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标签: Stacks

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  • GBS_Based_针叶树群体基因组分析策略优化数据

    2026年1月31日 30 61 51

    数据集概述 本数据集为针叶树群体基因组分析中基因分型测序（GBS）策略优化研究的数据，包含GBS实验设计、数据处理流程及分析结果，涉及限制性内切酶选择、测序深度、片段大小筛选等参数优化，以及UNEAK、Stacks、GATK等分析流程测试，为缺乏参考基因组的物种提供无参考SNP calling策略指导。 文件详解 参考序列文件 文件名称：9pt-...
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  • Jackson_ME_大黄蜂遗传多样性与分化驱动因素研究存档数据

    2026年1月28日 30 142 44

    数据集概述 本数据集为大黄蜂遗传多样性与分化驱动因素研究的存档数据，包含两种大黄蜂（Bombus vosnesenskii和Bombus bifarius）的RADseq测序分析相关文件，涉及美国加州、俄勒冈州和华盛顿州山脉不同纬度和海拔的种群连通性、遗传多样性模式研究，共2个文件。 文件详解 README_for_data_uploads.txt...
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  • Dryad_Vera_et_al_欧洲入侵食蚊鱼基因组进化研究数据

    2026年1月27日 30 65 15

    数据集概述 本数据集基于限制性位点相关DNA标签（RADtags）技术，对比美国本土与欧洲入侵食蚊鱼（Gambusia holbrooki）种群的基因组变化，分析其入侵过程中的进化机制。筛选后保留7724个含单个SNP的RADtags，其中186个匹配近缘物种（Xyphophorus...
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  • SNP_Genotyping_基于双酶切RAD测序的基因分型错误率研究数据

    2026年1月21日 30 118 66

    数据集概述 本数据集围绕非模式生物SNP基因分型错误率展开，通过双酶切RAD测序技术，以霍夫曼二趾树懒母子对为研究对象，分析覆盖度与序列质量对参考比对及从头组装数据集基因分型错误率的影响，同时评估错误率对亲子关系鉴定的作用，为测序方案设计提供参考。 文件详解 README_for_SNP_datasets.txt 文件格式：TXT...
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  • Szulkin_Stacks_Based地中海蓝山雀栖息地种群基因组分化数据

    2026年1月20日 30 68 67

    数据集概述 本数据集为地中海蓝山雀栖息地种群基因组分化研究数据，包含197个个体的12106个SNP位点信息，通过RAD-Seq技术分析落叶与常绿橡树林栖息地种群的遗传结构，揭示地理距离与栖息地类型对遗传变异的影响，支持表型-基因型关联研究。 文件详解 原始未过滤SNP数据文件...
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