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DPPC双层膜全水合分子动力学模拟轨迹及相关文件
2025年12月13日 30 137 31
数据集概述 该数据集包含DPPC脂质双层膜在全水合条件下的分子动力学模拟轨迹及相关文件,基于GROMOS 53A6_L力场和Reaction Field静电计算方法,模拟时长100纳秒,温度323K,含128个DPPC分子与5841个水分子,为膜结构研究提供数据支持。 文件详解 文件名称: md.tpr,文件格式:...
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DPPC_Berger_OPLS06_NaCl分子动力学模拟数据集
2025年12月5日 60 84 43
数据集概述 本数据集包含使用OPLSAA兼容的Berger-DPPC-06力场进行的、含150mM NaCl的完全水合DPPC双层膜分子动力学模拟轨迹及相关文件,模拟条件为323K、72个脂质分子、2880个SPC水分子及8个Na和Cl离子,轨迹时长120ns,分析了最后60ns数据。 文件详解 模拟配置文件:...
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ECC_CHARMM36_POPC双层膜模拟数据集_100脂质_940mM_NaCl_310K_GROMACS5_1_4
2025年12月6日 30 169 160
数据集概述 本数据集为ECC-CHARMM36力场下POPC双层膜的分子动力学模拟数据,包含100脂质/叶、940mM NaCl溶液、310K温度条件,由GROMACS 5.1.4生成,是6组模拟中的第6组,用于研究CHARMM力场缩放对离子结合的影响。 文件详解 该数据集包含12个GROMACS格式文件,具体说明如下: - 结构与拓扑文件: -...



