找到56个数据集

标签: 病毒进化

过滤结果
  • TEV植物病毒在拟南芥宿主基因型进化过程中的原始数据

    2026年1月31日 30 140 2

    数据集概述 本数据集是植物RNA病毒宿主适应性进化实验的原始数据,记录了烟草蚀纹病毒(TEV-At17b)在5种遗传异质拟南芥生态型中连续传代15次后的适应性变化。实验分析了病毒在本地宿主中的 fitness 提升、感染性增强及毒力变化,测序鉴定了适应性突变,并验证了宿主-病毒互作的特异性。数据集含1个文件。 文件详解 文件名称:Raw fitness...
    packageimg
  • 艾滋病病毒_HIV_1_早期传播与流行病爆发研究数据

    2026年1月31日 0 31 4

    数据集概述 本数据集围绕HIV-1在人类群体中的早期传播、扩散及流行起始展开,通过对中非HIV-1序列数据的统计分析,揭示1920年代金沙萨为早期传播焦点及1960年前全球流行病毒来源,对比M组与O组病毒流行史差异,强调社会变化与交通网络的作用。 文件详解 系统发育地理模型与经验树分布文件 文件名称:Phylogeographic models and...
    packageimg
  • HCV_Genome_Based_感染结局影响分析数据

    2026年1月31日 30 11 1

    数据集概述 本数据集为HCV基因组对感染结局影响的研究数据,包含研究使用的模拟代码和分析文件。通过模拟系统发育树的二元性状遗传,量化感染结局聚类情况及病毒基因型的影响,应用于澳大利亚HITS-p监狱队列数据,检测到基因型1的病毒系统发育距离与感染结局显著相关(约67%),基因型3a无显著结果。 文件详解...
    packageimg
  • DWV_Based_蜜蜂种群损失病毒基因型致病性研究数据

    2026年1月30日 30 151 116

    数据集概述 本数据集聚焦西方蜜蜂种群损失问题,探究主要致病嫌疑病毒——畸形翼病毒(DWV)的基因型致病性差异。通过实验室实验与系统野外调查,验证新兴基因型DWV-B比已确立的DWV-A更具致病性,并结合模型展示感染DWV-B的蜂群崩溃更快,同时揭示DWV在体内的广泛基因组重组潜力。 文件详解 GB Prevalence.zip 文件格式:ZIP...
    packageimg
  • φ6_Based_噬菌体宿主范围突变频率与适应性研究数据

    2026年1月30日 30 11 6

    数据集概述 本数据集围绕φ6噬菌体宿主范围突变展开,记录了69个独立突变体的测序结果及13个突变基因型在两种宿主(P. pseudoalcaligenes和P. phaseolicola)上的适应性测定数据,涉及突变频率、适应性差异及潜在机制相关信息。 文件详解 文件名称:Ford et al. Host Range Mutant Data.xlsx...
    packageimg
  • 植物RNA病毒_宿主基因型生态演替_原始疾病相关性状数据

    2026年1月30日 30 115 39

    数据集概述 本数据集为研究宿主更替动态对植物RNA病毒进化影响的原始疾病相关性状数据,聚焦拟南芥基因型从易感到低易感的突然与渐进过渡对芜菁花叶病毒毒力及种群基因组多样性的作用,关联宿主演替类型、抗性遗传基础与病毒进化特征。 文件详解 文件名称:Traits.xlsx 文件格式:XLSX...
    packageimg
  • MARV_Genomic_Based密码子使用进化分析数据

    2026年1月29日 30 14 8

    数据集概述 本数据集为马尔堡病毒(MARV)基因组密码子使用模式的分析数据,包含病毒全核苷酸序列及密码子分析结果。通过多种分析方法探究突变压力、自然选择及宿主(人类、埃及果蝠)对MARV密码子使用的影响,揭示其进化机制,共包含2个文件。 文件详解 文件名称:marburg.full.nucleotide.txt 文件格式:TXT...
    packageimg
  • SARS_CoV_2_疫苗突破性病例及抗体耐药变异株相关数据

    2026年1月29日 30 55 21

    数据集概述 本数据集为论文“Predominance of antibody-resistant SARS-CoV-2 variants in vaccine breakthrough cases from the San Francisco Bay Area,...
    packageimg
  • reassortment_Based_流感病毒重配路径研究数据

    2026年1月28日 30 126 56

    数据集概述 本数据集围绕流感病毒重配路径研究展开,包含支持重配事件检测算法开发的相关文件。研究提出两种检测方法(MLreassort和Breassort),可识别流感等分段病毒的重配事件,数据集含2个压缩文件,用于算法实现与验证。 文件详解 文件名称:scripts_reassort.zip 文件格式:ZIP...
    packageimg
  • Anellovirus_33种圆环病毒FASTQ数据集2023

