数据集概述
本数据集源自Mladineo IJP研究,包含四个核心子数据集,主要围绕简单异尖线虫(Anisakis simplex)的微卫星基因组特征和亚得里亚海异尖线虫群体的遗传结构分析。内容涵盖编码与非编码微卫星的重复类型特征、完美与复合微卫星的比较,以及基于11个微卫星位点推断的群体遗传参数和群体间分化程度。数据以Word文档格式提供,为寄生虫基因组学和群体遗传学研究提供支持。
文件详解
- 文件名称:
Mladineo IJP/datasets IJP Mladineo.docx
- 文件格式: DOCX
- 字段映射介绍: 文档内包含四个结构化数据集:
- 数据集1 (Dataset 1): A. simplex基因组中编码与非编码微卫星各重复类型的特征,包括平均密度、覆盖度和基因组含量(相对于检测的总基因组大小计算),复合微卫星被视为紧凑单元处理。
- 数据集2 (Dataset 2): A. simplex基因组中发现的完美微卫星和复合微卫星内各重复类型的特征,计算指标同数据集1。
- 数据集3 (Dataset 3): 基于11个微卫星位点,在整体种群水平(N=96)和五个指定分组水平(popA - popE)上推断的亚得里亚海异尖线虫群体遗传结构参数。
- 数据集4 (Dataset 4): 5个指定异尖线虫群体(popA - popE)间基于微卫星位点推断的FST配对距离矩阵(下三角)及其在p<0.05水平上显著的p值矩阵(上三角)。
数据来源
Mladineo IJP
适用场景
- 寄生虫基因组特征分析: 用于研究A. simplex基因组中微卫星(特别是编码区与非编码区)的分布密度、覆盖度等特征。
- 微卫星标记开发与比较: 分析完美微卫星与复合微卫星的重复类型差异,为开发新的分子标记提供依据。
- 群体遗传学研究: 利用微卫星位点数据,分析亚得里亚海异尖线虫群体的遗传多样性、遗传结构及群体分化(FST)。
- 种群遗传学参数评估: 基于数据集3的遗传参数,评估不同地理或生态分组(popA-popE)的遗传状况。