数据集概述
本数据集围绕造礁石珊瑚属Acropora的系统进化关系与基因谱系冲突展开，包含基因组层面的系统发育分析数据，以及PaxC内含子、线粒体控制区（mtDNA Control Region）的基因谱系数据，涉及20种Acropora珊瑚，含3个具有春秋产卵群的物种，用于探究生殖隔离的遗传基础及物种形成过程。
文件详解
- 文件名称：PaxC_whole_seqs.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：包含PaxC基因的完整序列数据，以FASTA格式存储，每条序列带有样本标识（如>ASP1-PAX）及核苷酸序列信息。
- 文件名称：CR_whole_seqs.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：包含线粒体控制区（mtDNA Control Region）的完整序列数据，以FASTA格式存储，包含样本标识及核苷酸序列信息。
- 文件名称：Rosser et al_raw DArT-seq.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含原始DArT-seq数据，涉及10034个单核苷酸多态性（SNPs）位点，用于构建全基因组系统发育树，支持Acropora属物种进化关系分析。
数据来源
论文“Phylogenomics provides new insight into evolutionary relationships and genealogical discordance in the reef-building coral genus Acropora”
适用场景
- 珊瑚系统进化研究：利用全基因组SNPs数据构建系统发育树，解析Acropora属物种间的进化关系。
- 基因谱系冲突分析：对比PaxC、mtDNA控制区与全基因组的谱系差异，探究物种形成过程中的基因选择机制。
- 生殖隔离遗传基础研究：分析PaxC基因与Acropora珊瑚春秋产卵时间的关联，揭示生殖隔离的遗传驱动因素。
- 珊瑚基因组多样性分析：基于原始DArT-seq数据，研究Acropora属珊瑚的基因组多态性及种群遗传结构。
