找到71个数据集

格式: ZIP 标签: 进化树

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  • 蓝斑蝶系列同源眼斑起源研究数据

    2026年2月12日 30 128 115

    数据集概述 本数据集围绕蛱蝶翅膀上系列重复眼点的起源展开研究,通过分析400余种物种,提出眼点最初以少量模块形式出现在腹面后翅,后被重新部署到背面和前翅表面,而非传统认为的完整未分化单元行。数据支持眼点从简单单色斑点进化而来,且背面眼点的晚出现表明其功能从防御捕食者扩展至性信号传递。 文件详解 文件名称:MatricesAndTrees.zip...
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  • 基于安第斯山脉植物的传粉综合征研究数据

    2026年2月10日 30 31 14

    数据集概述 本数据集聚焦安第斯山脉centropogonid植物分支的授粉综合征进化研究,包含该分支约550种被子植物的传粉者(蜂鸟、蝙蝠)适应特征、进化树结构及相关分析代码,验证了授粉综合征的形态分化与多次独立演化事件,支持传粉者选择驱动花形态多样性的结论。 文件详解 进化树文件...
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  • 水稻转录组中病毒多样性的深度分析数据集

    2026年2月9日 30 124 8

    数据集概述 本数据集基于17,115个水稻转录组RNA-seq文库,覆盖24个稻属物种及51个国家样本,通过从头组装和同源性方法鉴定出810个完整或近完整病毒,包括276种已知病毒和534种新型病毒。数据还包含病毒分类注释及与水稻密切相关的427种病毒筛选结果,为水稻病毒病防控提供新见解。 文件详解 压缩文件(Archive files)...
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  • RADseq_植物标本双酶切测序协议评估数据

    2026年2月1日 30 1 0

    数据集概述 本数据集围绕植物标本基因组测序展开,评估了双酶切RADseq协议在腊叶标本与硅胶干燥标本中的适用性。覆盖Draba、Boechera、Solidago、Ilex四个属,包含实验结果、分析文件及附录文档,为植物分类研究提供基因组数据支持。 文件详解 文本文件(.txt)...
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  • MHC_Based_脊椎动物MHC基因配偶选择偏好定量综述数据

    2026年2月9日 30 141 106

    数据集概述 本数据集为MHC基因配偶选择偏好的定量综述研究数据,聚焦脊椎动物MHC多样性和相似性在配偶选择中的作用。通过系统发育元分析和元回归技术,整合四十年实证文献,评估MHC依赖配偶选择的效应量,揭示不同分类群、基因座特征对选择偏好的影响,包含数据集、分析代码及进化树文件。 文件详解 数据文件 文件名称:Datasets.xlsx...
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  • 海伦科尼斯增强型蝴蝶翅膀图案的进化基因数据

    2026年2月1日 30 150 8

    数据集概述 本数据集围绕亚马逊Heliconius蝴蝶复杂翅膀图案的进化起源展开,包含142个个体(涉及17个物种)的基因组序列数据,聚焦与dennis和ray两种红色图案元素相关的非编码序列调控模块,通过系统发育分析揭示其进化历史及重组机制,为研究形态创新的遗传基础提供支持。 文件详解 压缩文件...
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  • TreeBASE_系统发育最优树搜索改进研究数据

    2026年2月1日 30 21 19

    数据集概述 本数据集为系统发育研究相关数据,聚焦于寻找分类群最优进化历史的计算问题,提出通过兼容特征子集的锚定树约束搜索空间、降低精确启发式搜索步骤的方法,并使用四个生物数据集及TreeBASE库中四百个数据集验证了方法有效性。 文件详解 文件名称:script.zip 文件格式:ZIP...
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  • Timema_project_孤雌生殖进化分析中间数据

    2026年1月31日 30 202 132

    数据集概述 本数据集包含Timema竹节虫孤雌生殖进化分析过程中产生的关键中间文件,涵盖基因序列、进化树、直系同源群压缩包及格式化文本等类型,共七个文件,用于支持昆虫孤雌生殖进化机制的研究。 文件详解 基因序列文件(.fasta格式) 文件名称:trimmed_onesp_COIseqs_def.fasta、all_COIseqs.fasta...
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  • BQH_Based_微生物适应性基因丢失与依赖进化数据

    2026年1月30日 30 179 70

    数据集概述 本数据集为论文《The Black Queen Hypothesis: evolution of dependencies through adaptive gene...
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  • 热应激响应实验_水生无脊椎动物物种复合体热耐受性差异数据

    2026年1月30日 30 28 15

    数据集概述 本数据集围绕萼花臂尾轮虫(Brachionus calyciflorus)物种复合体开展,通过47个克隆的nuITS1和mtCOI标记鉴定进化支系(B. calyciflorus sensu stricto和B....
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  • Lemmus_Based_挪威旅鼠古DNA进化历史研究数据

