找到26个数据集

标签: 系统发育方法

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  • BiSSE_Based进化模型稳健性模拟研究数据

    2026年2月1日 30 53 11

    数据集概述 本数据集为BiSSE(Binary State Speciation and Extinction)模型稳健性研究的模拟数据,包含模型文件、代码文件、生物数据、Excel格式的模拟数据及R脚本文件,共5个文件,涉及模型参数、模拟过程与结果数据,用于验证BiSSE方法在假设条件被违背时的稳健性。 文件详解 Model.txt 文件格式:TXT...
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  • Dunbar_s_number_邓巴数统计验证研究数据

    2026年1月30日 30 103 16

    数据集概述 本数据集围绕“邓巴数”展开研究,通过不同统计方法验证人类认知能力是否限制稳定社交关系数量为约150人。研究使用互补数据集,采用贝叶斯和广义最小二乘系统发育方法,得出差异显著的群体规模估算结果,最终指出无法通过该方式推导人类群体规模的认知限制。 文件详解...
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  • WilliamsEtAl_AJB2014_Based_花粉细胞数进化研究数据

    2026年1月20日 30 171 24

    数据集概述 本数据集围绕被子植物花粉细胞数进化展开,基于Brewbaker经典研究扩展数据,通过现代系统发育方法分析2511个物种的花粉细胞数(双细胞/三细胞)进化规律,验证三细胞花粉的可逆性及与物种多样化速率的关联,包含研究脚本、数据库及说明文档。 文件详解 文档文件(Document files)...
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  • DeGiorgioDegnan_Based_物种树推断稳健性研究数据

    2026年1月23日 30 113 6

    数据集概述 本数据集围绕物种树推断的稳健性展开,对比MP-EST、STAR、STEAC、STELLS和STEM等方法在处理最大似然与贝叶斯基因树时的表现,分析分歧时间低估对推断准确性的影响,包含1个压缩文件,用于系统发育方法的性能评估与误差机制研究。 文件详解 文件名称:DeGiorgioDegnanRobustness.zip 文件格式:ZIP...
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  • Ancient_DNA_Based古DNA序列替代率估算与模拟研究数据

    2026年1月22日 30 10 5

    数据集概述 本数据集包含古DNA序列替代率的模拟研究结果及实际序列分析数据,涉及动物、植物和细菌共19个物种的749条古DNA与727条现代DNA序列。通过贝叶斯系统发育方法验证替代率估算的准确性,确认古DNA序列替代率高于长期系统发育水平,为分子进化研究提供支持。 文件详解 数据文件(.xml格式,共19个)...
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  • TREvoSim_Source_化石系统发育分析模拟与实证数据_2021版

    2026年1月21日 30 192 42

    数据集概述 本数据集为化石系统发育分析相关的模拟与实证数据,包含TREvoSim模拟设置、模拟数据集、推断用矩阵、共识树、R代码等8个文件。通过模拟评估不同化石采样量和缺失数据下的系统发育推断方法性能,验证化石对形态学数据集系统发育分析的提升作用,支持古生物学进化历史重建研究。 文件详解...
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  • oreilly2016matrices_贝叶斯与简约法系统发育估计对比数据

    2026年1月21日 30 52 24

    数据集概述 本数据集围绕离散形态学数据的系统发育估计方法展开,对比贝叶斯Mk模型与等权、隐含权重简约法的性能。通过模拟数据验证方法在拓扑准确性、分辨率上的差异,为系统发育重建方法选择提供依据。 文件详解 oreilly2016matrices.zip 文件格式:ZIP...
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  • Squamate_Reptiles_Based微生境与气候对分化速率影响研究数据

    2026年1月15日 30 115 13

    数据集概述 本数据集围绕有鳞目爬行动物(蜥蜴和蛇)分化速率的影响因素展开,对比分析微生境(陆生、穴居、树栖、水生)与宏观气候(热带vs温带)的作用。包含4000余种物种的微生境、气候分布及系统发育数据,通过时间校准树估算72个支系的分化速率,并用系统发育方法检验相关性,发现微生境对分化速率的解释力(约37%)强于气候。 文件详解...
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  • Paleontological_Data_Based_古生物学系统发育假设修正研究数据

    2026年1月14日 30 56 27

    数据集概述 本数据集围绕古生物学数据对系统发育假设的影响展开,通过实证数据矩阵的分类群添加实验,分析化石在系统发育推断中的独特作用,包括其拓扑影响、形态特征与拓扑变化的关联等,为生物进化研究提供数据支持。 文件详解 文档文件(Document files)...
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  • Triadobatrachus_massinoti_Based_早期蛙类运动演化研究数据

    2026年1月13日 30 124 37

    数据集概述 本数据集聚焦最古老蛙类Triadobatrachus massinoti的运动能力演化研究,通过现存两栖动物与蜥蜴的四肢骨骼长度测量数据,结合多变量分析与系统发育方法,验证其运动模式。数据显示该物种以蝾螈式侧向波动运动为主,为蛙类跳跃运动的演化提供新视角。 文件详解 附录文件(Appendix) 文件名称:Appendix...
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  • ZooKeys_补充材料_6_Monacha_cantiana种群系统发育分析基因序列数据

