找到27个数据集

标签: 同源性分析

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  • 被子植物根系与总证据研究数据

    2026年2月12日 30 100 69

    数据集概述 本数据集来自关于被子植物根系与总证据的研究,聚焦被子植物系统发育关系分析,探讨Amborella在系统发育中的位置争议,通过观察、随机化和模拟数据的系统发育分析,验证不同数据位点对推断基部被子植物关系的可靠性。 文件详解 文件名称:SA1.zip 文件格式:ZIP...
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  • 水稻转录组中病毒多样性的深度分析数据集

    2026年2月9日 30 150 108

    数据集概述 本数据集基于17,115个水稻转录组RNA-seq文库,覆盖24个稻属物种及51个国家样本,通过从头组装和同源性方法鉴定出810个完整或近完整病毒,包括276种已知病毒和534种新型病毒。数据还包含病毒分类注释及与水稻密切相关的427种病毒筛选结果,为水稻病毒病防控提供新见解。 文件详解 压缩文件(Archive files)...
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  • Cinchonoideae_Based_果实性状演化编码分析数据

    2026年1月28日 30 71 44

    数据集概述 本数据集围绕系统发育系统学中性状编码方法展开,通过对比复合编码与还原编码,分析Cinchonoideae亚科果实性状演化。核心验证复合编码能否区分性状关联或独立演化,提出同源性未被证实的复杂性状需迭代分解为简单性状的方法,以Cinchonoideae亚科果实类型为案例验证,结果显示核果与浆果不同源,需更精确的果实本体论。 文件详解...
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  • Molluscan_Consensus_软体动物门系统发育评估数据

    2026年1月27日 0 72 67

    数据集概述 本数据集聚焦软体动物门的系统发育研究,整合42篇已发表的系统发育树数据,对比形态学与分子生物学推断的类群关系差异。通过分析类群间的节点距离模式,评估现有系统发育假说的一致性,为软体动物门高阶分类关系的后续研究提供参考依据。 文件详解 补充图表文件(EPS格式) 文件名称:suppl-...
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  • Phenoscape_Based_比较生物学同源性逻辑模型研究数据

    2026年1月27日 30 171 12

    数据集概述 本数据集围绕比较生物学中的同源性概念展开,包含历史同源性与系列同源性的逻辑模型研究相关数据。整合了文献中的同源性断言及Phenoscape知识库中脊椎动物鳍和肢体的分类群表型数据,用于评估REA和AVA两种逻辑模型的推理效果,为同源性推理融入本体工具奠定基础。 文件详解 文件名称:SupplementaryMaterials1.txt...
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  • Maniola_jurtina_Based草地褐蝶基因组从头组装与注释数据

    2026年1月21日 30 97 88

    数据集概述 本数据集为草地褐蝶(Maniola jurtina)的基因组从头组装成果,包含全基因组注释文件、蛋白质序列、斑点图案基因BLAST比对结果及功能注释数据,共5个文件,覆盖基因组结构与功能分析的核心内容,适用于昆虫基因组学与进化生物学研究。 文件详解 全基因组GFF文件...
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  • OGRDB_Mouse_A_J亚种IGKV免疫球蛋白受体基因胚系参考数据集

    2026年1月21日 30 179 168

    数据集概述 本数据集为小鼠A/J亚种的IGKV免疫球蛋白受体基因胚系参考集,发布于Open Germline Receptor Database(OGRDB)。包含带间隙、无间隙的FASTA序列文件、JSON格式数据文件及许可证文件,共4个文件,用于免疫球蛋白受体基因的相关研究与分析。 文件详解 序列文件 文件名称:J...
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  • Hereditary_hearing_genes_遗传性听力相关基因列表数据

    2026年1月20日 30 199 88

    数据集概述 本数据集是一份遗传性听力基因列表,收录了人类和/或小鼠中因突变导致听力损伤的基因。数据整合自遗传性听力损失主页、国际小鼠表型联盟报告的小鼠突变基因,以及相关文献和会议摘要内容,每个基因均附有参考文献,是遗传性听力研究的基础参考资料。 文件详解 文件名称:mouse_hh_genes.xlsx 文件格式:XLSX...
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  • 数据2019_nCoV_ADE_Based感染抗体依赖性增强预防研究补充数据

    2026年1月20日 30 10 3

    数据集概述 本数据集为2019-nCoV感染抗体依赖性增强(ADE)研究的补充数据,包含病毒结构模型文件、序列文件、结构比对文件及说明文档等,涉及2019-nCoV与SARS的S蛋白结构、RBD区域序列等关键信息,用于支持新型冠状病毒感染机制及预防策略相关研究,共包含10个文件。 文件详解 结构模型文件(.pse、.pdb格式)...
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  • In_Silico_Based_2019_nCoV疫苗靶点计算机鉴定候选肽数据

    2026年1月19日 30 73 55

    数据集概述 本数据集是针对2019-nCoV疫苗靶点的计算机鉴定研究结果,包含四类候选肽数据:与SARS-CoV免疫原性肽完全匹配的nCoV肽、与IEDB免疫原性肽高相似性的nCoV肽、通过NetMHCpan和PWM预测的9-mer免疫原性肽、通过NetMHCpan和iPred预测的9-mer免疫原性肽,共4个文件,用于加速疫苗候选靶点的实验验证。...
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  • OGRDB_打开小鼠种系基因组数据库_BALB_c小鼠IGH受体种系参考数据集

