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标签: UniProt

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  • NSD2_PWWP1_化学蛋白组学_化学探针分析研究数据集

    2026年1月30日 30 109 57

    数据集概述 本数据集为NSD2-PWWP1化学探针的化学蛋白质组学分析结果，通过竞争性亲和纯化结合无标记定量LC-MS/MS技术，评估UNC6934（NSD2-PWWP1靶向探针）与UNC7145（阴性对照）的靶点结合及选择性。包含原始质谱数据、分析参数文件、参考数据库、R分析脚本及方法文档，共23个文件。 文件详解 原始质谱数据文件...
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  • ECMpy2_0_Based_生物信息学数据库整合数据

    2026年1月31日 30 66 56

    数据集概述 本数据集为ECMpy2.0工具相关的数据文件集，包含来自UniProt数据库的JSON文件和来自BRENDA数据库的TXT文件，共2个文件，用于生物信息学相关的数据整合与分析支持。 文件详解 uniprot_data_accession_key.json 文件格式：JSON...
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  • PXD057215_微生物群落蛋白质SIP分析结果数据

    2026年1月31日 30 60 52

    数据集概述 本数据集为PXD057215项目的蛋白质稳定同位素探测（protein-SIP）数据分析结果，支持微生物群落的物种水平分辨率研究。包含两个经处理的Excel文件，分别整合了Unipept与MetaProSIP输出数据，以及未匹配参考数据库或UniProt的肽段BLASTp结果，可用于微生物群落组成与功能分析。 文件详解...
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  • Populus_nigra_L_种子耐贮性蛋白质组学分析数据集

    2026年1月29日 30 196 76

    数据集概述 本数据集包含黑杨（Populus nigra L.）种子在不同温度（3、-3、-20和-196°C）和贮藏时间（12、24个月）条件下的蛋白质组学分析数据，涵盖差异丰度蛋白质的鉴定参数（ESI MS/MS）及GO注释功能分类（UniProt和QuickGO），共3个文件。 文件详解 文件名称：Metadata.xlsx 文件格式：XLSX...
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  • 代谢组学引导的基因组比较研究_哺乳动物冬眠基因趋同进化数据分析

    2026年1月28日 30 6 3

    数据集概述 本数据集配套“Genes Underlying Adaptive Physiological Shifts Among Hibernating Mammals”手稿，包含基因组、系统发育及功能富集数据，用于研究哺乳动物冬眠相关性状（尤其是肉碱代谢）的进化机制，覆盖物种树、基因树、功能富集等多类型资源。 文件详解 系统发育资源...
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  • NES2019_Based禁食北象海豹幼崽肠道耐受性转录组研究数据

    2026年1月27日 30 57 34

    数据集概述 本数据集围绕禁食北象海豹幼崽肠道耐受性的个体发育展开转录组学研究，包含转录组过滤序列、功能注释结果及信号肽预测等七类文件，覆盖生物信息学分析的关键环节，为研究海洋哺乳动物肠道免疫发育机制提供数据支持。 文件详解 转录组序列文件 文件名称：NES2019transcriptome_filtered.fasta 文件格式：FASTA...
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  • PhyloGenes_Based_基因家族系统发育与功能注释完整数据_1_2版本

    2026年1月19日 30 141 112

    数据集概述 本数据集为PhyloGenes平台1.2版本发布的基因家族数据压缩包，包含基因家族的系统发育树文件和基因成员信息文件，覆盖基因ID、分类学名称、序列登录号、功能注释等核心内容，支持生物信息学领域的基因家族分析与功能研究。 文件详解 PhyloXML_files文件夹 文件名称：以.xml命名（每个家族对应一个文件）...
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  • GenePT_Gene_Embeddings_Based_基因与细胞基础模型完整嵌入数据

    2025年12月11日 30 186 83

    数据集概述 该数据集包含人类基因的NCBI及UniProt（如适用）摘要文本，以及基于这些摘要通过OpenAI的text-embedding-ada-002和text-embedding-3-large模型生成的基因嵌入数据，为基因与细胞基础模型GenePT提供支持。 文件详解 文件名称: NCBI_summary_of_genes.json...
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  • BenchStab蛋白稳定性突变预测比较数据集

    2025年12月9日 30 182 12

    数据集概述 本数据集为BenchStab工具配套数据，用于独立评估18种基于结构和4种基于序列的蛋白稳定性突变预测工具。数据来自FireProtDB的单点突变实验ΔΔG值，经UniRef50和SCOP聚类去重后得到289条记录，包含36种蛋白，其中约百分之二十八为稳定突变。 文件详解 文件名称: dataset.csv 文件格式: CSV 字段映射:...
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  • 深海微生物群落结构与代谢季节性变化原位采样数据集

