数据集概述
该数据集包含DPPC脂质双层膜在全水合条件下的分子动力学模拟轨迹及相关文件，基于GROMOS 53A6_L力场和Reaction Field静电计算方法，模拟时长100纳秒，温度323K，含128个DPPC分子与5841个水分子，为膜结构研究提供数据支持。
文件详解
- 文件名称: md.tpr，文件格式: .tpr，可能为GROMACS模拟运行输入文件
- 文件名称: md.xtc，文件格式: .xtc，可能为模拟轨迹文件
- 文件名称: mdin.mdp，文件格式: .mdp，可能为模拟参数配置文件
- 文件名称: Comments_area_different_gmx_versions.pdf，文件格式: .pdf，可能为不同GROMACS版本说明文档
- 文件名称: example_lipids.top，文件格式: .top，可能为脂质体系拓扑文件示例
- 文件名称: em.gro，文件格式: .gro，可能为能量最小化后的结构文件
- 文件名称: lipids_vdw.itp，文件格式: .itp，可能为脂质范德华参数文件
- 文件名称: dppc.itp，文件格式: .itp，可能为DPPC分子参数文件
数据来源
nmrlipids.blogspot.fi项目
适用场景
- 生物物理研究: 分析DPPC双层膜在全水合条件下的结构与动态特性
- 力场验证: 评估GROMOS 53A6_L力场对脂质膜体系的模拟准确性
- 计算方法研究: 探究Reaction Field静电计算方法在膜模拟中的应用效果
- 分子模拟教学: 作为脂质膜分子动力学模拟的案例数据与参数参考
