数据集概述
该数据集围绕阿波罗蝶类（Parnassiinae）的宏观进化展开，通过整合现存分子证据与灭绝化石形态证据，构建物种系统发育树、推断分化时间及祖先地理范围，并关联红皇后（RQ）与弄臣（CJ）假说测试的多样化动态分析数据。
文件详解
- 附录文件：
- Appendix 1 - GenBank sequences.zip：压缩文件，包含基因序列数据
- Appendix 2 - Gene alignments and trees.zip：压缩文件，包含基因比对与系统发育树文件
- Appendix 3 - Parnassiinae_Fossils_MB.nex：NEX格式文件，包含阿波罗蝶类化石数据
- Appendix 5 - Parnassiinae Distribution.xlsx：Excel文件，记录阿波罗蝶类分布数据
- Appendix 6 - Adjacency matrices through time.xlsx：Excel文件，包含随时间变化的邻接矩阵数据
- Appendix 7 - Himalaya and Tibetan paleoaltimetry.zip：压缩文件，包含喜马拉雅-西藏古高度数据
- Appendix 8 - Bayesian paleoenvironmental model.docx：Word文档，贝叶斯古环境模型相关内容
- Appendix 11 - Bayes factors Dating.xlsx：Excel文件，贝叶斯因子定年数据
- Appendix 12 - Parnassiinae DEC.zip：压缩文件，阿波罗蝶类扩散-灭绝- cladogenesis模型数据
- Appendix 13 - DDD Parnassiinae.docx：Word文档，多样性依赖多样化分析内容
- Appendix 14 - SSE models.zip：压缩文件，状态依赖物种形成模型数据
- Appendix 15 - MuSSE MCMC difference on speciation rates.pdf：PDF文件，MuSSE模型物种形成速率差异分析结果
- Appendix 17 - BAMM analyses.docx：Word文档，BAMM多样化分析内容
- Appendix 18 - Credible set of speciation shifts in Parnassiinae.pdf：PDF文件，阿波罗蝶类物种形成转变可信集分析结果
- Appendix 20 - CoMET analyses.pdf：PDF文件，CoMET分析结果
- Appendix 22 - Relation butterfly diversification and host-plant diversity.pdf：PDF文件，蝶类多样化与寄主植物多样性关系分析结果
- 脚本文件：
- Scripts for diversification analyses.zip：压缩文件，多样化分析脚本
适用场景
- 进化生物学研究：分析物种多样化动态与生物/环境因素的关联
- 生物地理学研究：探究生物地理事件对物种分化的影响
- 宏观进化模型验证：测试红皇后与弄臣假说在不同类群中的适用性
- 古气候与生物多样性关系研究：分析气候变迁对物种形成与灭绝的作用
- 寄主植物与昆虫协同进化研究：探讨寄主植物关联对物种分化速率的影响
