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MD_Based_DPPC_Berger_OPLS06_NaCl_1Mol_scaled_双层膜动力学完整数据
2025年12月21日 30 167 164
数据集概述 本数据集包含完全水合的DPPC双层膜与1摩尔氯化钠的分子动力学（MD）模拟轨迹及相关文件，采用OPLS-AA兼容的Berger-DPPC-06力场，模拟条件为323K，含72个脂质、2778个SPC水分子及51对钠氯离，轨迹时长120纳秒。 文件详解 模拟核心文件：...
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DPPC_Berger_OPLS06_NaCl_1Mol_Based_磷脂双分子层动力学模拟完整数据
2025年12月21日 30 12 3
数据集概述 该数据集包含1摩尔浓度氯化钠溶液中完全水合的DPPC双层膜的分子动力学模拟轨迹及相关文件，采用OPLSAA兼容的Berger-DPPC-06力场，模拟条件为323K，含72个脂质分子、2778个SPC水分子及51对钠氯离，轨迹时长120纳秒，分析最后60纳秒数据。 文件详解 模拟参数与配置文件： md.mdp：模拟参数文件，记录模拟条件设置...
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蛋白质空腔与水动力学识别表征工具教程文件_CICLOPv2
2025年12月19日 30 100 59
数据集概述 本数据集是CICLOP v2.0工具的教程文件，该工具用于识别和表征蛋白质空腔及其中的水。数据集包含工具代码、示例文件、环境配置文件和教程文档，为使用该Python工具分析分子动力学轨迹或PDB文件提供支持。 文件详解 工具代码文件: CICLOPv2.0_waterdynamics.py: Python格式，CICLOP...
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DPPC_Berger_OPLS06_Based_盐环境下DPPC双层膜分子动力学完整数据
2025年12月14日 30 99 39
数据集概述 本数据集包含完全水合的DPPC双层膜在1摩尔氯化钠环境下的分子动力学模拟轨迹及相关文件，采用OPLSAA兼容的Berger-DPPC-06力场，模拟时长120纳秒，分析了最后60纳秒的数据，为研究DPPC膜在盐环境中的结构与动力学提供支持。 文件详解 模拟配置与力场文件：...
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嵌套压缩分子动力学模拟测试数据集
2025年12月11日 30 42 37
数据集概述 该数据集为嵌套压缩文件测试数据，包含分子动力学模拟（MD）的轨迹文件（XTC格式）和拓扑文件（TPR格式），用于验证代码对嵌套压缩文件结构的处理能力。 文件详解 文件名称: outerzip.zip 文件格式: .zip（压缩文件） 内部嵌套结构及内容: 轨迹文件:...
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SARS_CoV_2刺突蛋白成药性探索的监督分子动力学数据集
2025年12月5日 30 28 8
数据集概述 该数据集包含针对SARS-CoV-2刺突蛋白受体结合域（RBD）与ACE2结合抑制的分子动力学模拟数据，涉及2421种已批准小分子的虚拟筛选及后续验证，重点分析了头孢磺啶等候选药物对RBD-ACE2结合的影响，为抗病毒药物研发提供动态分子作用依据。 文件详解 分子动力学轨迹文件（.xtc格式）：共13个，记录蛋白质-...
