统计物理方法的密码子使用优化辅助代码与数据集

数据集概述

该数据集包含用于密码子设计统计物理模型研究的辅助代码与数据,涵盖基因组预处理、过滤代码及处理后的数据集,支撑《A statistical-physics approach for codon usage optimisation》一文的研究内容。

文件详解

  • readme.txt:TXT格式,提供数据及代码的详细说明
  • Codon_db.ipynb:IPYNB格式,Python代码文件,用于读取人类基因组数据库、过滤基因(筛选≥150核苷酸的基因)、计算CG核苷酸百分比并生成频率直方图
  • Codon_filt.fasta:FASTA格式,处理后的基因数据集,为筛选后的基因序列文件
  • resultado_fragmentos.xlsx:XLSX格式,可能包含基因片段相关的处理结果数据
  • Codon_db.html:HTML格式,Codon_db.ipynb代码的HTML转换文件,便于可视化查看

适用场景

  • 计算生物学研究:分析密码子使用模式及优化方法
  • 基因组数据处理:研究基因组预处理与过滤的技术流程
  • 统计物理模型应用:探索统计物理方法在生物信息学中的应用
  • 密码子优化算法开发:支撑密码子使用优化相关算法的研究与验证
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 202.93 MiB
最后更新 2025年12月12日
创建于 2025年12月12日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。