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DPPC_Berger_OPLS06_NaCl分子动力学模拟数据集
2025年12月5日 60 49 48
数据集概述 本数据集包含使用OPLSAA兼容的Berger-DPPC-06力场进行的、含150mM NaCl的完全水合DPPC双层膜分子动力学模拟轨迹及相关文件,模拟条件为323K、72个脂质分子、2880个SPC水分子及8个Na和Cl离子,轨迹时长120ns,分析了最后60ns数据。 文件详解 模拟配置文件:...
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Peter_Tieleman_DPPC_Berger_NaCl_Based_1molNaCl下DPPC双层膜MD模拟完整数据
2025年12月6日 30 181 152
数据集概述 该数据集包含1摩尔氯化钠(NaCl)环境下完全水合DPPC双层膜的分子动力学(MD)模拟轨迹及相关文件。采用Berger-DPPC-98力场和Gromos离子力场,模拟条件为323K、72个脂质分子、2778个SPC水分子及51对Na/Cl离子,轨迹时长120纳秒,分析使用最后60纳秒数据。 文件详解 分子动力学参数与拓扑文件:...
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DPPC_Berger_NaCl_scaled分子动力学模拟数据集
2025年12月6日 30 75 6
数据集概述 该数据集包含150mM氯化钠溶液中完全水合的DPPC双层膜的分子动力学模拟轨迹及相关文件。使用Peter Tieleman提供的Berger-DPPC-98力场与Gromacs...
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Gromacs_DPPC_Berger_OPLS06_NaCl_Based_盐溶液中DPPC双层膜120ns模拟完整数据
2025年12月6日 30 169 81
数据集概述 本数据集包含150mM NaCl溶液中完全水合DPPC双层膜的分子动力学(MD)模拟轨迹及相关文件,采用Berger-DPPC-06力场与Gromacs 4.6.7生成,离子电荷缩放系数为0.7,提供120ns模拟数据及后60ns分析结果。 文件详解 模拟轨迹文件: md.xtc: 轨迹文件,存储120ns模拟的原子坐标信息...
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PeterTielemanLab_DPPC_Berger_NaCl_1Mol_Based_盐环境下DPPC双层膜动力学完整数据
2025年12月6日 30 12 3
数据集概述 本数据集包含完全水合的DPPC双层膜在1摩尔氯化钠环境下的分子动力学模拟轨迹及相关文件,基于Berger-DPPC-98力场和Gromacs 5.0.4软件生成,离子电荷缩放系数为0.7,模拟时长120纳秒。 文件详解 分子动力学模拟文件: md.gro:GROMACS结构文件,存储模拟系统的原子坐标与拓扑信息...