    2026年1月28日 30 181 44

    数据集概述 本数据集包含三十三种圆环病毒的FASTQ数据,由十六组计算机模拟生成,核苷酸序列与2023年第一版灵长类圆环病毒数据库序列的一致性从百分之百到百分之八十五不等。数据通过art_illumina软件生成,可用于病毒基因组相关分析。 文件详解 文件名称:dataset-33Anelloviruses-2023.zip 文件格式:ZIP...
    packageimg
  • Zenodo_Based_蝙蝠疱疹病毒三重感染宿主内动态研究数据

    2026年1月28日 30 28 15

    数据集概述 本数据集为论文“Bat things come in threes: within-host dynamics of herpesvirus triple infection in bats”配套数据,包含蝙蝠及其疱疹病毒相关信息,用于研究蝙蝠宿主内疱疹病毒三重感染的动态特征。 文件详解...
    packageimg
  • Microviridae_2012_病毒科基因组进化多样性研究数据

    2026年1月27日 30 207 206

    数据集概述 本数据集包含81个新组装的Microviridae病毒科完整基因组序列及相关注释文件,源自不同生态系统的病毒宏基因组。数据支持对该病毒科的进化多样性分析,包括新亚科Pichovirinae的发现、基因组结构特征及水平基因转移现象研究,为理解其生态作用和起源提供基础。 文件详解 说明文档:...
    packageimg
  • CHIKVnext_Based基孔肯雅病毒分子进化与全球传播研究数据

    2026年1月26日 30 3 1

    数据集概述 本数据集是基于Nextstrain平台构建的交互式资源CHIKVnext的核心数据,聚焦基孔肯雅病毒(CHIKV)的分子进化与全球传播研究,包含3个JSON格式文件,为病毒进化分析提供基础数据支持。 文件详解 文件名称:CHIKV_root-sequence.json 文件格式:JSON...
    packageimg
  • SARS_CoV_2_Protein_6种不同蛋白质FASTA序列数据

    2026年1月26日 30 1 0

    数据集概述 本数据集提供了SARS-...
    packageimg
  • CHIKV_Based_巴西塞阿拉州基孔肯雅病毒感染致死病例研究数据

    2026年1月26日 30 35 19

    数据集概述 本数据集为巴西东北部塞阿拉州基孔肯雅病毒(CHIKV)感染致死病例的研究数据,包含100例疑似虫媒病毒感染致死病例的检测结果,涉及临床、流行病学特征及病毒基因组分析,共9个相关文件。 文件详解 系统发育分析文件...
    packageimg
  • Isolation_SARS_CoV_2隔离选择病毒载量进化研究数据

    2026年1月26日 30 150 39

    数据集概述 本数据集与论文“Isolation may select for earlier and higher peak viral load but shorter duration in SARS-CoV-2 evolution”相关,核心内容围绕隔离对SARS-...
    packageimg
  • SARS_CoV_2_Colombia_疫情变异株竞争研究_补充数据_2022

    2026年1月20日 30 189 58

    数据集概述 本数据集是论文《The principles of SARS-CoV-2 inter-variant competition are exemplified in the pre-Omicron era of the Colombian epidemic》的补充数据,包含研究中使用的BEAST...
    packageimg
  • Host_stages_Based植物RNA病毒进化研究数据2022

    2026年1月23日 30 127 113

    数据集概述 本数据集用于支持论文《Host developmental stages shape the evolution of a plant RNA...
    packageimg
  • 数据_高阶上位性对植物RNA病毒宿主适应性的影响_适应度景观原始数据

    2026年1月23日 30 83 74

    数据集概述 本数据集围绕正链植物RNA病毒(烟草蚀纹病毒)的宿主适应性展开,聚焦适应度景观的地形特征,包含实验中测量的多种基因型适应度数据,用于研究高阶上位性对病毒宿主内适应度的影响,揭示适应度景观的多峰性、漏洞及进化路径限制。 文件详解 文件名称:Raw data.xlsx 文件格式:XLSX...
    packageimg
  • RABV_Based_宿主遗传多样性与病毒进化及跨物种传播关系研究数据

    2026年1月22日 30 210 127

    数据集概述 本数据集围绕宿主遗传多样性对病毒进化及跨物种传播的影响展开,以狂犬病病毒(RABV)为模型,验证宿主遗传多样性对病毒遗传多样性及跨物种传播供体可能性的提升作用。包含3份核心文件,用于支持宿主遗传多样性作为病毒进化与新发关键决定因素的实证研究。 文件详解 文件名称:Data_S1.xlsx 文件格式:XLSX...
    packageimg