数据集概述
本数据集是俄罗斯科学基金会（РНФ）22-14-00330号项目报告的附录数据，包含6个表格，涵盖基因转录组学相关的多种分析结果，涉及GTEx数据中的基因结构、突变密度、肿瘤研究等多个方面，为基因转录与肿瘤研究提供结构化参考。
文件详解
- 文件名称：ST1.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：包含exon_id（外显子ID）、gene_name（基因名称）、exon_name（外显子名称）、transcript_biotype（转录本类型）、in_VastDB（是否在VastDB数据库）、in_CHESS（是否在CHESS数据库）、phastCons_score（保守性评分）、SR_support（支持度）、Coverage（覆盖度）、Inclusion_ratio（包含率）、CHX_dPSI（CHX处理后PSI变化）、GTEX_tissues_all（GTEx所有组织）、GTEX_max_PSI（GTEx最大PSI值）、GTEX_tissues（GTEx组织）、TCGA_max_dPSI（TCGA最大dPSI值）、TCGA_cancer_type（TCGA癌症类型）等字段。
- 文件名称：ST2.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：包含基因相关的坐标、覆盖度、GTEx数据中的支持度、100个脊椎动物比对中的保守性水平（SR_support、Coverage、phastCons_score等字段）。
- 文件名称：ST3.tsv
- 文件格式：TSV
- 字段映射介绍：包含基因和坐标信息、平均保守性评分（mean_conservation_score）、突变密度（mutation_density_tcga、mutation_density_icgc）、相关研究文献信息等字段。
- 文件名称：ST4.tsv
- 文件格式：TSV
- 字段映射介绍：包含RSB结构域信息、肿瘤突变富集情况、体细胞肿瘤突变密度（mutation_density）等字段。
- 文件名称：ST5.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：包含event_id（事件ID）、nmd_id_list（NMD ID列表）、event_type（事件类型）、gene_name（基因名称）、exp（实验）、dpsi+CHX（CHX处理后dPSI）、dpsi-CHX（未处理dPSI）、padj+CHX（CHX处理后校正P值）、padj-CHX（未处理校正P值）、log2FoldChange（表达变化倍数）、padj（校正P值）、dpsi_chx（CHX处理dPSI）、padj_chx（CHX处理校正P值）、chx_sensitive（CHX敏感性）、tumor_associated（肿瘤相关性）、tcga_eff（TCGA效应）等字段。
- 文件名称：ST6.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含RSB抑制剂的引物和miRNA序列列表。
数据来源
俄罗斯科学基金会（РНФ）22-14-00330号项目报告附录
适用场景
- 基因转录组学研究：分析GTEx数据中的基因结构、表达情况及保守性特征。
- 肿瘤突变研究：探究肿瘤相关基因的突变密度、结构域突变富集情况。
- 基因调控机制分析：研究非生产性剪接的调控事件及对RSB表达扰动的反应。
- 实验设计参考：为RSB抑制剂相关实验提供引物和miRNA序列信息。
- 肿瘤发生机制研究：分析基因在肿瘤发生中的潜在作用机制及相关文献支持。
