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标签: Galaxy

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  • Galaxy_Synbiocad_路径评估多指标排序训练数据

    2026年1月29日 30 124 71

    数据集概述 本数据集为Galaxy路径分析工作流训练教程提供输入数据，包含待排序的异源路径SBML文件及宿主生物大肠杆菌iML1515的基因组尺度代谢模型SBML文件，用于通过目标产物通量、热力学可行性等四个标准评估预测路径性能，生成评分排序后的路径集合。 文件详解 SBML格式路径文件...
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  • myExperiment_Based_工作流类型及数量统计数据

    2026年1月28日 30 161 31

    数据集概述 本数据集为JSON格式文档，包含myExperiment.org平台上可用的工作流类型列表及各类型对应的工作流数量，是科研平台工作流资源分布的结构化统计数据，仅含一个文件。 文件详解 文件名称：workflow_types.json 文件格式：JSON 字段映射介绍：文件为对象结构，包含20个键值对，键为工作流类型名称（如Taverna...
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  • GTN_Training_Galaxy平台ENA数据上传教程训练数据

    2026年1月23日 30 95 53

    数据集概述 本数据集是Zenodo.3732359数据的子集，用于Galaxy培训网络（GTN）的“Upload data to ENA”教程。已按指定流程移除人类序列痕迹，包含基于Illumina PE数据生成的SARS-CoV-2共识序列及相关原始数据，共8个文件。 文件详解 数据文件...
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  • Bakta_Galaxy_Wrapper_Based基因组注释工具测试数据库数据

    2026年1月19日 30 195 165

    数据集概述 本数据集是Bakta基因组注释工具的测试数据库，用于验证Galaxy包装器相关的数据管理功能。数据集包含三个文件，以压缩包和JSON文件为主，无数据库完整文件，仅提供测试所需的核心数据结构与版本信息。 文件详解 核心文件列表 文件名称：db-versions.json 文件格式：JSON...
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  • Galaxy_Training_Network_JBrowse基因组数据可视化教程数据集

    2026年1月13日 30 40 9

    数据集概述 本数据集是Galaxy Training Network中JBrowse基因组数据可视化教程的配套数据，包含10个不同类型的基因组相关文件，覆盖DNA测序、RNA-Seq、基因注释、变异数据等内容，用于支持JBrowse工具的可视化操作训练与实践。 文件详解 基因组序列文件 文件名称：genome.fa 文件格式：FA...
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  • 生物信息学科学工作流开发的大语言模型评估数据集

    2025年12月19日 30 77 44

    数据集概述 本数据集包含6个PDF文件，围绕大语言模型（LLMs）在生物信息学科学工作流开发中的应用展开多维度评估，涵盖LLMs对基础概念、Galaxy与Nextflow平台的理解，以及针对具体任务生成实际工作流的能力。 文件详解 基础概念评估文件： Table-2...
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