的可视化与交互分析。文件详解交互式网页文件： 0_index.html：HTML格式，为数据集的交互式摘要入口页面，可点击访问完整分析内容...