数据集 - 海数据

刺激响应型双态铰链蛋白设计补充数据

2026年2月15日 30 21 12

数据集概述本数据集是“Design of stimulus-responsive two-state hinge proteins”的补充信息，包含设计脚本、设计模型及aw DEER原始数据，共4个文件，涵盖.xlsx表格和.zip压缩包两种类型，为刺激响应双态铰链蛋白的设计研究提供支持。文件详解文件名称：S1_spreadsheet.xlsx...

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CTox_Based_毒理基因组学与机制研究整合门户支持数据

2026年2月9日 30 112 1

数据集概述本数据集为Collaborative Toxicogenomics（CTox）开放获取网络门户的支持数据，该门户整合毒理基因组学与机制研究结果，应用通路分析（如GSEA）和网络方法，解决基因表达分析在安全研究中的应用障碍。数据可辅助毒理基因组学信息解读，关联基因表达与安全结果，支持毒性研究结果预测。文件详解文件名称：ctox...

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PyGBe_Based_分子静电计算边界元方法回归测试网格数据

2026年2月9日 30 147 139

数据集概述本数据集为PyGBe的回归测试提供所需网格文件，PyGBe是Barba组开发的开源Python GPU边界元代码，用于基于连续介质方法的分子静电计算。数据集包含Lysozyme测试和单球体、双球体案例相关的网格文件，以压缩包形式提供。文件详解压缩包文件：文件名称：pygbe_regresion_test_meshes.zip...

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用于功能预测项目的蛋白质结构收集数据集

2026年2月9日 30 148 37

数据集概述本数据集为蛋白质结构功能预测项目的完整数据，包含来自Swiss-Prot的蛋白质序列文件及AlphaFoldDB API的查询结果文件，共2个文件，无目录层级划分，未进行训练/测试、数据/标签或原始/处理数据的拆分。文件详解文件名称：swissprot_dataset_fullheader.fasta 文件格式：FASTA...

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蛋白质序列功能注释数据集_生物信息学测试数据

2026年2月9日 30 187 83

数据集概述本数据集包含蛋白质序列功能注释工作流测试的输入和输出文件，共5个文件，涵盖FASTA、tabular和XML三种格式，主要用于生物信息学领域的蛋白质功能注释流程验证与测试。文件详解输入文件文件名称：protein_sequences.fasta 文件格式：FASTA 字段映射介绍：包含待注释的蛋白质序列基础数据输出文件...

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LDDT_Based所有诱饵结构LDDT分数数据

2026年2月9日 30 30 22

数据集概述本数据集包含所有诱饵结构的LDDT分数数据，LDDT（Local Distance Difference Test）是用于评估蛋白质结构预测准确性的指标。数据集以压缩文件形式提供，无额外目录结构，可直接用于生物信息学相关分析。文件详解文件名称：LDDT.zip 文件格式：ZIP...

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EmpPrior_Dryad_贝叶斯分支长度估计改进研究数据

2026年2月9日 30 137 21

数据集概述本数据集围绕贝叶斯分析中分支长度先验分布的优化展开，探讨利用外部信息设置先验对系统发育推断结果的影响，对比默认设置与 informed priors 的分析差异，验证其对解决分支及树长估计问题的有效性，支持系统发育学研究。文件详解文件名称：EmpPrior.0.1.1_Dryad.zip 文件格式：ZIP...

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Affibody_b2m聚集抑制研究数据集

2026年2月2日 30 54 7

数据集概述本数据集是论文"Affibodies as valuable tool to prevent b2m aggregation under lysosomal-like...

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纳米塑料与阿尔茨海默病_相关支持数据及计算分析

2026年2月1日 30 44 3

数据集概述本数据集为论文“Supporting Data for computational analysis in Nanoplastics Potentiate Alzheimer's Pathogenesis by Promoting the Microglial Escape of Amyloid...