    2026年1月30日 30 165 38

    数据集概述 本数据集为研究挪威旅鼠(Lemmus lemmus)起源的古DNA分析数据,包含17个文件,涵盖BEAST输入文件、MrBayes输入文件、进化树注释结果、序列比对数据集等,用于探究该物种在晚更新世至全新世的进化历史及冰期避难所生存证据。 文件详解 BEAST分析文件...
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  • Loricarioidei_基于进化研究_鲶鱼躯干牙组织数据

    2026年1月29日 30 23 9

    数据集概述 本数据集聚焦鲶鱼(尤其是Loricarioidei类群)躯干牙组织(odontodes)的进化研究,包含系统发育分析相关的基因序列、比对文件、进化树及序列信息表,用于探究躯干牙组织与真皮骨板的进化关系及牙组织形成机制。 文件详解 文件名称:Trees.tar 文件格式:TAR...
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  • SARS_CoV_2_疫苗突破性病例及抗体耐药变异株相关数据

    2026年1月29日 30 52 50

    数据集概述 本数据集为论文“Predominance of antibody-resistant SARS-CoV-2 variants in vaccine breakthrough cases from the San Francisco Bay Area,...
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  • ToL_web_Based_生命之树生物多样性与进化历史数据

    2026年1月29日 30 48 8

    数据集概述 本数据集来自Tree of Life(ToL)项目,该项目由全球生物学家协作开展,通过超一万个网页提供地球生物多样性、进化历史(系统发育)及物种特征信息。数据以进化树形式层级链接,展示所有生物的遗传关联,未来将聚焦超物种分类单元及物种间系统发育关系的内容收集。 文件详解 文件名称:204.xml 文件格式:XML 字段映射介绍:作为Tree...
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  • FMDV_Based_O型口蹄疫病毒持续感染牛基因组突变研究数据

    2026年1月28日 30 153 32

    数据集概述 本数据集为Litz等人研究的附加数据,聚焦O型口蹄疫病毒(FMDV)在牛持续感染过程中的基因组突变。包含7个文件,涵盖序列比对、元数据、进化树等类型,记录病毒基因组变异、样本信息及实验关联数据,支持病毒基因组进化与持续感染机制研究。 文件详解 CSV文件(共2个) 文件名称:NT_alignment_FMDV_ORF_consensus-...
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  • mtIdh_Pogonus_chalceus甲虫种群进化历史数据

    2026年1月27日 30 209 87

    数据集概述 本数据集围绕大西洋欧洲沿岸Pogonus chalceus甲虫的mtIdh基因进化历史展开,包含该基因座的序列变异、种群分布及相关分析脚本。通过比较短翅与长翅种群在异地和同域尺度下的mtIdh等位基因差异,揭示适应性进化机制,为研究扩散相关性状的局部适应和种群动态提供支持,共含4个文件。 文件详解 Tree_files.rar...
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  • Interspecific_种间性二态性多变量表型异速生长分析数据

    2026年1月27日 30 22 19

    数据集概述 本数据集为进化生物学研究数据,围绕种间性二态性的异速生长趋势展开,涵盖多变量性表型的宏观进化分析及对伦施法则的应用验证。包含代码、数据、文档等4类文件,支持研究种间性二态性与体型大小的异速生长关系,为理解相关进化过程提供数据基础。 文件详解 代码文件: 文件名称:Simul-RRMethod.r 文件格式:R...
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  • Tigriopus_Based加州哲水蚤异域进化转录组分化研究数据

    2026年1月27日 30 17 11

    数据集概述 本数据集围绕海洋桡足类加州哲水蚤(Tigriopus californicus)的异域进化展开,包含转录组全基因组分化与多态性的分析数据。通过对不同分化阶段的种群进行比较,探究非适应性过程(如遗传漂变)与适应性进化对基因组分化模式的影响,揭示进化在基因层面的可预测性。数据集含16个文件,涵盖说明文档与压缩包两类。 文件详解...
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  • Tasdighian_S_2025_植物全基因组倍增检测补充数据集

    2026年1月27日 30 81 63

    数据集概述 本数据集是论文《Using reciprocally retained gene families to detect whole-genome multiplications in plants》的补充数据,包含研究中计算分析的输入与输出文件,涉及植物全基因组倍增检测相关的基因家族分析、统计模型等内容,共8个文件。 文件详解...
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  • CHIKVnext_Based基孔肯雅病毒分子进化与全球传播研究数据

    2026年1月26日 30 64 36

    数据集概述 本数据集是基于Nextstrain平台构建的交互式资源CHIKVnext的核心数据,聚焦基孔肯雅病毒(CHIKV)的分子进化与全球传播研究,包含3个JSON格式文件,为病毒进化分析提供基础数据支持。 文件详解 文件名称:CHIKV_root-sequence.json 文件格式:JSON...
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