数据集概述
本数据集为BenchStab工具配套数据，用于独立评估18种基于结构和4种基于序列的蛋白稳定性突变预测工具。数据来自FireProtDB的单点突变实验ΔΔG值，经UniRef50和SCOP聚类去重后得到289条记录，包含36种蛋白，其中约百分之二十八为稳定突变。
文件详解
- 文件名称: dataset.csv
- 文件格式: CSV
- 字段映射: experiment_id（实验ID）、uniprot_id（UniProt蛋白ID）、pdb_id（PDB结构ID）、uniref50_id（UniRef50聚类ID）、mutation（突变信息）、chain（蛋白链）、DDG_gt（实验测定ΔΔG值）
- 文件名称: benchstab_input.csv
- 文件格式: CSV
- 字段映射: pdb_id（PDB结构ID）、mutation（突变信息）、chain（蛋白链）
- 文件名称: DDG distribution.png
- 文件格式: PNG
- 内容: 展示数据集ΔΔG值分布的图片
数据来源
FireProtDB
适用场景
- 生物信息学研究: 用于蛋白稳定性突变预测工具的性能评估与比较
- 计算生物学分析: 分析单点突变对蛋白稳定性的影响规律
- 机器学习模型验证: 作为独立测试集验证新型蛋白稳定性预测模型
- 蛋白质工程应用: 辅助研究蛋白突变设计的稳定性优化策略
