数据集概述
本数据集记录法国地中海阿尔卑斯山欧洲银杉(Abies alba Mill.)的适应性选择研究数据,涵盖175个候选基因的267个SNP位点分析、气候数据及公共花园实验表型数据,揭示该树种在景观与局域尺度对干旱和耐寒性的分化选择模式,为森林树种局域适应研究提供支撑。
文件详解
- IBE_vs_IBD_tests.zip:ZIP格式,包含隔离-by-environment(IBE)与隔离-by-distance(IBD)检验相关数据
- STRUCTURE.zip:ZIP格式,包含种群结构分析相关数据
- SNP_data.zip:ZIP格式,包含175个候选基因的267个SNP位点基因型数据
- sampling_sites.zip:ZIP格式,包含法国地中海阿尔卑斯山4座山脉高、低海拔样地的采样位点信息
- outlier_tests.zip:ZIP格式,包含FST异常位点检测相关数据
- KASP_details.zip:ZIP格式,包含KASP标记开发及验证相关细节数据
- environmental_data.zip:ZIP格式,包含样地原位气候测量数据与栅格气候数据
- common_garden_data_and_Qst-Fst_tests.zip:ZIP格式,包含公共花园实验表型数据及QST-FST检验相关数据
数据来源
论文“Evidence of divergent selection for drought and cold tolerance at landscape and local scales in Abies alba Mill. in the French Mediterranean Alps”
适用场景
- 森林树种局域适应机制研究:分析欧洲银杉在干旱、耐寒性相关性状的遗传分化模式
- 种群遗传学分析:利用SNP数据与STRUCTURE结果研究种群遗传结构及隔离-by-distance效应
- 气候适应性关联分析:结合环境数据与等位基因频率,探究气候变量对适应性基因的选择作用
- 公共花园表型适应性研究:通过QST-FST检验分析芽萌动日期、生长速率等适应性性状的分化
- 分子标记开发应用:参考KASP标记细节数据,开展欧洲银杉适应性标记的验证与应用