数据集概述
本数据集包含白线天蛾(Hyles lineata)的高质量长读长基因组组装数据,该物种是北美分布广泛的天蛾,具有极端幼虫颜色变异和广谱宿主植物利用特性。数据支持对其表型可塑性、植物- herbivore互作等研究,基因组组装连续性(N50为14.2 Mb)和完整性(98.2%的鳞翅目BUSCO基因)较高,还包含核心黑色素合成通路基因注释及结构注释文件。
文件详解
- 文件名称:README.md
- 文件格式:MD
- 字段映射介绍:包含数据集说明、支持文件列表及分析子文件夹说明,记录作者信息及研究背景
- 文件名称:melanin_annotation.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包内包含核心黑色素合成通路基因的注释数据,含基因序列及与其他蛾类(如烟草天蛾)的同源性分析结果
- 文件名称:structural_annotation.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包内包含基因组结构注释数据,涵盖基因结构预测、功能元件注释等信息
- 文件名称:assembly.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包内包含高质量长读长基因组组装数据,N50达14.2 Mb,覆盖98.2%的鳞翅目BUSCO基因
数据来源
论文“A high-quality, long-read genome assembly of the whitelined sphinx moth (Lepidoptera: Sphingidae: Hyles lineata)”
适用场景
- 鳞翅目昆虫基因组进化研究: 分析白线天蛾基因组结构特征及与其他天蛾的演化关系
- 表型可塑性分子机制研究: 结合基因组数据探究幼虫颜色变异的遗传调控基础
- 植物-昆虫互作机制分析: 基于广谱宿主植物利用特性,研究相关基因的功能与表达调控
- 黑色素合成通路功能验证: 利用注释数据解析天蛾黑色素合成的分子通路及保守性
- 生物防治靶标基因筛选: 挖掘与生长发育、抗逆相关的关键基因,为农业害虫防治提供靶点