数据集概述
本数据集包含d/l-d(CCCGGG)晶体的X射线衍射数据,由IECB使用Rigaku FRX衍射仪采集,关联PDB ID 6GN3的A-DNA双链外消旋晶体结构。数据涵盖原始衍射图像、仪器配置文件、日志等371个文件,用于解析A-DNA双链的晶体结构特征。
文件详解
- 光栅文件(raster_files)
- 文件名称:遵循
pradeep-C3G30[编号].img模式(例如:pradeep-C3G30260.img)
- 文件格式:.img
- 数量:361个(占比97.3%)
- 字段映射介绍:X射线衍射原始图像数据,记录晶体衍射信号的空间分布
- 其他文件(other_files)
- 配置文件:RigakuIntegrate.msk、RigakuIntegrateDefaultsCu.xml、Collision.xml、InstrumentRefinementCu.xml(格式:.msk、.xml),包含衍射仪仪器参数与积分配置
- 日志文件:MSCServDetCCD_1.log、MSCServDetCCD_error.log、MSCServDetCCD.log(格式:.log),记录数据采集过程的运行日志
- 输入文件:pradeep-C3G30001-180.INP、pradeep-C3G30181-360.INP(格式:.inp),衍射实验的控制输入文件
- 统计文件:timing1x1.sip.stats(格式:.stats),数据采集时间统计信息
数据来源
PDB数据库(ID:6GN3,DOI:http://doi.org/10.2210/pdb6GN3/pdb)
适用场景
- DNA结构生物学研究: 分析A-DNA双链的外消旋晶体空间结构特征
- X射线衍射技术应用: 验证微聚焦旋转阳极衍射仪对核酸晶体的数据分析方法
- 分子建模参考: 为A-DNA双链的分子动力学模拟提供实验结构数据支撑
- 晶体学方法优化: 基于原始衍射图像与仪器配置文件,优化核酸晶体的衍射数据采集参数