数据集概述
本数据集包含REST2和CMD两种模拟所需的输入文件、参数文件及初始构象数据,共6个文件,均为zip格式,涉及单体、五聚体、十聚体及其带CA修饰的构象,可用于分子动力学模拟相关研究。
文件详解
- 单体构象文件:Monomer.zip,格式为zip,包含单体模拟的输入、参数及初始构象数据
- 带CA修饰的单体构象文件:Monomer+CA.zip,格式为zip,包含带CA修饰的单体模拟相关数据
- 五聚体构象文件:Pentamer.zip,格式为zip,包含五聚体模拟的输入、参数及初始构象数据
- 带CA修饰的五聚体构象文件:Pentamer+CA.zip,格式为zip,包含带CA修饰的五聚体模拟相关数据
- 十聚体构象文件:Decamer.zip,格式为zip,包含十聚体模拟的输入、参数及初始构象数据
- 带CA修饰的十聚体构象文件:Decamer+CA.zip,格式为zip,包含带CA修饰的十聚体模拟相关数据
适用场景
- 分子动力学模拟研究:用于REST2和CMD模拟的输入参数设置与初始构象加载
- 生物大分子结构模拟:支持单体、五聚体、十聚体及其修饰形式的动力学模拟实验
- 计算生物学参数验证:为模拟参数的合理性验证提供基础数据
- 分子构象变化分析:通过不同聚合体构象数据研究分子结构动态变化规律