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标签: PLUMED

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  • ALICE_MD_Simulations_生物分子慢构象转变增强采样与机器学习数据_2024

    2026年1月12日 30 210 59

    数据集概述 本数据集为论文“Enhanced Sampling of Biomolecular Slow Conformational Transitions Using Adaptive Sampling and Machine Learning”的官方实现，包含Ala2和Ala10两个示例的MD模拟轨迹（PLUMED COLVAR文件）、自动化模拟...
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  • 氮化镓碱性湿法刻蚀的神经网络驱动分子洞察数据集

    2025年12月13日 30 136 56

    数据集概述 本数据集围绕氮化镓（GaN）碱性湿法刻蚀的分子机制展开，包含训练好的Behler-Parrinello型神经网络势（NNP）及相关数据，用于精准模拟镓、氮、钾、氧五元体系的相互作用与动力学过程，支持纳米结构制备的原子级精度研究。 文件详解 文件名称: dataset_extxyz.zip，文件格式:...
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  • ketene在菱沸石中扩散与反应关联数据集

    2025年12月4日 30 171 121

    数据集概述 本数据集包含CP2K和PLUMED伞形采样模拟的输入文件与分析脚本，核心围绕ketene在菱沸石材料中的扩散过程展开，用于研究扩散与反应的关联机制，为相关计算化学研究提供数据支持。 文件详解 CP2K输入文件： 文件格式：.inp 命名规则：SSZ-13-0BAS-Ketene_.inp（如SSZ-13-0BAS-...
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