    2026年1月19日 30 157 111

    数据集概述 本数据集为小鼠BALB/c亚群的IGH受体种系参考集,由Open Germline Receptor Database(OGRDB)发布。包含IGH受体基因的种系序列数据及相关说明文件,共4个文件,支持免疫遗传学领域对小鼠BALB/c亚群IGH受体基因的研究与分析。 文件详解 许可文件: 文件名称:licence.txt 文件格式:TXT...
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  • Homology_Groups_Based_胎盘哺乳动物进化新基因与分化基因研究数据

    2026年1月18日 30 125 52

    数据集概述 本数据集基于脊椎动物蛋白质的同源性分组分析,聚焦胎盘哺乳动物(真兽亚纲)进化支系的新基因起源。通过MCL聚类与全基因组 reciprocal BLASTP,识别出357个胎盘哺乳动物干群特有的新同源群,其中87个在进化中被广泛保留,涉及胚胎发育、脑功能、生殖等核心生物学过程。数据集包含1个文件,为蛋白质ID与同源群列表。 文件详解...
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  • Latent_infection_Based_单细胞绿藻巨型内源性病毒潜伏感染研究补充数据

    2026年1月12日 30 198 123

    数据集概述 本数据集是论文《Latent infection of an active giant endogenous virus in a unicellular green alga》的补充数据,包含7个文件,涉及单细胞绿藻中巨型内源性病毒潜伏感染相关的基因组序列、蛋白质序列、模型文件及重复序列信息,支持病毒基因结构、蛋白质模型及序列特征的研究。...
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  • Dryad_Source_Euglenozoa特异性DNA聚合酶序列数据_20230912

    2026年1月17日 30 98 33

    数据集概述 本数据集聚焦眼虫门(Euglenozoa)特异性家族A DNA聚合酶(famA DNAPs)的研究,通过分析33个吞噬性眼虫和2个共生体的单细胞转录组数据,新增16条famA DNAP序列,用于探讨眼虫门famA DNAPs的多样性与进化历程,补充该类群基础分支物种序列数据的空缺。 文件详解 README.md 文件格式:Markdown...
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  • Hyles_lineata_Based_白线天蛾高质量长读长基因组组装与注释数据

    2026年1月15日 30 46 24

    数据集概述 本数据集包含白线天蛾(Hyles lineata)的高质量长读长基因组组装数据,该物种是北美分布广泛的天蛾,具有极端幼虫颜色变异和广谱宿主植物利用特性。数据支持对其表型可塑性、植物- herbivore互作等研究,基因组组装连续性(N50为14.2...
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  • OGRDB_Mouse_IGH_Germline_Reference_Set_LEWES_EiJ

    2026年1月8日 30 119 56

    数据集概述 本数据集为小鼠LEWES/EiJ品系的IGH基因胚系参考集,包含4个文件,涉及许可说明、带间隙/无间隙的FASTA序列文件及JSON格式数据,发布于Open Germline Receptor Database(OGRDB),用于生物信息学领域的基因研究。 文件详解 licence.txt 文件格式:TXT...
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  • 来自_PhytoKeys_的补充材料1_2020年Ceratozamia物种研究基因序列登录号数据

    2026年1月7日 30 36 20

    数据集概述 本数据集为论文《墨西哥南马德雷山脉Ceratozamia新种研究》的补充材料1,包含ITS和matK基因序列的GenBank登录号,其中本研究生成的序列以粗体标注,用于支持该植物新种的分子系统学分析,共包含1个文件。 文件详解 文件名称:oo_444870.docx 文件格式:DOCX...
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  • Aspergillus_Supplementary_Data_真菌组蛋白密码进化与蛋白质组学研究数据

    2026年1月5日 30 123 72

    数据集概述 本数据集包含与论文“The histone code of the fungal genus Aspergillus uncovered by evolutionary and proteomic...
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  • Aquaria_Mouse_MVK_Based_人源Mevalonate_kinase突变效应数据集

    2026年1月4日 30 144 127

    数据集概述 本数据集描述了人类甲羟戊酸激酶(Mevalonate kinase)的多种突变效应,设计用于配合Aquaria分子图形系统使用,支持对特定突变(如V377I、Δ91)的可视化分析。数据集包含4个JSON格式文件,无目录结构,未划分训练/测试集或数据/标签集。 文件详解 Δ91.json 文件格式:JSON...
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  • 形态系统发育学进化模拟补充材料

    2025年12月23日 30 52 31

    数据集概述 本数据集为形态系统发育学研究的补充材料,围绕进化模拟展开。通过两种新颖的模拟模型(随机进化模型和选择模型)生成数据,评估贝叶斯分析与简约法在系统发育推断中的准确性,探讨形态进化模式对系统发育准确性的影响。 文件详解 文件名称: Keating_et_al.simulation_supplementary(1).pdf 文件格式: PDF...
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