数据集概述
本数据集包含全水合DPPC磷脂双分子层的分子动力学（MD）模拟轨迹及相关文件。采用Slipids力场与Gromacs 4.6.6软件，模拟条件为温度323K、128个脂质分子、3840个TIP3P水分子，共10个文件，涵盖模拟参数、结构、轨迹等关键数据。
文件详解
- 力场与拓扑文件
- 文件名称：DPPC.itp、TIP3p.itp、sample.top、forcefield.ff.zip
- 文件格式：.itp、.top、.zip
- 字段映射介绍：包含DPPC脂质、TIP3P水分子的拓扑参数，系统拓扑文件及Slipids力场压缩包
- 模拟输入文件
- 文件名称：DPPC_323K.gro、mdnew.mdp、mdnew.tpr
- 文件格式：.gro、.mdp、.tpr
- 字段映射介绍：DPPC双分子层初始结构文件、模拟参数文件、预处理后的可执行模拟文件
- 模拟输出文件
- 文件名称：orderparameters.xvg、protonated_0-150.trr、mdnew.xtc
- 文件格式：.xvg、.trr、.xtc
- 字段映射介绍：脂质序参数数据文件、原子级模拟轨迹文件、压缩格式模拟轨迹文件
适用场景
- 生物物理研究: 分析DPPC磷脂双分子层在323K条件下的结构特性与动态行为
- 力场验证: 评估Slipids力场对磷脂双分子层模拟的准确性
- 分子动力学模拟方法优化: 基于模拟参数与轨迹数据优化Gromacs模拟流程
- 膜生物物理教学: 作为磷脂双分子层MD模拟的示例数据集用于教学演示
