数据集概述
本数据集为Acropora属中A. cytherea和A. hyacinthus两个珊瑚物种复合体的遗传研究数据,包含12个基因组区域的DNA序列分析结果,覆盖印度洋-太平洋5-7个分布地点,识别出至少6个隐存物种,并分析了物种间基因渐渗历史,共8个文件。
文件详解
- 存档文件(Archive files)
- 文件名称:Palmyra_IMa_input_files.zip、Structure_files_by_location.zip、Pohnpei_IMa_input_files.zip、Phylip_files_by_locus.zip、Australia_IMa_input_files.zip、Palau_IMa_input_files.zip、Samoa_IMa_input_files.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含不同地理位置(Palmyra、Pohnpei、Australia、Palau、Samoa)的IMa输入文件、按位点分类的Phylip文件及按地点分类的Structure分析文件,用于种群遗传结构和基因渐渗分析
- 数据文件(Data files)
- 文件名称:GenBank_accessions.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:记录研究中使用的DNA序列在GenBank数据库中的登录号信息
数据来源
论文“Extensive sympatry, cryptic diversity and introgression throughout the geographic distribution of two coral species complexes”
适用场景
- 珊瑚隐存物种多样性研究: 利用多基因座遗传数据识别Acropora属珊瑚形态种中的隐存物种
- 种群遗传结构分析: 通过Structure文件分析不同地理种群的遗传分化模式
- 基因渐渗历史研究: 使用IMa输入文件探究珊瑚物种间的杂交与基因交流过程
- 生物多样性保护: 基于隐存物种的分布信息优化珊瑚礁保护策略
- 进化生物学研究: 分析珊瑚物种复合体的形成机制与进化关系