找到39个数据集

标签: 原子坐标

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  • 基于进化信息数据的蛋白质界面残基相互作用预测

    2026年2月1日 30 154 14

    数据集概述 本数据集围绕蛋白质界面残基相互作用预测展开,基于进化信息分析氨基酸序列协变性,验证其在已知结构蛋白质复合物中的接触预测效果,并对未知结构复合物进行预测建模。包含8个文件,涵盖蛋白质结构文件与序列比对压缩包,用于支撑蛋白质复合物结构预测研究。 文件详解 .pdb格式文件(共4个)...
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  • SFXC_PBE_U_J_材料磁结构计算对比数据

    2026年2月1日 30 120 20

    数据集概述 本数据集包含论文arXiv:2310.00114研究中探索的材料的输入与输出磁结构数据。输入磁矩基于中子衍射测量的自旋方向随机初始化,每个随机试验对应一个字典键,子字典记录PBE+U+J与源无关交换关联(SFXC)约束下的收敛结构,所有结构为序列化pymatgen Structure对象。 文件详解...
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  • 支持性信息_基于云的自动化多参考反应机制探索数据

    2026年2月1日 30 38 0

    数据集概述 本数据集是期刊文章《云端高通量从头算反应机理探索与自动化多参考处理》的支持信息,包含反应探索中的结构数据与能量数据。数据通过去重处理提供3335个独特结构,以及2227个基元反应步骤的能量计算结果,可用于分析反应路径、能量变化及催化过程。 文件详解 structures.json(JSON格式)...
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  • XK_VPS13A_Based膜蛋白相互作用结构预测数据

    2026年1月30日 30 75 50

    数据集概述 本数据集包含脂质 scramblase XK与脂质转移蛋白VPS13A在质膜上相互作用的相关文件,涉及Alphafold预测的VPS13A蛋白结构、XK与VPS13A C端的多聚体相互作用预测,以及图表对应的表格数据,支持相关预印本和出版物的研究验证。 文件详解 蛋白结构预测文件(.pdb格式,共3个)...
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  • GAP_20_磷_GAP_20机器学习力场参数与参考数据库

    2026年1月30日 30 144 6

    数据集概述 本数据集包含论文“A general-purpose machine-learning force field for bulk and nanostructured phosphorus”(待发表)中描述的磷的机器学习力场参数文件及参考数据库,共5个文件,涵盖.xml、.xyz等格式,用于磷材料的模拟计算。 文件详解 力场参数文件...
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  • LAMMPS_AIREBO_最大富勒烯及多层碳结构优化数据

    2026年1月29日 30 48 21

    数据集概述 本数据集包含孤立二十面体富勒烯、多层富勒烯“洋葱”及堆叠石墨烯层的优化结构,按类型分类存储。石墨烯结构按堆叠层数组织,所有结构均通过LAMMPS中的AIREBO力场优化,为碳材料结构研究提供基础数据。 文件详解 文件名称:Structures.zip 文件格式:ZIP 字段映射介绍:压缩包内包含标准xyz结构文件,单个xyz文件结构为:...
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  • 酶催化研究_血红素_铜氧化酶O_O裂解中间体光谱与DFT坐标数据

    2026年1月28日 30 186 70

    数据集概述 本数据集包含血红素-铜氧化酶O-O裂解与质子泵联结点处三自旋中间体的光谱数据及DFT结构原子坐标,对应同名论文的研究内容,支持酶催化机制的分析与验证,共含2个文件。 文件详解 文件名称:Spectroscopic_data.xlsx 文件格式:XLSX 字段映射介绍:包含磁圆二色谱(MCD)、变温变场MCD、吸收光谱及共振拉曼光谱的实验数据...
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  • Cp_2Yb_taphen_PdMe2_Based化合物实验原始数据

    2026年1月25日 30 49 48

    数据集概述 本数据集包含金属有机化合物Cp*2Yb(taphen)PdMe2的实验原始数据,涵盖磁学、核磁共振、电子顺磁共振及结构等多类型实验结果,共5个文件,无分层目录结构,可用于该化合物的理化性质研究。 文件详解 磁学数据文件 文件名称:magnetism compound 4.xlsx 文件格式:XLSX...
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  • MOF单晶X射线衍射数据及Ce_TCPE晶体结构分析数据_2022版

    2026年1月23日 30 159 77

    数据集概述 本数据集包含Th-TCPE与Ce-TCPE两种新型金属有机框架(MOF)的单晶X射线衍射数据,涵盖晶体结构参数、键角、键长、原子坐标等核心信息,支持对两种MOF的结构特征及发光性能差异的分析,共包含10个文件。 文件详解 说明文档 文件名称:README_file.txt 文件格式:TXT...
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  • CRYSTAL17_Based_含氮物种在星际水冰幔层的结合能计算数据

    2026年1月23日 30 143 39

    数据集概述 本数据集包含通过CRYSTAL17计算机代码获得的HF-3c优化结构的原子坐标(XYZ格式),记录了含氮物种在质子有序结晶水冰周期性模型和非晶态水冰周期性模型表面的吸附结构,用于研究其结合能特性。 文件详解 文件名称:BEs_Nitrogen.zip 文件格式:ZIP...
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  • Cu_CHA_Based铝分布对铜氨络合物扩散与配对影响研究数据集2025

