数据集概述
本数据集聚焦鹿角珊瑚(Acropora millepora)昼夜转录组差异,通过比较光照与黑暗条件下的基因表达水平,探究珊瑚与共生甲藻的代谢交互机制及光增强钙化(LEC)的分子基础。包含差异表达基因分析结果、基因计数数据及补充文件,共4份文件。
文件详解
- Day_Vs_Night_EdgeR.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含差异表达基因分析结果,字段有logFC(对数倍变化)、logCPM(对数每百万计数)、LR(似然比)、PValue(P值)、FDR(错误发现率)及基因簇编号
- Combined_Counts.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含珊瑚昼夜样本的基因表达计数数据
- Day_vs_Night_sSeq.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含基于sSeq方法的昼夜差异表达基因分析结果
- supp_file_S9.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:补充文件,内容未详细预览
数据来源
论文“Data from: Transcriptomic differences between day and night in Acropora millepora provide new insights into metabolite exchange and light-enhanced calcification in corals”
适用场景
- 珊瑚共生代谢机制研究:分析昼夜转录组差异,探究珊瑚与共生甲藻的代谢物交换途径
- 光增强钙化分子基础分析:通过基因表达数据解析光照对珊瑚钙化过程的调控机制
- 珊瑚昼夜节律基因筛选:识别昼夜差异表达基因,研究珊瑚生物钟相关分子通路
- 珊瑚对环境变化响应研究:为评估光照变化对珊瑚生理功能的影响提供转录组层面的数据支持