    2025年12月8日 30 72 24

    数据集概述 该数据集用于研究深海活性微生物群落结构与代谢的季节性变化，包含两个版本。版本一提供宏基因组组装基因组（MAGs）的氨基酸序列及KEGG数据库注释；版本二含定制代谢标记基因数据库压缩包及对应注释表，为深海微生物功能研究提供数据支持。 文件详解 版本一文件（未提供具体文件名）： .faa格式文件：存储各MAG的氨基酸序列...
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  • Combat_TB_NeoDB结核研究整合分析数据库

    2025年12月8日 30 70 29

    数据集概述 该数据集是基于图数据库技术构建的结核研究整合知识库，整合了结核分枝杆菌组学数据及相关生物资源数据，支持复杂联合查询，为结核研究提供开放数据支持。 文件详解 文件名称: uniprot_data.zip，文件格式: ZIP，包含UniProt相关数据的压缩文件 文件名称: neodb-db-data.tar.bz2，文件格式:...
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  • 肝脂肪变性与脂肪性肝炎性别差异转录组功能元分析数据集

    2025年12月8日 30 167 76

    数据集概述 本数据集为《肝脂肪变性与脂肪性肝炎：转录组研究中性别差异的功能元分析》论文的结果与补充材料，包含7项转录组研究的表达矩阵、差异基因/通路分析结果、功能富集分析及元分析显著结果等，支持性别差异相关机制研究。 文件详解 该数据集包含8个压缩文件，具体说明如下： - 01_MatExp.zip：压缩文件，包含7项选定研究的基因表达矩阵 -...
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  • 人类肠道噬菌体编码抗CRISPR蛋白发现数据集

    2025年11月29日 30 169 4

    数据集概述 本数据集包含支持人类肠道微生物组中CRISPR-Cas系统与抗CRISPR（Acr）蛋白系统性识别和表征的补充表格。涵盖CRISPR-Cas系统检测、分类、系统发育分析，噬菌体编码Acr预测，Acr候选选择、功能验证及结构分析等核心内容。 文件详解 目录: Discovery of human gut phage-encoded Anti-...
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  • 婴儿利什曼原虫_JPCM5_蛋白编码序列数据集

    2025年11月28日 30 69 31

    数据集概述 该数据集包含婴儿利什曼原虫（JPCM5株）已注释的8532个蛋白编码基因的编码序列，基因注释结合了转录组学、蛋白质组学研究及文献来源信息，数据以Fasta格式存储。 文件详解 文件名称：LINF_Genes-CDS_24ago24.fasta 文件格式：Fasta (.fasta)...
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  • 儿童急性淋巴细胞白血病药物重定位的蛋白质与配体数据集

    2025年11月28日 30 7 4

    数据集概述 本数据集包含蛋白质序列和配体数据两部分，用于儿童急性淋巴细胞白血病（ALL）的药物重定位计算研究。蛋白质序列来自UniProt数据库，配体数据来自ChEMBL、DrugBank及手动补充的FDA批准药物，支持生物信息学、药物发现等领域研究。 文件详解 数据集目录: Protein and Ligand Dataset for Drug...
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  • Metanetx_UniProt_酶选择工具基础数据包

    2025年11月27日 30 124 82

    数据集概述 本数据集为运行酶选择工具所需的基础数据文件，基于Metanetx和UniProt数据库构建。数据以压缩包形式提供，包含支持酶催化反应选择的相关信息。在未来的版本更新中，计划采用RetroRules作为新的数据生成来源。数据集仅包含一个压缩文件。 文件详解 数据压缩包 文件名称：data.tar.gz 文件格式：GZ（压缩归档文件）...
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  • 蛋白质摘要测试集-UniProt数据库摘要批量检索数据集-adarshr

    2025年6月1日 30 171 105

    蛋白质摘要测试集-UniProt数据库摘要批量检索数据集-adarshr 数据来源：互联网公开数据 标签：蛋白质,摘要,生物信息学,UniProt,文本挖掘,生物医学,测试集 数据概述：...
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  • UniProt蛋白质注释数据集-198446条样本-visualcomments

    2025年6月1日 30 119 28

    UniProt蛋白质注释数据集-198446条样本-visualcomments 数据来源：互联网公开数据 标签：UniProt,蛋白质,注释,生物信息学,基因组学,API数据,学术研究 数据概述： 本数据集包含了使用UniProt...
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  • 蛋白质亚细胞定位与生物信息数据集-CAFA5训练集-lnalinaf

    2025年4月22日 30 120 7

    蛋白质亚细胞定位与生物信息数据集-CAFA5训练集-lnalinaf 数据来源：互联网公开数据 标签：蛋白质,亚细胞定位,生物信息学,UniProt,CAFA5,蛋白质组学,细胞生物学,机器学习,生物数据 数据概述： 本数据集包含CAFA5（Critical Assessment of Function Annotation...
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  • 蛋白质数据库UniProt蛋白质信息查询数据集

    2025年4月14日 30 59 30

    蛋白质数据库UniProt蛋白质信息查询数据集 数据来源：互联网公开数据 标签：蛋白质,UniProt,基因,蛋白质长度,生物信息学,帕金森,Kaggle竞赛,蛋白质组学 数据概述：...
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