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标签: 密码子优化

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  • 盐生植物线粒体基因组分析补充材料2_同义密码子使用数据_2021

    2026年1月28日 30 13 12

    数据集概述 本数据集为论文《Sea Lavenders质体基因组分析揭示IR扩张与正选择》的补充材料2，包含Limonium（Sea Lavenders）质体基因组的相对同义密码子使用数据，用于分析该植物类群的密码子偏好性特征，支持其基因组进化研究。 文件详解 文件名称：oo_527176.xlsx 文件格式：XLSX...
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  • Tribolium_castaneum_Based基因表达与序列结构相关性研究数据

    2026年1月15日 30 23 22

    数据集概述 本数据集为赤拟谷盗（Tribolium castaneum）基因组研究的配套数据，聚焦基因表达水平与同义密码子使用、氨基酸组成及基因结构的相关性。通过全基因组分析，揭示了翻译选择对密码子偏好、氨基酸使用的影响，以及基因表达水平与编码区长度、内含子大小等结构特征的关联规律，为昆虫基因进化研究提供基础数据。 文件详解...
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  • 细菌蛋白质过表达中密码子使用对负荷与产量关系的影响建模与测量补充数据集

    2025年12月23日 30 39 19

    数据集概述 本数据集为论文修订相关实验的补充数据，包含与细菌蛋白质过表达中密码子使用对负荷与产量关系影响建模及测量相关的实验数据，还新增了密码子优化器脚本，以压缩包形式存储。 文件详解 文件名称: alexismhill3/gfp_deoptimization_burden-v1.0.5.zip 文件格式: ZIP压缩包 内容说明:...
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  • 脊椎动物同义密码子使用模式与翻译选择研究补充材料

    2025年12月20日 30 39 1

    数据集概述 本数据集为脊椎动物同义密码子使用模式研究的补充材料，聚焦突变、遗传漂变与翻译选择的相互作用，验证翻译选择在脊椎动物中的普遍性，包含研究相关的补充表格和图表。 文件详解 文件名称：SupplementaryTable1.pdf 文件格式：PDF 内容：研究相关的补充表格1，可能包含同义密码子使用模式的统计数据或分析结果...
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  • 统计物理方法的密码子使用优化辅助代码与数据集

    2025年12月12日 30 90 82

    数据集概述 该数据集包含用于密码子设计统计物理模型研究的辅助代码与数据，涵盖基因组预处理、过滤代码及处理后的数据集，支撑《A statistical-physics approach for codon usage optimisation》一文的研究内容。 文件详解 readme.txt：TXT格式，提供数据及代码的详细说明...
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  • 果蝇必需孤儿基因同源物功能与亚细胞定位能力差异数据集2025

    2025年12月10日 30 36 0

    数据集概述 本数据集为Patel等人2025年关于果蝇必需孤儿基因同源物的研究补充数据，包含基因序列、比对结果及相关压缩文件，支持研究同源物在功能与亚细胞定位能力上的差异。 文件详解 压缩文件（archive_files）： orthologs.zip：压缩格式，内容未预览，推测包含同源物相关数据...
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