    2026年1月21日 30 16 3

    数据集概述 本数据集为论文“Influence of aluminium distribution on the diffusion mechanisms and pairing of [Cu(NH3)2]+ complexes in Cu-CHA”的配套数据,包含图表源数据、机器学习力场训练验证数据及分子动力学轨迹的初始与最终结构,支持研究铜-...
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  • GFN2_xTB_Based_20种iCOM在冰晶簇模型表面吸附优化结构数据

    2026年1月20日 30 198 125

    数据集概述 本数据集包含20种iCOM(星际复杂有机分子)在84个水分子组成的冰晶簇模型表面吸附的GFN2-xTB优化结构,以及对应的高斯格式谐波频率计算文件。结构模拟基于Ferrero等人2020年提出的周期性冰晶模型,所有文件打包为一个压缩包,支持转换为多种量子力学程序输入格式。 文件详解...
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  • Deciphering_Enigma_Based_双硝基吡咯并_3_2_b_吡咯光谱坐标数据

    2026年1月12日 30 62 32

    数据集概述 本数据集包含双硝基吡咯并[3,2-b]吡咯类化合物的光学光谱、NMR光谱数据及原子坐标文件,用于研究弱耦合体系中硝基芳香化合物的异常荧光机制。数据涉及瞬态吸收、吸收发射光谱、发射衰减、NMR fid文件及分子结构坐标,共6个文件,支持分析供体-受体耦合对光物理性质的影响,为分子光子学设计提供参考。 文件详解 光谱数据文件(.xlsx格式)...
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  • CrBr3_Multipolarons_Based单层多极化子表观电荷减少研究数据

    2026年1月15日 30 152 119

    数据集概述 本数据集包含单层CrBr3多极化子的STM实验测量数据与第一性原理计算结果,支持论文“Apparent charge reduction in multipolarons crafted one-by-one in monolayer...
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  • Supporting_Information_天体化学研究_星际核碱基气相形成支持文档

    2026年1月14日 30 19 10

    数据集概述 本数据集是论文《Gas-phase formation of interstellar nucleobases from dehydrogenated radicals of formamide and vinyl...
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  • RaptorX_Source_Huntingtin蛋白结构预测项目数据_20160329

    2026年1月13日 30 136 110

    数据集概述 本数据集为Huntingtin蛋白结构功能开放实验室笔记本项目的RaptorX结构预测数据,包含4个文件,主要涉及Huntingtin蛋白的结构预测结果及相关文档,支持对该蛋白结构的研究与分析。 文件详解 结构预测文件(.pdb格式) 文件名称:1-1200_besthit.pdb、2301-3144.pdb、1-1100.pdb...
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  • Ultra_narrow_Optical_Linewidths_稀土分子晶体超窄光学线宽研究数据

    2026年1月8日 30 142 126

    数据集概述 本数据集对应科研论文《Ultra-narrow Optical Linewidths in Rare-Earth Molecular Crystals》的主图、扩展数据图及补充图数据,包含20个文件,涵盖稀土分子晶体光学线宽相关的实验数据与结构信息,支持论文研究结论的验证与复用。 文件详解 图表数据文件(.xlsx格式,共17个)...
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  • Integrative_Structure_PTBP1_EMCV_IRES复合物溶液结构测定数据

    2026年1月8日 30 124 50

    数据集概述 本数据集包含RNA结合蛋白PTBP1与脑心肌炎病毒(EMCV)RNA内部核糖体进入位点(IRES)复合物的溶液整合结构模型及支撑数据,涵盖多组约束条件下的集合结构、DEER-EPR原始数据、SANS/SAXS曲线、约束文件及图表源数据,共27个文件,用于生物分子复合物结构研究。 文件详解 集合结构文件...
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  • Colorimetric_Detection_Based双氧钒_V_配合物合成结构与过氧化氢检测数据

    2026年1月5日 30 116 78

    数据集概述 本数据集包含双氧钒(V)腙配体配合物的合成、结构表征及过氧化氢比色检测相关数据。配合物通过红外、紫外-可见、核磁共振光谱及单晶X射线晶体学表征,其晶体结构为单斜P2/c空间群,金属离子呈扭曲四方锥几何构型。数据集用于支持该配合物的结构分析及过氧化氢检测研究。 文件详解 文件名称:XRD-FILE.zip 文件格式:ZIP...
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  • Rab_phosphorylating_kinases_Based_Rab激酶选择性与底物识别研究数据

    2026年1月2日 30 133 53

    数据集概述 本数据集包含Rab8A变体的预测结构模型,以及用于重组蛋白表达的Rab GTP酶、激酶和磷酸酶的蛋白质序列。共9个文件,主要为.cif格式的结构模型文件和.xlsx格式的补充表格,支持Rab激酶选择性谱与底物识别相关研究。 文件详解 结构模型文件(.cif格式,共8个) 文件名称:Rab8A Y77R.cif、Rab8A...
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