数据集概述
本数据集提供使用gmxapi 0.2进行偏差抑制集成优化的示例输入文件，包含JSON配置、Shell脚本、Python工作流脚本及GROMACS拓扑文件，共4个文件。数据支持复现相关研究，适用于分子动力学模拟优化场景。
文件详解
- pair_dist.json
- 文件格式：JSON
- 字段映射介绍：包含15个键值对（如"202AC"、"202AB"等），存储偏差抑制集成优化的配对距离参数配置
- test_250.sh
- 文件格式：SH
- 字段映射介绍：Shell脚本文件，用于执行偏差抑制集成优化的测试任务
- workflow.py
- 文件格式：PY
- 字段映射介绍：Python脚本文件，定义gmxapi 0.2偏差抑制集成优化的工作流逻辑
- nosugar_ver116.tpr
- 文件格式：TPR
- 字段映射介绍：GROMACS拓扑文件，存储分子动力学模拟的拓扑结构与参数信息
数据来源
论文（doi:10.1101/2021.07.18.452496）
适用场景
- 分子动力学模拟优化研究：用于验证gmxapi 0.2偏差抑制集成优化方法的可行性与效果
- 计算生物学工作流开发：参考workflow.py构建基于gmxapi的分子模拟自动化流程
- 分子模拟参数调优：通过pair_dist.json配置调整偏差抑制参数，优化模拟精度
- 学术研究复现：支持复现doi:10.1101/2021.07.18.452496论文中的实验结果
