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标签: PDB数据库

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  • PDB_ChEMBL_Source_3D活性悬崖及2D类似物数据集

    2026年1月27日 30 127 2

    数据集概述 本数据集基于PDB的X射线结构系统确定三维活性悬崖（3D-cliffs），包含Ki、IC50、Ki/IC50数据集分别识别的236、292、595个3D-cliffs列表，同时提供从ChEMBL数据库（release 19）中基于匹配分子对识别的3D-cliff化合物的2D结构类似物，共2个文件。 文件详解...
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  • IECB_Based_A_DNA双链外消旋晶体X射线衍射数据_6GN3

    2026年1月26日 30 42 3

    数据集概述 本数据集包含d/l-d(CCCGGG)晶体的X射线衍射数据，由IECB使用Rigaku FRX衍射仪采集，关联PDB ID 6GN3的A-DNA双链外消旋晶体结构。数据涵盖原始衍射图像、仪器配置文件、日志等371个文件，用于解析A-DNA双链的晶体结构特征。 文件详解 光栅文件（raster_files）...
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  • Sensible_Structures_PDB数据库数据采集_蛋白质结构分析数据

    2026年1月19日 30 78 51

    数据集概述 本数据集是对蛋白质数据库（PDB）的两次数据采集结果，包含2019年12月9日的v.1版本和2020年12月2日的v.2版本。数据分为原始数据文件和经字典解析后的结构化数据文件，涵盖不同数量的蛋白质结构信息，可用于蛋白质结构相关研究。 文件详解 v.1版本文件 文件名称：structures.pkl 文件格式：.pkl...
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  • XChem_Based_SARS_CoV_2主蛋白酶与PCM_0103067复合物原始衍射数据_存档

    2026年1月5日 30 131 102

    数据集概述 本数据集为SARS-CoV-2主蛋白酶与PCM-0103067复合物的原始衍射数据，对应PDB ID 5RFJ，是Diamond Light Source的i04-1光束线上开展的XChem晶体学片段筛选项目的一部分。原始数据可支持相关方对该复合物结构进行重新分析，补充已自动处理的沉积结构数据。 文件详解...
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  • Kinase3DComplexes_BindingModes_3DCliffs_CliffExtenstion

    2025年12月27日 30 56 0

    数据集概述 本数据集包含从PDB数据库获取的884个激酶-抑制剂复合物晶体结构的结合模式分类，105个由3D激酶抑制剂形成的三维活性悬崖及对应活性信息，以及基于ChEMBL数据库匹配分子对识别的3D悬崖形成抑制剂的2D结构类似物及活性信息，为激酶抑制剂结构与活性研究提供支持。 文件详解...
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  • nmpro_x1311_PDB_5RFG_SARS_CoV_2_主蛋白酶与_PCM_0102372_复合物的原始衍射数据

    2025年12月27日 30 16 1

    数据集概述 本数据集包含SARS-CoV-2主蛋白酶与小分子PCM-0102372复合物的原始衍射数据，对应ID为mpro-x1311及PDB编号5RFG。数据由Diamond Light Source的i04-1光束线在XChem晶体学片段筛选实验中采集，原始数据可供重新分析使用。 文件详解 文件名称：mpro-x1311.zip 文件格式：ZIP...
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  • nmpro_x0499_5REG_Based_SARS_CoV_2主蛋白酶与Z1545313172复合物的原始衍射数据_存档

    2025年12月27日 30 84 41

    数据集概述 本数据集为SARS-CoV-2主蛋白酶与化合物Z1545313172形成复合物的原始衍射数据，对应ID mpro-x0499及PDB ID 5REG。数据由Diamond Light Source的i04-1光束线通过XChem晶体学片段筛选实验采集，旨在支持对该复合物结构的重新分析，数据集包含1个压缩文件。 文件详解...
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  • 碳水化合物_蛋白质复合物结构库

    2025年12月14日 30 45 19

    数据集概述 该数据集为碳水化合物-蛋白质复合物结构库，包含阳性和阴性两类样本结构。阳性样本来自PDB数据库经冗余清理与Rosetta优化的解析结构，阴性样本为Rosetta生成的人工劣质碳水化合物结合蛋白，涉及多种碳水化合物类型。 文件详解 文件名称: CPL_PDBID.txt，文件格式: TXT 字段映射: 包含file_name（文件名）、PDB...
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  • ALK2_ACVR1与M4K2117共结晶结构数据集_PDB_6SRH

    2025年12月12日 30 140 20

    数据集概述 该数据集包含ALK2（ACVR1）与化合物M4K2117共结晶的结构数据，已在PDB数据库以代码6SRH存档。数据涵盖结晶结构相关的多种文件类型，为研究该蛋白与化合物的相互作用提供支持。 文件详解 结构与序列文件： M4K2117_refine_12.cif：CIF格式，可能包含经精修的晶体结构信息...
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  • 抗体结构与序列分析数据集AntibodyStructureandSequenceAnalysis-nayan082

    2025年4月29日 30 58 32

    抗体结构与序列分析数据集AntibodyStructureandSequenceAnalysis-nayan082 数据来源：互联网公开数据 标签：抗体, 蛋白质结构, 序列分析, PDB数据库, 结构生物学, 机器学习, 结构预测, 生物信息学 数据概述： 该数据集包含来自蛋白质数据库（PDB）的数据，记录了抗体的结构和序列信息。主要特征如下：...
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