    2026年1月12日 30 18 14

    数据集概述 本数据集为论文补充材料6,包含Monacha cantiana(Montagu, 1803)的串联基因序列,具体为H3基因与[(5.8SrDNA)+ITS2+(28SrDNA)]的组合序列,用于NJ/ML-MEGA7/IQ Tree/RAxML/BI等系统发育分析,对应论文图10的研究内容。 文件详解...
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  • ZooKeys_Supplementary_新热带区龙虱科Cybistrinae亚科分类与系统发育分析数据

    2025年12月30日 30 182 108

    数据集概述 本数据集为新热带区龙虱科Cybistrinae亚科分类研究的补充材料,包含系统发育分析的性状编码数据,支持该亚科分类修订及新类群描述的研究,是相关昆虫分类学研究的重要数据支撑。 文件详解 文件名称:oo_963595.docx 文件格式:DOCX 字段映射介绍:包含用于系统发育分析的性状编码信息,具体内容需查阅文档,无公开预览信息。...
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  • 鸽羽虱属系统发育基因组学研究数据集

    2025年12月23日 30 33 7

    数据集概述 本数据集为鸽羽虱属(Columbicola)系统发育基因组学研究的核心成果,包含通过目标限制组装法从微小乙醇保存样本中获取的977个直系同源基因序列,覆盖61种羽虱。数据集提供了高支持度的物种树、补充材料及表格数据,为解析鸽羽虱与宿主的协同进化、生物地理分布及宿主转换机制提供了关键数据支撑。 文件详解...
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  • 多倍体复合体存在下系统发育网络的最大简约推断数据集

    2025年12月22日 30 119 48

    数据集概述 该数据集围绕多倍体复合体存在下的系统发育网络最大简约推断展开,聚焦于解决现有方法在多倍体物种数据应用中的假设冲突问题,提供了新方法的实现及验证相关资料。 文件详解 该数据集包含一个PDF格式的文档文件,具体如下: - 文件名称: supp.pdf - 文件格式: PDF (.pdf) - 文件内容:...
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  • 杂交推断与不完全谱系分选研究数据集

    2025年12月22日 30 174 46

    数据集概述 本数据集聚焦于进化生物学领域,围绕杂交推断与不完全谱系分选(ILS)的关系展开研究。内容涵盖在ILS存在下检测杂交的系统发育方法,包括简约性准则、局部搜索启发式算法,以及处理基因树估计不确定性的技术,为基因组范围的杂交扫描提供计算高效的分析框架。 文件详解 文件名称: SOM.pdf 文件格式: PDF (.pdf) 文件内容:...
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  • 立克次体属系统发育分析数据集

    2025年12月21日 30 129 46

    数据集概述 本数据集围绕立克次体属的系统发育研究,包含核心基因组与附属基因组的多类型序列比对文件、基因直系同源群数据、16S rRNA序列及补充图表等,用于探究其进化历史是否符合树状结构,为细菌进化研究提供数据支持。 文件详解 核心基因组比对文件: core genome alignment - 3rd codon...
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  • 形态学数据系统发育树后验样本的共识树方法有效性数据集

    2025年12月21日 30 59 26

    数据集概述 本数据集围绕形态学数据的贝叶斯系统发育分析结果展开,通过模拟与实证数据对比不同共识树方法(MCC、MAP、MRC)的有效性,分析其对后验树样本的总结能力及优缺点,为系统发育研究的结果呈现提供方法选择依据。 文件详解 文档文件(PDF格式): Hist_1000_Chars.PDF:1000字符数据集的直方图结果...
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  • 系统发育分析的特征列表与特征状态矩阵附录

    2025年12月21日 30 160 51

    数据集概述 本数据集为系统发育分析相关的附录文件,包含用于研究鞘翅目(Coleoptera)郭公虫科(Cleridae)化石分类的特征列表与特征状态矩阵,基于X射线断层扫描技术获取的波罗的海琥珀标本数据构建,支持物种系统发育位置的分析。 文件详解 文件名称:Appendix_1_Character_list_and_matrix.pdf...
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  • 系统发育比较方法再思考数据集

    2025年12月15日 30 147 30

    数据集概述 本数据集围绕“系统发育比较方法(PCMs)”展开,通过三个案例研究,探讨现有PCMs易受单一进化事件影响的问题,提出将假设检验与数据驱动方法结合的解决方案,并建议将系统发育视为概率图形模型以优化推断。 文件详解 该数据集包含一个PDF格式的文档文件,具体说明如下: - 文件名称: pnh-ms_supplement.pdf - 文件格式:...
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  • 厄瓜多尔乔科地区白叶树蛙属物种组系统学补充材料2

    2025年12月13日 30 117 54

    数据集概述 本数据集为厄瓜多尔乔科地区白叶树蛙属物种组系统学研究的补充材料,核心内容是展示该物种组的完整最大似然树(Figure S1),支持新物种描述及系统发育分析,为两栖动物分类学研究提供可视化数据支撑。 文件详解 文件名称:oo_1257802.pdf 文件格式:PDF(.pdf) 内容说明:包含研究论文《Systematics of the...
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