Acropora_millepora_Based珊瑚昼夜转录组代谢交互研究数据

数据集概述

本数据集聚焦鹿角珊瑚(Acropora millepora)昼夜转录组差异,通过比较光照与黑暗条件下的基因表达水平,探究珊瑚与共生甲藻的代谢交互机制及光增强钙化(LEC)的分子基础。包含差异表达基因分析结果、基因计数数据及补充文件,共4份文件。

文件详解

  • Day_Vs_Night_EdgeR.txt
  • 文件格式:TXT
  • 字段映射介绍:包含差异表达基因分析结果,字段有logFC(对数倍变化)、logCPM(对数每百万计数)、LR(似然比)、PValue(P值)、FDR(错误发现率)及基因簇编号
  • Combined_Counts.txt
  • 文件格式:TXT
  • 字段映射介绍:包含珊瑚昼夜样本的基因表达计数数据
  • Day_vs_Night_sSeq.txt
  • 文件格式:TXT
  • 字段映射介绍:包含基于sSeq方法的昼夜差异表达基因分析结果
  • supp_file_S9.xlsx
  • 文件格式:XLSX
  • 字段映射介绍:补充文件,内容未详细预览

数据来源

论文“Data from: Transcriptomic differences between day and night in Acropora millepora provide new insights into metabolite exchange and light-enhanced calcification in corals”

适用场景

  • 珊瑚共生代谢机制研究:分析昼夜转录组差异,探究珊瑚与共生甲藻的代谢物交换途径
  • 光增强钙化分子基础分析:通过基因表达数据解析光照对珊瑚钙化过程的调控机制
  • 珊瑚昼夜节律基因筛选:识别昼夜差异表达基因,研究珊瑚生物钟相关分子通路
  • 珊瑚对环境变化响应研究:为评估光照变化对珊瑚生理功能的影响提供转录组层面的数据支持
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 8.44 MiB
最后更新 2026年1月19日
创建于 2026年1月19日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。