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gmxapi_Based偏差抑制集成优化示例数据

2026年2月1日 30 64 35

数据集概述本数据集提供使用gmxapi 0.2进行偏差抑制集成优化的示例输入文件，包含JSON配置、Shell脚本、Python工作流脚本及GROMACS拓扑文件，共4个文件。数据支持复现相关研究，适用于分子动力学模拟优化场景。文件详解 pair_dist.json 文件格式：JSON...

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TreeBASE_系统发育最优树搜索改进研究数据

2026年2月1日 30 57 47

数据集概述本数据集为系统发育研究相关数据，聚焦于寻找分类群最优进化历史的计算问题，提出通过兼容特征子集的锚定树约束搜索空间、降低精确启发式搜索步骤的方法，并使用四个生物数据集及TreeBASE库中四百个数据集验证了方法有效性。文件详解文件名称：script.zip 文件格式：ZIP...

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Ssh1_Based蛋白质底物特异性系统研究数据集

2026年1月31日 30 204 185

数据集概述本数据集是论文《A systematic approach to study protein-substrate specificity enables the identification of Ssh1 substrate...

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SAT_Based_不确定条件下生化反应模型校准数据

2026年1月31日 30 111 109

数据集概述本数据集围绕不确定条件下生化反应的SAT-Based模型校准展开，包含处理生化浓度不精确性的模型构建形式化方法相关数据。通过从粗模型生成细模型实现校准，在RKIP抑制的ERK通路原型上验证了计算可行性，支持多尺度生化反应建模研究。文件详解数据文件文件名称：Timing_Data_New.xlsx 文件格式：XLSX...

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布莱恩_康奈利_基于资源丰度的合作临界转变研究资料数据

2026年1月30日 30 144 12

数据集概述本数据集包含与“资源丰度与合作临界转变”研究相关的材料，包括数据、配置文件、分析脚本及研究使用的Avida 2.12.4版本软件，支持研究结果的可重复性。微生物实验协议详见对应论文，数据集以压缩包形式提供。文件详解文件名称：briandconnelly/resource-biofilm-v1.0.zip 文件格式：ZIP...

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IMP_Source_SAXS_Merge方法基准测试数据

2026年1月30日 30 99 77

数据集概述本数据集是IMP的SAXS Merge方法及网络服务器的基准测试数据，用于评估该方法的性能表现。数据集包含一个压缩文件，可支持用户复现相关建模过程，具体操作可参考指定链接或README文件。文件详解文件名称：saxsmerge_benchmark-v1.0.zip 文件格式：ZIP 字段映射介绍：压缩包为SAXS...

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Monte_Carlo_Samplers_高效网络推理数据

2026年1月29日 30 206 71

数据集概述本数据集对应PLOS Computational Biology论文《Monte Carlo samplers for efficient network inference》中所有图表的支撑数据，包含4个文件，用于高效网络推理相关的Monte Carlo采样器研究。文件详解 readme.txt 文件格式：TXT...

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ApoDock_Based_配体条件侧链包装灵活分子对接数据

2026年1月29日 30 107 12

数据集概述本数据集与ApoDock相关，聚焦配体条件下的侧链包装在灵活分子对接中的应用。数据集包含1个文件，主要为数据可用性说明文档，无训练/测试、数据/标签、原始/处理数据的划分，文件类型单一。文件详解文件名称：Data Availability Statement.docx 文件格式：DOCX...

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RevBayes_Based_多态感知物种树与进化力估计补充数据

2026年1月28日 30 46 29

数据集概述本数据集为论文《Polymorphism-aware estimation of species trees and evolutionary forces from genomic sequences with...

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Trabectedin_Based药物协同作用计算识别研究数据集

2026年1月28日 30 59 51

数据集概述本数据集包含论文“In-Silico Identification of Novel Pharmacological Synergisms: The Trabectedin Case”相关的原始数据，聚焦于通过计算方法识别抗癌药物trabectedin的潜在协同作用药物，涉及基因表达分析、药物重定位策略及信号通路关联等内容。文件详解...